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基于吉布斯采样的TFBS识别算法研究被引量：2: 2007年; 计算机方法识别转录因子结合位点(TFBS,也称“模式”)是目前生物信息学的一个很有吸引性和挑战性的课题。吉布斯采样识别模式的算法本质上是一个启发式搜索方法,容易陷入非全局最优的局部最大值。为此,提出了一种改进的吉布斯采样策略YGMS(Yeast Gibbs Motif Sampler)来识别酿酒酵母共表达基因调控区域转录因子结合位点。在酵母的共调控基因序列的数据集测试中,YGMS比其他几个基于吉布斯采样算法更有效地识别出真实模式序列,在一定程度上提高了算法的性能。; 何彩升戴宪华向倩王江邓泱泱戴智明; 关键词：生物信息学转录因子结合位点

基于对齐的生物序列相似性分析被引量：3: 2005年; 生物序列相似性(或差异性)分析是生物信息学研究的一种重要的方法。其中基于对齐的生物序列相似性分析方法,重点介绍基于隐马尔可夫模型的比较方法,并比较基于对齐的各种生物序列分析方法的优缺点。; 张少宏戴宪华; 关键词：对齐隐马尔可夫模型生物序列分析生物信息学

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国家自然科学基金(60474075)