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上海市地方高校能力建设项目(083905101001)
作品数:
1
被引量:6
H指数:1
相关作者:
李家乐
蒋文枰
汪桂玲
郑润玲
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相关机构:
上海海洋大学
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发文基金:
上海市地方高校能力建设项目
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相关领域:
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郑润玲
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蒋文枰
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李家乐
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1篇
2010
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褶纹冠蚌线粒体基因组全序列分析
被引量:6
2010年
采用LA-PCR(Long amplification polymerase chain reaction)扩增方法首次获得褶纹冠蚌(Cristariaplicata)线粒体基因组全序列。分析表明:序列全长15712bp,包括13个蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和26个长度为2~328bp的非编码区。A、T、C、G碱基组成分别为36.54%、27.22%、23.22%、13.02%。大部分基因在L链编码,其中ND3~ND5、ND4L、COI~COIII、ATP6、ATP8、tRNAAsp和tRNAHis在H链编码。基因排列与同科的射线佩饰真珠蚌(Lampsilis ornata)一致,与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)在COII和12SrRNA之间存在差异。13个蛋白质基因具有I(AUU、AUC)、V(GUG)、M(AUA、AUG)3种起始密码子,除ND2终止密码子为不完整的T,其余基因均为典型的UAA或UAG。22个tRNA中,除tRNAThr、tRNALys、tRNASer(UCN)、tRNAAsp、tRNAArg、tRNATyr和tRNAMet之外,其他15个tRNA都具有典型三叶草结构。与其他淡水双壳贝类一样,褶纹冠蚌具有ATP8基因,该基因可能与细胞质的渗透压平衡有关。
蒋文枰
李家乐
郑润玲
汪桂玲
关键词:
褶纹冠蚌
线粒体基因组
系统进化
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