国家教育部博士点基金(20060285005) 作品数:5 被引量:12 H指数:2 相关作者: 贡成良 曹广力 薛仁宇 朱越雄 虞晓华 更多>> 相关机构: 苏州大学 更多>> 发文基金: 国家教育部博士点基金 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
家蚕质型多角体病毒(苏州株)S10片段的cDNA克隆及序列分析 被引量:4 2009年 为了探讨质型多角体病毒基因的遗传与变异,通过RT-PCR从家蚕(Bombyx mori)质型多角体病毒(Cytoplasmic Polyhedrosis Virus,CPV)苏州株(BmCPV-suzhou)的dsRNA中成功克隆了S10片段。该片段cDNA含有一个744bp的完整开放阅读框(ORF),编码由248个氨基酸残基组成的多角体蛋白,其分子量为28.46kD,等电点为7.12。比较不同宿主来源的CPV多角体蛋白基因氨基酸序列发现,同型CPV多角体蛋白基因高度相似,而不同型的CPV多角体蛋白之间几乎没有同源性;基于质型多角体蛋白基因的核苷酸序列和氨基酸序列的系统进化分析表明,BmCPV的不同株系与舞毒蛾(Lymantria dispar)CPV(LdCPV)和马尾松毛虫(Dendrolimus punctatus)CPV(DpCPV)聚为一类,表明三种CPV的亲缘关系较近。研究结果为深入探讨质型多角体病毒的变异与分子进化提供了新的参考。 马焕艳 孟祥坤 朱越雄 薛仁宇 曹广力 贡成良关键词:家蚕 质型多角体病毒 多角体蛋白 家蚕hsp20.4启动子克隆及其驱动表达产物EGT对家蚕蛹体发育的影响 被引量:4 2009年 为验证家蚕Bombyxmori热休克蛋白基因hsp20.4启动子的活性以及家蚕核多角体病毒egt的表达产物对家蚕发育的影响,本实验通过PCR扩增分别得到hsp20.4启动子片段和egt片段。利用hsp20.4的启动子和红色荧光蛋白报告基因DsRed构建重组载体,在家蚕BmN细胞以及家蚕组织中得到了瞬时表达,表明所克隆的hsp20.4启动子序列具有热休克蛋白基因的启动子活性。又利用hsp20.4启动子和家蚕核多角体病毒的egt构建重组载体,通过注射到蚕蛹中进行瞬时表达,以检测egt表达产物对家蚕发育的影响,经42℃1h热诱导后,hsp20.4启动子控制的egt表达产物可以延迟家蚕发育。 谢敏 贡成良 薛仁宇 盛洁 张晓荣 李艳梅 虞晓华 曹广力关键词:家蚕 家蚕核多角体病毒 EGT 发育 家蚕核型多角体病毒egt基因的分子进化分析 被引量:2 2008年 通过PCR方法获得家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nuclearpolyhedrosis virus,BmNPV)的蜕皮甾体尿苷二磷酸葡萄糖基转移酶基因(egt)片段,序列分析表明该片段带有EGT的完整ORF,推测的多肽可形成EGT结构域的高级结构。为了研究egt的起源,利用家蚕基因组数据库,电子克隆了多个家蚕尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UGT)基因,在此基础上进行了进化分析,表明BmNPV的EGT为antennal-enriched型UGT;推测核型多角体病毒(nucleopolyhedrivirus,NPV)和颗粒体病毒(granulovirus,GV)的egt基因在进化上来源于昆虫的UGT基因,但GV的egt基因在进化上的起源可能要早于NPV的egt基因;可能在昆虫祖先种进化形成不同昆虫目的某一时期,杆状病毒的祖先种从昆虫中获得了antennal-enriched型UGT基因,并进化为egt基因。家蚕的部分UGT基因与转座子元件连锁的基因组结构特点反映了杆状病毒的egt基因可能通过转座子的传递而获得。 曹广力 贡成良 薛仁宇 朱越雄 魏育红关键词:核型多角体病毒 颗粒体病毒 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶 进化起源 家蚕质型多角体病毒(苏州株)基因组片段8 cDNA克隆与分析 2010年 为研究家蚕质型多角体病毒(BmCPV1)的遗传与变异、探讨S8片段的功能,通过RT-PCR克隆BmCPV1苏州株(BmCPV1-SZ)S8的cDNA,并对其核苷酸序列(GenBank登录号:GQ150539)和编码的氨基酸序列进行生物信息学分析。结果显示:S8由1 328 bp构成,具有一个编码390个氨基酸残基的开放阅读框;在BmCPV1-SZ S8的编码氨基酸序列与BmCPV1-I和BmCPV1-H的一致性达93%,但与其他非CPV1型的相似程度较低;在推导的蛋白的氨基酸序列中间区域,具有E-丰富和P-丰富的区域,其局部区域的氨基酸序列与某些蛋白的功能(细胞周期控制、蛋白降解和RNA降解)区域的序列具有一定的相似性;结构域家族分析显示,BmCPV1-SZ S8编码蛋白属GcrA家族,具有与DNA结合的HTH结构域。Blocks分析显示,S8编码蛋白同时具有DNA聚合酶家族、RNA聚合酶2的结构功能域;高级结构分类显示,S8编码蛋白具有与TIM桶酶、肽酶、核苷三磷酸水解酶相似的同源结构。推测该蛋白具有转录调控因子和多功能酶的功能。基于S8编码的氨基酸序列的进化分析显示,相同类型的CPV聚为一类,同一宿主不同类型的CPV相距较远,推测CPV主要根据其类型聚类,而宿主昆虫对聚类的影响相对较小。 张晓荣 孟祥坤 朱越雄 贡成良 薛仁宇 曹广力关键词:家蚕质型多角体病毒 RT-PCR 克隆 生物信息学 家蚕热休克蛋白基因Bmhsp19.9启动子的活性分析 被引量:2 2010年 通过PCR扩增出家蚕(Bombyxmori)热休克蛋白基因Bmhsp19.9启动子的序列,TA克隆后进行序列测定,并构建重组载体进行瞬时表达。结果显示,该基因序列长为1 258 bp,具有典型的热激蛋白启动子的结构特点;序列分析显示,hsp19.9启动子区域可形成潜在的复杂茎环结构,推测其与启动子的功能有关。瞬时表达试验结果显示,hsp19.9的启动子能通过热诱导在家蚕BmN细胞和家蚕组织中驱动红色荧光蛋白报告基因(DsRed)瞬时表达,表明所克隆的hsp19.9启动子序列具有热休克蛋白基因的启动子活性。 王晓娟 谢敏 张星 曹广力 薛仁宇 虞晓华 贡成良关键词:家蚕 启动子