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基质辅助激光解吸附电离飞行时间串联质谱应用于液体培养细菌的鉴定被引量：1: 2010年; 目前,利用质谱直接鉴定细菌的方法基本是应用固体培养基获得的单克隆细菌,该方法耗时较长.因此建立基质辅助激光解吸附电离飞行时间串联质谱直接分析液体培养细菌,通过正交实验,以2,5-二羟基苯甲酸(50mg/mL,50%乙腈-0.1%三氟乙酸)为基质获得最佳质谱图.通过主成分分析能将不同种细菌区别开.在混合培养时,每种细菌的主要特征峰能在混合样品的质谱图中找到,并且该方法灵敏度为1.8×103.结果表明,该方法快速、灵敏,可用于临床样本的快速辅助检测.; 周娜王娜许彬王杰方均建董方霆何昆杨晓虹; 关键词：细菌主成分分析

EPR波谱拟合-傅里叶去卷积距离计算方法被引量：4: 2010年; 在蛋白质结构与功能研究中经常需要测量和计算蛋白质分子功能基团间的距离.电子顺磁共振(Electron Paramagnetic Resonance,EPR)结合定点自旋标记(Site Directed Spin Labeling,SDSL)技术已成为测量蛋白质特殊位点间距离的重要方法.目前在计算距离中广泛使用的傅里叶去卷积距离计算方法(Fourier Deconvolution Distance Measurement,FDDM)在某些特殊实验条件下会产生计算误差较大或需要人为设置一些关键参数,从而影响计算结果的客观性等问题.本文在其基础上提出波谱拟合-傅里叶去卷积距离计算方法(Spectrum Simulation-Fourier Deconvolution Distance Measurement,SS-FDDM),比较了SS-FDDM与FDDM方法计算距离的实用性、抗噪能力和磁场偏移修正能力等.结果表明,SS-FDDM方法能一定程度地克服原方法存在的不足,减少由谱偏移和高噪声带来的误差,使计算结果更加准确客观.利用SS-FDDM方法,对不同浓度的自由基冰冻溶液模型样品进行了实际距离计算,验证了该方法是实际可行的.; 郭林超王长振丛建波先宏吴可; 关键词：蛋白质

电子顺磁共振测量蛋白质分子内选定位点之间距离的方法及应用被引量：1: 2010年; 蛋白质分子的结构决定了其特性和功能,准确测量蛋白质分子中特殊位点之间的距离对其结构解析至关重要。该文在简要介绍电子顺磁共振(electron paramagnetic resonance,EPR)方法测量蛋白质分子内未偶自旋之间距离基本原理的基础上,重点综述了近年来EPR结合定点自旋标记(site-directed spin label,SDSL)技术在研究蛋白质结构与功能方面的应用情况,归纳了EPR-SDSL方法测量距离的特点和存在问题,并提出了改进用连续波EPR技术测量距离的准确度的思路和实现方法。; 吴可; 关键词：电子顺磁共振蛋白质结构

应用SDSL-EPR技术研究溶液中牛血清白蛋白的运动性及构象变化被引量：2: 2010年; 应用位置定向自旋标记-电子顺磁共振(SDSL-EPR)技术研究牛血清白蛋白(BSA)的运动性、构象特征及其加入芹菜素(Apigenin)后的变化.采用MTSL对BSA的第34位半胱氨酸(Cys)进行标记;通过EPR检测计算旋转相关时间τc及强弱固定化之比S/W研究运动性的变化;通过功率饱和实验检测该位点的易趋性,研究构象特点及其变化.在BSA溶液中加入Apigenin后,τc及S/W值明显降低,说明其Cys位点运动性变快;易趋性检测结果显示,34位Cys位点位于蛋白质表面,加入Apigenin后,该位点构象发生改变,且微环境由亲水性变为疏水性.实验揭示BSA同Apigenin能够相互结合,且引起BSA自由Cys位点的运动性和构象的改变.; 王长振周宇丛建波先宏郭林超杨俊涛唐丽陈鹏宁静胡向军陈章宝吴可; 关键词：电子顺磁共振牛血清白蛋白芹菜素运动性构象

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国家创新方法工作专项(2008IM022000)