陕西省自然科学基金(2006C115)
- 作品数：3 被引量：27H指数：3
- 相关作者：刘占林杨雪周天华赵桂仿田鹏更多>>
- 相关机构：西北大学更多>>
- 发文基金：陕西省自然科学基金国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于多基因序列的巴山松系统学位置研究
- 巴山松(Pinus henryi Mast.)是我国秦巴山区特有的亚热带针叶树种,现已成为稀有物种,然而其系统位置一直受到争议。本研究共筛选了7个叶绿体基因(marK,rbcL, rpl20-rps18,trnV,rpo...
- 张浩刘占林
- 文献传递
- 近缘物种的遗传多样性及其亲缘关系的取样策略研究被引量：10
- 2007年
- 取样策略的问题目前大多停留于对单一物种的种质资源研究.然而,对野生近缘植物取样策略的研究,不仅有利于准确快捷地阐明物种间的系统发育关系,而且对于了解遗传多样性分布状况,制定野外考察、材料收集取样及保护策略均有重要的理论指导意义.以巴山松及其近缘种为例,利用cpSSR(叶绿体微卫星)和AFLP2种分子标记对其取样策略和统计方法进行分析,揭示居群取样个体数和基因位点数与遗传多样性的关系以及基因(引物)和系统树构建方法对亲缘关系确定的影响.研究表明:(1)居群取样个体数和基因位点数差异对遗传多样性影响并不显著,但当居群取样个体数为30个左右,单引物基因位点数为60个以上,总位点数为480个以上时,所得遗传多样性及亲缘关系较为准确可靠.(2)较多数目的基因(引物)对于得到较为准确可靠的亲缘关系分析是十分必要的.(3)系统树构建方法对近缘种亲缘关系的确定有一定的影响.
- 杨雪赵桂仿周天华刘占林
- 关键词：亲缘关系
- 分子系统发育树构建的简易方法被引量：6
- 2009年
- 以系统发育树构建的原有距离方法为基础,吸取了NJ法和FM法中的部分理论,提出了以节点引入为手段的新的简易方法,通过该方法构建了分子系统发育树,结果表明这种方法更加快捷,而且所得结果与FM法完全一致。
- 田鹏刘占林
- 关键词：系统发育树FM法
- 5种松树的遗传多样性和遗传分化研究被引量：13
- 2007年
- 利用cpSSR和AFLP标记,比较了巴山松、黄山松、油松、马尾松以及云南松的遗传多样性与遗传分化结果.发现5种松树都表现出较高水平的遗传多样性与种间分化,但cpSSR比AFLP标记提供了更多的种内种间分化,而展示的遗传多样性相对要少.在对不同方法指标的对比研究后,认为将cpSSR的单倍体关系考虑在内,能够更有效地分析植物居群遗传分化造成的地理结构.对于显性标记AFLP,传统的平方根法会低估遗传参数,而Lynch和Milligen的方法因样本量的限制也可能高估遗传多样性,Bayesian法被认为是最精确的方法,提供了与分子方差分析(AMOVA)近似的遗传分化值.
- 刘占林杨雪
- 关键词：CPSSRAFLP遗传分化松属
