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应用离散增量方法识别人类MicroRNAs前体序列被引量：1: 2010年; MicroRNAs(miRNAs)是一类约为21-26个碱基长度的非编码单链RNA.根据Mi-croRNAs前体序列(pre-miRNAs)的碱基保守特征和二级结构特征,应用多样性增量方法(ID方法)和支持向量机(SVM)分析,以内含子区(intron)、外显子区(exon)、基因间区(intergenic)三类序列分别作为负集,对人类的pre-miRNAs进行分析和预测.当以intergenic区和intron区序列为训练负集时,其以二级结构三联体、四联体和五联体(3-mer、4-mer、5-mer)为特征参量的敏感性、特异性、整体精度都在89%以上,相关系数在0.7以上.; 高智红张利绒罗辽复

λ噬菌体操纵基因和调控蛋白相互作用网络及溶原态/裂解态转变特性的动力学研究: 2007年; 根据大肠杆菌中λ噬菌体操纵基因与调控蛋白相互作用特点,提出操纵基因与调控蛋白相互作用模型.利用动力学方法,得到了两种调控蛋白浓度随时间变化的关系和在一定的时间范围内两种调控蛋白之间的关系,并且得到调控系统的稳态性质,进而分析调控系统溶原态/裂解态的转变特性.; 丁辉罗辽复; 关键词：Λ噬菌体操纵基因调节蛋白

基因组信息、密码进化、折叠动力学和熵产生——理论生物学的几个基本问题: 2010年; 以信息为主线论述了生命科学的理性化途径,着重总结了作者及其研究小组在理论生物学领域的工作,包括基因组序列识别码的形成和构建,基因组的进化方向和最大信息原理,遗传密码的适应性进化,基于量子跃迁的蛋白质折叠动力学,细胞开关相变和熵产生.; 罗辽复; 关键词：基因组信息折叠动力学熵产生

Discrimination of intra/extracellular sidedness segments of transmembrane proteins: ＜正＞Topology of the transmembrane protein is closely related to its functions.So,it is desiderated to depict th...; Wei Chen,Liao-fu Luo School of Physical Science and Technology,Inner Mongolia University,Hohhot 010021,China; 关键词：TOPOLOGY; 文献传递

使用多样性增量预测磷酸化位点被引量：11: 2008年; 磷酸化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法对CK2,PKA和PKC三种类型磷酸化位点进行预测,k-fold交叉检验的正确率分别为86%,90%和85%,独立测试集检验的正确率分别为86%,88%和84%.所得结果高于包括支持向量机在内的现有预测方法.; 张颖罗辽复吕军; 关键词：二次判别分析

信息生物学——关于编码信息量的两个假设(英文)被引量：2: 2006年; 提出并论证了关于编码信息量的两个规律.第一,基因组的编码信息量在进化中随时间增加.第二,基因序列的碱基频数分布决定于多样性的稳定化.此二规律和其他规律一起构成了信息生物学的理论基础.不同于生物信息学,信息生物学将以生命信息的遗传,传输,调节和表达的基本规律为研究中心.; 罗辽复; 关键词：信息生物学

肠道病毒71型基因组中小干扰RNA的靶位点预测被引量：1: 2009年; 肠道病毒71型(EV71)已经在世界范围内有过十多次大的爆发与流行,近年来EV71病毒的流行在亚洲逐渐呈上升的趋势,但是目前尚无有效的治疗措施,因此迫切需要一种治疗EV71的有效药物。本文采用生物信息学的方法,对人类EV71病毒三个不同株型(SHZH03,SHZH98和MS)RNA序列的局域二级结构进行了预测,并从这些病毒株的基因组中分别得到了长度在21～25nt的小干扰RNA靶序列碱基片段。这一结果将有助于治疗EV71药物的开发研究,对预防和控制EV71的爆发和流行也会有重要意义。; 陈伟罗辽复; 关键词：RNA干扰靶位点

基因组信息、密码进化、折叠动力学和熵产生——理论生物学的几个基本问题被引量：5: 2010年; 数千个基因组的测序完成，海量资料数据呼唤着生命科学的理性和实证性更完美地结合。基因组信息学是理论生物学的龙头。本文遵循生命信息运行的密码—序列—结构—功能的主线，论述了生命科学的理性化途径，讨论了若干基因组生物学的基本问题。着重总结了理论生物学领域的部分工作，包括：① 基因组序列识别码的形成和构建，一组描述碱基分布和碱基关联的统计量集合可作为基因组的识别码；② 基因组的进化方向和最大信息原理，提出基因组序列的编码信息量在进化中随时间增长的规律，指出DNA序列局部片段遵循最大信息原理；③ 遗传密码的适应性进化，证明普适标准密码表是突变危险性的适应性极小码，论证了遗传密码既具有稳定性，又具有可进化性；④ 基于量子跃迁的蛋白质折叠动力学，用量子跃迁的观点和理论研究如何处理从序列到结构，导出蛋白质折叠速率公式，解释了现有各种速率实验；⑤ 细胞开关相变和熵产生，研究了最简单生命噬菌体的溶原态/裂解态转变动力学，得到了此类细胞开关中熵产生的特异性规律。; 罗辽复; 关键词：基因组信息遗传密码蛋白质折叠熵产生

高压芒刺静电场对大肠杆菌K12诱变效应初步研究: 研究了高压芒刺静电场对大肠杆菌的诱变效应.用场强为1,2,3,4 kV/cm的高压芒刺静电场对大肠杆菌K12 W3110菌种进行处理,其存活率最低为7.2%,存活效应曲线表明,高压芒刺静电场对大肠杆菌有低剂量辐射超敏感性...; 宋智青罗辽复梁运章; 关键词：高压芒刺静电场诱变效应; 文献传递

表观遗传因素在RNA剪接过程中的作用: 2011年; RNA剪接是真核生物基因表达过程中的重要环节,增加了蛋白质的多样性和基因表达的可调节性.日益增多的研究表明,RNA剪接并不是独立的生物过程.RNAⅡ型聚合酶(RNApolymerase-Ⅱ,RNA PolⅡ)、核小体定位和组蛋白修饰等因素都与RNA剪接过程密切相关.阐明RNA PolⅡ、核小体定位和组蛋白修饰等因素在RNA剪接过程中的作用,将为剪接位点的准确识别和剪接调控机制的研究提供新思路.本文综述了RNA PolⅡ、核小体定位和组蛋白修饰等因素对RNA剪接的影响以及它们在RNA剪接过程中的调控作用.; 陈伟罗辽复; 关键词：核小体定位组蛋白修饰 RNA剪接

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