国家高技术研究发展计划(2011AA100202)
- 作品数：11 被引量：48H指数：4
- 相关作者：张党权谢耀坚刘果罗建中谷振军更多>>
- 相关机构：国家林业局中南林业科技大学中国林业科学研究院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家林业公益性行业科研专项湖南省科技厅重点项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 39种桉树微卫星序列的遗传多样性分析被引量：2
- 2017年
- 为进一步研究桉树微卫星跨种的相似性及长度多态性,从基因组DNA遗传变异的角度探讨各个桉树种间的遗传多态性程度,本研究选用2个扩增结果稳定,微卫星完整的SSR位点进行PCR产物直接测序,从DNA序列的层次上对39种桉树进行遗传多样性分析和微卫星多态性分析。从SSR位点的层次上进行遗传多样性分析发现,2个SSR位点Nei's遗传多样性指数Hs平均为0.576,期望杂合度He平均为0.736,多态信息含量PIC平均为0.694,位点e SSR-GR124遗传多样性较高,位点g SSR-CA013序列相对更为保守。基于微卫星序列和侧翼保守序列的比对分析,微卫星重复次数的变化可能与属内各亚属间的分类相关性较大,微卫星序列的碱基替换可能与属间分类的相关性更大。由2个位点的综合序列进行相似性比较和系统发育树分析发现,位点e SSR-GR124和位点g SSR-CA013能够作为伞房属和桉属属间分类鉴定的依据。
- 刘果张党权谢耀坚陈鸿鹏罗建中吴志华
- 关键词：桉树SSR分子标记微卫星多态性亲缘关系
- 巨桉抗枝瘿姬小蜂与SSR关联的初步研究被引量：2
- 2012年
- 利用35个SSR标记,分析了巨桉(Eucalyptus grandis)4个种源的遗传变异,鉴定了与枝瘿姬小蜂(Leptocybeinvasa)抗性相关的SSR位点。共检测到469个等位片段,平均每位点的等位片段数(NA)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态性信息量(PIC)分别为13.3、0.5385、0.8101和0.7797,供试群体的遗传多样性较高;分子方差分析(AMOVA)表明,种源内个体间变异占96.0%,种源间变异占4.0%,这与群体间较低的分化系数(Fst=0.0623)和较高的基因流(Nm=4.09～14.13)一致。聚类分析表明,种源14393与种源15358的亲缘关系最近(Fst=0.017),种源14393与种源20261最远(Fst=0.058)。关联分析检测到EST-SSR226与枝瘿姬小蜂抗性显著相关(P=0.03),对抗性的决定系数达0.4436,增效效应为0.71,增效比例42.8%。
- 张苗苗莫晓勇黄焕华黄咏槐甘四明
- 关键词：巨桉SSR
- 不同预处理方法对柠檬桉染色体制片技术的影响被引量：3
- 2015年
- 以柠檬桉种子的根尖为研究材料,通过比较了3种浓度的秋水仙素、2 mmol·L^(-1)的8-羟基喹啉、冰水混合物及以不同比例冰水混合物和0.1%的秋水仙素的混合液等预处理,在多个时间梯度对柠檬桉根尖染色体制片的影响进行了研究,结果发现:3种浓度秋水仙素预处理中,0.1%秋水仙素预处理1.5 h的染色体浓缩适中,分散性好,有较多的分裂相;2 mmol·L^(-1)的8-羟基喹啉预处理的染色体均分散性较差,且分裂相较少;冰水混合物预处理12h的染色体浓缩适中且分裂相较多,分散程度较好。其余处理时间的染色体浓缩程度不理想,不易进行染色体分析;混合液中2:3比例下的染色体分散性较好,且浓缩程度适中,有较多的分裂相,综合比较结果由优到劣的处理方法为:0.1%秋水仙素预处理1.5 h>2:3混合液>冰水混合物处理12 h>2 mmol·L^(-1)的8-羟基喹啉,其中在上午11:30—12:30取材,0.1%的秋水仙素处理根尖1.5 h,效果最佳。
- 刘思汝林彦罗建中
- 关键词：柠檬桉预处理染色体
- 雷蒙德氏棉HSP70基因家族的进化分析及其同源基因在陆地棉中的表达分析被引量：8
- 2014年
- 热激蛋白70家族(HSP70)是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白,在细胞中协助蛋白质正确折叠。文章利用隐马可链夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)全基因组范围内进行HSP70基因家族成员进化分析,共得到30个HSP70家族成员。利用生物信息学对雷蒙德氏棉HSP70基因的结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析,结果表明,HSP70基因家族根据亚细胞定位结果可分为不同的基因亚家族,各亚家族中HSP70基因具有相对保守的基因结构;染色体片段重复和串联重复是雷蒙德氏棉HSP70基因家族扩增的主要方式。通过对不同物种的HSP70基因家族进行系统进化分析可知,HSP70亚组的分化发生在单细胞植物形成前,且细胞质型HSP70成员大量扩增。比较陆地棉棉纤维发育不同时期的深度测序表达谱,发现HSP70基因可能参与棉纤维的生长发育。本研究结果有助于了解棉属植物HSP70基因家族的功能,以期为深入研究棉纤维发育过程中的分子调控机理提供基础。
- 张毓婷王敏华陈家栋戎均康丁明全
- 关键词：棉纤维基因结构系统进化分析
- 柠檬桉群体遗传多样性和遗传结构的SSR分析被引量：3
- 2016年
- 本研究对柠檬桉的遗传多样性和遗传结构进行分析,揭示柠檬桉的遗传多样性水平和群体分化程度,为以后柠檬桉群体资源的保存和育种潜力评估提供理论指导。利用13对SSR引物对5个柠檬桉群体进行PCR检测,分析柠檬桉的遗传多样性和遗传结构。结果表明:13对SSR引物在5个柠檬桉群体97个单株中共检测到114个等位片段,平均每对引物所检测到的等位片段为9个。群体位点平均等位片段数为5.600,Shannon's指数(I)平均值为1.123,平均期望杂合度(HE)与平均观测杂合度(HO)均为0.520,位点多态性较高。群体多样性水平都较高,其中N群体的多样性水平最高,而S群体的多样性水平最低。群体间分化水平中等,13个中性位点平均Fst为0.089,分子方差分析中群体间方差分量仅占6.9%,表明柠檬桉遗传变异主要存在于群体内。聚类结果表明W、Q和N三个群体各为一类,S和G群体的遗传距离最近(0.101 2)。柠檬桉属于遗传多样性丰富,育种利用的潜力大,种质资源管理应重视多样性较高和特有等位片段较多的群体,遗传分化中等。
- 刘思汝林彦刘晓华罗建中
- 关键词：柠檬桉SSR标记
- 基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛选方法研究被引量：7
- 2012年
- 林木SSR标记的引物筛选工作量大,十分费时且消耗大量实验材料。采用基因组DNA混合池技术,将研究对象的若干个基因组DNA样品等量混合后,作为单一模板进行SSR的PCR扩增,能显著降低实验的工作量和成本。以选择的150对EST-SSR引物为对象,对6个桉树基因组DNA样品进行等量混合,进行PCR扩增筛选引物,结果表明,与常规筛选方法相比,基因组DNA混合池方法大幅度缩短了实验周期,显著减少了基因组DNA的消耗,可用于大量林木SSR引物的快速高效筛选。
- 刘果谢耀坚张党权谷振军
- 关键词：引物筛选
- 一种84K杨再生体系的建立被引量：3
- 2013年
- 将脱分化与再分化过程分开,探讨不同培养基和激素配比对黑暗条件下84K杨叶片及茎段外植体产生愈伤组织及愈伤组织诱导出芽的影响。结果表明,84K杨叶片产生愈伤组织的高效培养基为MS+KT 0.5 mg/L+2,4-D 0.2 mg/L;茎段为WPM+KT0.5 mg/L+2,4-D 0.1 mg/L。愈伤组织诱导出芽的高效培养基为WPM+TDZ 0.05 mg/L+6-BA 0.5 mg/L。为下一步获得高效的84K杨转基因体系提供一个高效受体系统。
- 周熙莹肖龙敏张倩张永波马晓荣程玉祥
- 关键词：愈伤组织不定芽诱导
- 桉树Genomic-SSR和EST-SSR引物的快速筛选与通用性研究被引量：12
- 2013年
- 桉树是桃金娘科（Myrtaceae）桉属（Eucalyptus）、杯果木属（Angophora）和伞房属（Corymbia）3个属的树种总称,约有945种。桉树具有生长迅速、轮伐期短、耐干旱、耐贫瘠、适应性广等优良特性,且用途广、经济效益高,因此,桉树现已被世界近百个国家与地区引种,遍布于地中海地区、东南亚、美洲和非洲,目前已经成为世界第二大类造林树种（陈少雄等,2008;欧阳乐军等,2008;祈述雄,2006）。
- 刘果张党权谢耀坚谷振军章怀云
- 关键词：SSR标记桉树引物筛选
- 东北白桦COMT1基因克隆及其植物表达载体构建被引量：1
- 2013年
- 采用同源克隆法结合cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆东北白桦(Betula platyphylla)咖啡酸/5-羟基阿魏酸-O-甲基转移酶(COMT)基因COMT1,测序结果显示东北白桦COMT1 cDNA序列全长1 367 bp(GenBank登录号:KC292201),其中完整编码区长度1 095 bp,编码365个氨基酸。利用Gateway技术分别构建了东北白桦COMT1植物过量表达和反义表达载体。
- 吕梦燕王崇奈婕菲程玉祥
- 关键词：咖啡酸
