山东省农业良种工程项目(2006LZ01-02)
- 作品数：2 被引量：40H指数：2
- 相关作者：柳展基毕玉平单雷邵凤霞唐桂英更多>>
- 相关机构：山东省农业科学院更多>>
- 发文基金：山东省农业良种工程项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 花生EST资源的SSR信息分析被引量：18
- 2008年
- 微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)存在于表达序列标签(expressedsequence tags,ESTs)中。为了在花生中开发EST-SSR功能性标记,利用生物信息学对NCBI公共数据库中的41501条花生ESTs序列进行EST-SSRs特征分析。剔除冗余序列,得到全长为5125.94kb的无冗余EST8391条。在这些序列中搜索出1109个SSR,分布于946条EST中,出现频率是11.27%。这些EST-SSR的平均长度为18.16bp,平均分布频率1/4.62kb。在1～6bp的重复基元中,三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高(49.23%),其次是二核苷酸(32.83%)、单核苷酸(14.88%)。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复基元,分别占二、三核苷酸重复的71.43%和31.50%。本研究为开发多态性花生微卫星标记提供了候选序列。
- 柳展基孙萍步迅
- 关键词：花生ESTSSR
- 一个新的玉米NAC类基因(ZmNAC1)的克隆与分析被引量：22
- 2009年
- NAC转录因子是近十年来新发现的具有多种生物功能的植物特异转录因子,在植物生长发育、激素调节和抵抗逆境等方面发挥着重要的作用。本研究利用电子克隆方法,结合RT-PCR分析,从玉米中克隆了一个与NAC类基因同源的cDNA序列,命名为ZmNAC1(GenBank登录号:EU224278),该序列长度为1029bp,具有单一的完整开放阅读框架(ORF,26～907bp),推测编码蛋白含有293个氨基酸,分子量为32.3kDa,等电点为8.65。半定量RT-PCR分析表明,ZmNAC1可以被低温、聚乙二醇(Polyethylene glycol,PEG)、高盐和ABA诱导。这些结果表明,ZmNAC1可能参与植物逆境反应。本研究是有关玉米NAC转录因子基因的首次报道。
- 柳展基邵凤霞唐桂英单雷毕玉平
- 关键词：玉米NAC转录因子逆境
