在水稻品种南粳41中发现了一个黄绿叶自然突变体,经过多代连续自交形成了稳定的突变系,命名为ygl11（t）,ygl11（t）整个生育期叶片都表现为黄绿色。对苗期、分蘖盛期、齐穗期突变体和野生型的叶绿素含量进行测定,ygl11（t）的叶绿素含量是野生型的45.7%~74.7%,叶绿素a含量是野生型的55.2%~87.5%,叶绿素b含量是野生型的12.5%~25.3%,ygl11（t）的类胡萝卜素的含量是野生型的62.3%~97.0%。ygl11（t）在分蘖盛期的净光合速率显著高于野生型,花后10d,ygl11（t）的净光合速率比野生型略低。对突变体叶片中叶绿体的超微结构进行观察,发现突变体叶绿体内的类囊体基粒片层数目减少且严重扭曲变形。遗传分析表明,ygl11（t）叶色性状受1对隐性核基因控制。利用SSR分子标记将YGL11（t）初步定位在水稻第10染色体的长臂上,进一步利用新开发的InDel和CAPS标记将YGL11（t）定位在58.1kb的物理距离内。对该区段内存在的开放阅读框进行序列分析,发现突变体ygl11（t）中编码叶绿素a氧化酶（chlorophyll a oxygenase 1）基因（OsCAO 1）的第9个外显子存在2个碱基缺失,从而导致提前出现终止密码子,初步分析OsCAO1即为YGL11（t）的候选基因。
