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国家自然科学基金(60471054)

作品数:3 被引量:4H指数:1
相关作者:马尽文邓明华更多>>
相关机构:北京大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:化学工程医药卫生理学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 1篇化学工程
  • 1篇医药卫生
  • 1篇理学

主题

  • 1篇信息处理
  • 1篇英文
  • 1篇生命
  • 1篇生命现象
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息技术
  • 1篇生物医学
  • 1篇微阵列
  • 1篇微阵列技术
  • 1篇基因
  • 1篇基因表达
  • 1篇基因表达水平
  • 1篇建模方式
  • 1篇SVM
  • 1篇APPROA...
  • 1篇DNA微阵列
  • 1篇DNA微阵列...
  • 1篇INFORM...
  • 1篇惩罚

机构

  • 2篇北京大学

作者

  • 2篇马尽文
  • 1篇邓明华

传媒

  • 1篇物理
  • 1篇工程数学学报
  • 1篇Genomi...

年份

  • 1篇2008
  • 1篇2007
  • 1篇2005
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
A DSRPCL-SVM Approach to Informative Gene Analysis被引量:2
2008年
Microarray data based tumor diagnosis is a very interesting topic in bioinformatics. One of the key problems is the discovery and analysis of informative genes of a tumor. Although there are many elaborate approaches to this problem, it is still difficult to select a reasonable set of informative genes for tumor diagnosis only with microarray data. In this paper, we classify the genes expressed through microarray data into a number of clusters via the distance sensitive rival penalized competitive learning (DSRPCL) algorithm and then detect the informative gene cluster or set with the help of support vector machine (SVM). Moreover, the critical or powerful informative genes can be found through further classifications and detections on the obtained informative gene clusters. It is well demonstrated by experiments on the colon, leukemia, and breast cancer datasets that our proposed DSRPCL-SVM approach leads to a reasonable selection of informative genes for tumor diagnosis.
Wei Xiong Zhibin Cai Jinwen Ma
第五讲 生物医学信息处理——DNA微阵列数据在医学中的应用被引量:1
2005年
飞速发展的生物信息技术为现代医学提供了更为有效的工具.特别是随着人类基因组计划的基本完成和逐步细化,人们已经试图从基因水平上来认识生命现象,特别是一些重要疾病的机理.由于生物特性一般都涉及到多个基因的共同表达,这便出现了同时衡量成千上万个基因的表现水平的所谓DNA微阵列技术与数据.DNA微阵列数据也被称为大规模基因表达谱.根据这些微阵列数据,人们不仅能够对一些疾病进行分析,并且还能够发现一些新的生物特性与规律.另外,利用微阵列数据能够选取出疾病的相关基因并进行疾病的分类与诊断.这项研究无疑将推动医学的发展.最近,人们还进一步通过基因表达水平值来发现基因之间的调控方式,这将为疾病病理的研究与治疗提供更科学的依据.
马尽文邓明华
关键词:信息处理生物医学DNA微阵列技术生物信息技术基因表达水平生命现象
有限混合体模型上的自动模型选择:一种崭新的数据建模方式(英文)被引量:1
2007年
在数据建模和分析中,有限混合体模型被广泛地使用着。然而,如何仅仅针对一组来自于某个有限混合体模型的数据选择出分量或聚类的个数则依然是一个非常困难的问题。由于分量个数是混合体模型的规模度量,其选择问题被称为有限混合体的模型选择问题。最近,针对有限混合体模型,特别是高斯混合模型,一种自动模型选择学习机制逐步发展成熟起来。这种新的机制能够在学习参数的过程中自动地完成模型选择,为数据的建模与分析提供了一种新的思路与途径。本文将对于高斯混合模型或一般有限混合体模型的自动模型选择学习算法及其典型应用进行综述与总结。首先,我们综述了基于贝叶斯阴阳机和谐学习原则的自动模型选择学习算法。然后,我们描述了另一种基于熵惩罚的自动模型选择学习算法。最后,我们给出了自动模型选择学习算法的一些典型的应用。
马尽文
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