国家高技术研究发展计划(无)
- 作品数：4 被引量：22H指数：2
- 相关作者：郭宝英吴常文李继姬周超吕振明更多>>
- 相关机构：浙江海洋学院更多>>
- 发文基金：国家海洋公益性行业科研专项国家高技术研究发展计划浙浙江省大学生科技创新项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于线粒体DNA 12S rRNA和COⅢ基因序列研究中国沿海7个长蛸(Octopus variabilis)野生群体的遗传多样性被引量：13
- 2011年
- 基于线粒体DNA的12S rRNA和COⅢ基因序列对我国沿海重要经济头足类长蛸不同群体(大连、烟台、青岛、连云港、舟山、温州、厦门)进行了遗传多样性和遗传结构的分析。由PCR扩增获得80个个体的12SrRNA基因416bp、COⅢ基因512bp的部分序列,两者多态性遗传参数统计显示,80个个体分别检出64(12S)和27(COⅢ)个单倍型,总群体单倍型多样性指数(Hd)分别为0.984(12S)和0.909(COⅢ),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.028(12S)和0.034(COⅢ),平均核苷酸差异数(K)分别为9.403(12S)和17.265(COⅢ),显示出较丰富的遗传多样性。两种基因遗传分析结果均显示厦门群体与其它群体的显著分化。初步分析长蛸各群体遗传分化的原因之一可能是洋流格局的形成阻隔了群体间的基因交流。
- 徐梅英李继姬郭宝英吕振明周超吴常文
- 关键词：长蛸分子标记技术
- 曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)β-肌动蛋白基因的cDNA全长克隆与序列分析被引量：2
- 2011年
- 采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术首次克隆了曼氏无针乌贼β-肌动蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为2000bp,由长197bp的5’非翻译区(untranslated region,UTR),669bp的3’非翻译区,和1134bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)组成。阅读框共编码377个氨基酸,推算的分子量约为42.0kDa,理论等电点为5.16。曼氏无针乌贼β-actin氨基酸序列中Ile12、Ser172、Ser174、Gln223、His227、Ile231、Gly232、Ser320、Glu328、Thr360等10个氨基酸残基具有特异性,以及2个特殊的氨基酸残基位点和2个软体动物特有的氨基酸残基。曼氏无针乌贼β-actin氨基酸序列与软体动物、节肢动物、脊椎动物的相似性高达97%。NJ法系统进化分析显示曼氏无针乌贼首先与软体动物聚在一起,然后与节肢动物聚在一起,再与鱼类、两栖类、哺乳类聚在一起。
- 李继姬郭宝英吴常文
- 关键词：曼氏无针乌贼CDNA
- 曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)ISSR体系优化及养殖群体遗传多样性分析被引量：2
- 2011年
- 采用ISSR-PCR技术对曼氏无针乌贼基因组DNA进行扩增,筛选分析了ISSR-PCR扩增时的主要影响因子,包括Mg2+浓度、引物浓度、dNTPs浓度、Taq酶浓度以及退火温度,并用8条ISSR引物对舟山养殖群体进行了遗传多样性分析,最终确立的适用于曼氏无针乌贼ISSR扩增的25?l反应体系为:Mg2+1.5mmol/L,TaqDNA聚合酶1.0U,引物0.15?mol/L,dNTPs2.0mmol/L,退火温度为52.2℃。结果表明,扩增得到70个清晰的扩增位点,其中多态性位点60个,多态位点率为85.71%,Nei's基因多样性为0.3105±0.1760,Shannon's多样性指数为0.4610±0.2397。本研究结果表明,舟山曼氏无针乌贼养殖群体遗传多样性较丰富,因此舟山曼氏无针乌贼养殖群体可能有比较高的适应生存的能力,蕴藏着比较大的进化潜能及比较丰富的育种潜力。
- 徐梅英叶莹莹郭宝英祁鹏志吴常文
- 关键词：曼氏无针乌贼ISSR
- 长蛸(Octopus variabilis)不同地理群体遗传多样性的ISSR分析被引量：6
- 2011年
- 利用ISSR分子标记技术获得长蛸的ISSR-PCR最优反应体系,并对大连、烟台、青岛、连云港、舟山、温州、厦门7个群体168个个体进行遗传多样性分析。结果表明,7个引物在7个群体中共扩增出118条重复性好且带型清晰的ISSR扩增带,其中多态条带为55条,多态性比例达46.61%。在物种水平上的Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数分别为0.3145和0.4766,在群体水平上分别为0.1573和0.2355。7个群体可明显聚类为2个类群,AMOVA分子变异分析发现,长蛸54.64541%的变异发生在群体间,45.35459%的变异发生在群体内。群体间的遗传分化系数Gst为0.5067和由Gst估算的基因流Nm为0.4867<1。分析显示长蛸具有较高遗传多样性水平,但群体间已经出现了较大程度的遗传分化。
- 郭宝英周超吕振明李继姬吴常文
- 关键词：长蛸ISSR
