您的位置: 专家智库 > >

国家自然科学基金(30970358)

作品数:4 被引量:47H指数:3
相关作者:余育和倪加加陈宇航李学梅董小林更多>>
相关机构:中国科学院中国科学院大学中国科学院研究生院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 3篇微生物
  • 3篇微生物群落
  • 2篇变性梯度凝胶...
  • 1篇异育
  • 1篇异育银鲫
  • 1篇银鲫
  • 1篇幼鱼
  • 1篇指纹
  • 1篇指纹分析
  • 1篇室内饲养
  • 1篇群落
  • 1篇群落动态
  • 1篇微生物群落结...
  • 1篇消化道微生物
  • 1篇可靠性指数
  • 1篇PCR-DG...
  • 1篇TWO
  • 1篇COMPAR...
  • 1篇DGGE
  • 1篇DNA回收

机构

  • 3篇中国科学院
  • 2篇中国科学院大...
  • 1篇中国科学院研...

作者

  • 3篇余育和
  • 2篇倪加加
  • 1篇颜庆云
  • 1篇解绶启
  • 1篇董小林
  • 1篇李学梅
  • 1篇陈宇航

传媒

  • 2篇水生生物学报
  • 1篇水产学报
  • 1篇Chines...

年份

  • 1篇2014
  • 1篇2013
  • 1篇2012
  • 1篇2011
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
Comparison of intestinal bacterial communities in grass carp,Ctenopharyngodon idellus,from two different habitats被引量:16
2012年
The intestinal bacteria of vertebrates form a close relationship with their host.External and internal conditions of the host,including its habitat,affect the intestinal bacterial community.Similarly,the intestinal bacterial community can,in turn,influence the host,particularly with respect to disease resistance.We compared the intestinal bacterial communities of grass carp that were collected from farm-ponds or a lake.We conducted denaturing gradient gel electrophoresis of amplified 16S rRNA genes,from which 66 different operational taxonomic units were identified.Using both the unweighted pair-group method with arithmetic means clustering and principal component analysis ordination,we found that the intestinal bacterial communities from the two groups of pond fish were clustered together and inset into the clusters of wild fish,except for DF-7,and there was no significant correlation between genetic diversity of grass carp and their intestinal bacterial communities(Mantel one-tailed test,R=0.157,P=0.175).Cetobacterium appeared more frequently in the intestine of grass carp collected from pond.A more thorough understanding of the role played by intestinal microbiota on fish health would be of considerable benefit to the aquaculture industry.
倪加加余育和张堂林高雷
关键词:HABITAT
三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析被引量:28
2011年
以室内饲养的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)、银鲫和异育银鲫(中科三号)(Carassius auratus gibelio)幼鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术对其肠道微生物群落进行了探索研究。在三种鱼的肠道中检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中斑点叉尾的平均谱带数(7.5)相对于银鲫和异育银鲫的谱带数(分别为15和14)要少。基于PCR-DGGE指纹谱带及各谱带相对丰度的UPGMA聚类和MDS排序结果显示银鲫和异育银鲫肠道微生物相似性高,而与斑点叉尾的差异比较大;rank-abundance散点图及回归分析也显示斑点叉尾与银鲫、异育银鲫肠道微生物群落存在显著差异(P<0.05),而银鲫和异育银鲫之间无显著差异(P=0.383)。在斑点叉尾肠道中检测到的菌群主要是变形杆菌,包括γ-变形杆菌和α-变形杆菌;而银鲫和异育银鲫肠道中菌群主要包括梭杆菌属中的类群,还包括变形杆菌门中的气单胞菌属,以及一些未知的类群。以上结果均表明在所研究的三种鱼的幼鱼阶段,其肠道微生物组成在不同种类鱼中存在差异,且该差异受基因型的影响可能更大。
李学梅余育和解绶启颜庆云陈宇航董小林
关键词:银鲫异育银鲫PCR-DGGE
凝胶条带内DNA回收测序评估DGGE可靠性被引量:1
2014年
为了评估DGGE的可靠性,对DGGE条带中回收的DNA片段进行了测序比较分析,并引入了DGGE可靠性指数的概念评价其可靠性。结果显示同一条DGGE条带回收的DNA来自同一属的概率为64.7%,相同位置的DGGE条带可以被认为是同一OTU;不同的DGGE条带回收到类似的DNA序列(16S rDNA V3区差异小于4 bp)的概率为10.5%;DGGE可靠性指数为74.8%。以上结果表明尽管DGGE技术与理论预期存在一定的差距,但是DGGE技术基本能够反映微生物群落的多样性。
倪加加余育和
关键词:DNA指纹变性梯度凝胶电泳微生物群落结构
不同月份养殖草鱼幼鱼消化道微生物群落动态变化研究被引量:5
2013年
为了评估草鱼消化道微生物群落结构在草鱼食性转化后的变动情况,实验对食性转换完成后的草鱼消化道微生物群落结构进行了PCR-DGGE分析。结果显示,不同月份采集草鱼消化道微生物群落结构存在明显差异(Monte Carlo检验,A:F=3.41,P=0.002;B:F=3.58,P=0.002),而被广泛认为影响宿主消化道微生物群落结构的宿主大小、丰满度等因素则在短期内并没有发现会对草鱼消化道微生物群落结构产生影响。实验表明,短期内环境因素可能是造成草鱼消化道微生物群落结构变动的主要因素。本实验结果将为深入阐述草鱼消化道微生物群落结构的变化规律、消化道益生菌的作用机理、消化道微生物群落结构变动与草鱼疾病的关系等问题积累基础材料。
倪加加余育和
关键词:草鱼变性梯度凝胶电泳
共1页<1>
聚类工具0