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国家科技基础条件平台建设计划(2004DKA30470-005)

作品数:5 被引量:58H指数:5
相关作者:庞艳红孙中武尹洪滨张研孙效文更多>>
相关机构:中国水产科学研究院黑龙江水产研究所东北林业大学上海水产大学更多>>
发文基金:国家科技基础条件平台建设计划国家重点基础研究发展计划国家科技攻关计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学
  • 2篇生物学

主题

  • 3篇微卫星
  • 2篇磁珠富集
  • 2篇磁珠富集法
  • 1篇野生群体
  • 1篇银鲫
  • 1篇生化遗传
  • 1篇生化遗传分析
  • 1篇史氏鲟
  • 1篇特异
  • 1篇特异性
  • 1篇同工酶
  • 1篇同功酶
  • 1篇同功酶分析
  • 1篇青海湖裸鲤
  • 1篇组织特异性
  • 1篇微卫星标记
  • 1篇微卫星分子标...
  • 1篇裸鲤
  • 1篇黄颡
  • 1篇黄颡鱼

机构

  • 3篇中国水产科学...
  • 2篇东北林业大学
  • 1篇上海水产大学
  • 1篇青海湖裸鲤救...

作者

  • 2篇尹洪滨
  • 2篇孙中武
  • 2篇庞艳红
  • 1篇祁洪芳
  • 1篇史建全
  • 1篇薛淑群
  • 1篇匡友谊
  • 1篇姚道霞
  • 1篇蒋鹏
  • 1篇姬长虹
  • 1篇王炳谦
  • 1篇孙效文
  • 1篇张研
  • 1篇于冬梅
  • 1篇马海涛

传媒

  • 2篇大连水产学院...
  • 1篇生态学报
  • 1篇水产学报
  • 1篇东北师大学报...

年份

  • 1篇2009
  • 4篇2007
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
应用微卫星多态分析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalski(Kessler))六个野生群体的遗传多样性被引量:16
2009年
青海湖裸鲤是青海湖唯一的经济鱼类,由于湖区生态环境的恶化,使得该鱼种群数量越来越稀少。2004年中国环境发展国际合作委员会在《中国物种红色名录》中,将其列为濒危物种。研究利用生物素-磁珠富集法获得10个具有多态的微卫星分子标记,检测6个野生裸鲤群体:布哈河群体、沙柳河群体、哈尔盖河群体、泉吉河群体、黑马河群体、淡水系群体的遗传多样性。结果表明:每个座位上的等位基因数为2~8个,大小在161~486bp之间。有效等位基因数在1.00~5.45个,平均多态信息含量分别为0.3642、0.4044、0.3830、0.4047、0.3869和0.3940,无偏观测杂合度的平均值在0.4145~0.5105之间,说明这几个群体属于中度多态,遗传多样性水平较高。根据群体间的遗传距离和遗传相似系数发现,布哈河群体与淡水系群体之间的遗传距离最大(DA=0.1607),哈尔盖河群体与泉吉河群体之间的遗传距离最小(DA=0.0125)。由UPGMA聚类图可知:哈尔盖河和泉吉河两个群体聚为一个分支,布哈河、沙流河、黑马河和淡水系4个群体聚为另一个分支。
蒋鹏史建全张研祁洪芳孙效文
关键词:青海湖裸鲤微卫星
5个虹鳟群体的生化遗传分析被引量:16
2007年
The levels of genetic variation at 40 genic loci of 15 isozymic systems in rainbow trout(Oncorhynchus mykiss) were determined among Donaldsons super rainbow trout,rainbow trout from California of USA,rainbow trout from Norway, rainbow trout from Danmark,and Jalo rainbow trout respectively.The genetic parameters would be important in selective breeding programs.As a main research means,the discontinuous vertical plate polyacrylamide gel electrophoresis(PAGE) was used to analyze the biochemical genetics status of 5 populations of rainbow trout.The P of 5 populations of rainbow trout ranged from 43.24% to 47.37%;the He′ of 5 populations of rainbow trout ranged from 0.1917 to 0.2178;the Ho′ ranged from 0.2703 to 0.3291;the D ranged from 0.4100 to 0.5331;the Ne ranged from 1.4865 to 1.5385.The chi-Square test showed all polymorphic loci from the 5 populations of rainbow trout were in Hardy-Weinberg equilibrium.Various genetic indexes showed that resource quality of the 5 populations of rainbow trout resource quality was still good.Phylogenetic tree showed rainbow trout from Norway,rainbow trout from Danmark,rainbow trout from California of USA and Donaldsons super rainbow trout belonged to the same clade,and Jalo rainbow trout belonged to another clade.
庞艳红孙中武尹洪滨王炳谦
关键词:虹鳟同工酶
用磁珠富集法制备史氏鲟的微卫星分子标记被引量:8
2007年
采用生物素-磁珠富集法与放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了史氏鲟Acipenser schrencki基因组的微卫星资源。结果表明:在得到的1 400多个细菌中,有300多个阳性克隆,将其中96个进行测序,在这些序列中共有115个微卫星核心序列,含99个重复次数大于10次的微卫星核心序列。其中完美型标记40个,占40.4%;非完美型标记52个,占52.5%;混合型标记共7个,占7.1%。随机选取侧翼序列较长的50个序列,依据引物设计原理设计引物50对,经3次PCR筛选,有28对引物可得到稳定的特异性扩增;同时利用史氏鲟的6个个体检验了这些位点的多态性,并统计了等位基因数,发现有22对等位基因具有良好的多态性。
于冬梅匡友谊马海涛梁利群孙效文
关键词:磁珠富集史氏鲟微卫星
用磁珠富集法快速制备银鲫微卫星标记被引量:12
2007年
将磁珠富集法和用γ-32P标记的放射性探针法相结合,快速制备银鲫Carassius auratus gibelio微卫星。用限制性内切酶MboI对银鲫完整基因组DNA酶切,用不同蔗糖浓度梯度离心收集400-900 bp大小的片段,连接Brown接头,构建银鲫全基因组文库。用生物素标记的(CA)16寡核苷酸探针进行筛选,磁珠富集含有微卫星的DNA单链序列;对DNA模板进行PCR扩增,连接pMD18-T载体,转入用CaCl2制备的感受态大肠杆菌Escherichia coliDH5α中,得到微卫星序列文库;经用同位素γ-32P标记的探针(CA)16二次筛选,获得235个阳性克隆,对其测序,得224个含微卫星序列,完美型、非完美型、复合型序列分别占总数的52.8%、28.7%、18.5%。除探针中使用的(CA/GT)n重复单元外,还观察到(GA/CT)n、(ACTC)4的重复序列。设计163对引物,选择合成30对引物,经聚丙烯酰胺凝胶筛选,9对可以获得清晰条带,其中3对为单态,6对为多态。
姬长虹孙效文
关键词:银鲫微卫星磁珠富集
黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco,Richardson)同功酶分析被引量:7
2007年
采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳法对产自黑龙江水系的黄颡鱼同功酶进行了分析.结果表明:在黄颡鱼的性腺、眼、肌肉、肝、心、肾6种组织中,10种酶(ADH,EST,GDH,IDH,MDH,LDH,POD,-αAMY,G-6-PDH和SOD)的同功酶谱均存在明显的组织特异性.其中的5种酶在雌雄性别间也存在着显著的差异.这种雌雄性别间存在的较为明显、稳定的酶谱差异可以作为黄颡鱼性别鉴定的一项参考指标.10种酶共记录出25个基因位点,其中Adh-1,Adh-3,Gdh-1,Gdh-2,Pod-2和Est-1为多态位点.黄颡鱼群体的多态位点百分数为24.00%(P0.99),平均预期杂合度和平均实际杂合度分别为0.096 2和0.005 0,极显著地偏离了Hardy-Weinberg平衡;平均有效等位基因数为1.24,在目前硬骨鱼类多样性研究资料中处于下限值;多态位点的固定指数为0.983 5,杂合子处于较深程度的缺失状态.从以上数据可以看出,这批引自黑龙江水系的黄颡鱼群体的种质较为纯化.
尹洪滨孙中武姚道霞孙德志庞艳红薛淑群
关键词:黄颡鱼同功酶组织特异性
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