上海天昊生物科技有限公司
- 作品数:27 被引量:14H指数:2
- 相关机构:天昊生物医药科技(苏州)有限公司复旦大学山西省人民医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 人类Y染色体36个新STR位点的筛选与鉴定被引量:2
- 2012年
- 通过对NCBI数据库中的Y-STR位点和生物信息学预测的新Y-STR位点的分析,选取了133个位点在48个全球分布的样本中进行检测验证,获得41个可靠的高频位点,其中36个为首次发现验证的新Y-STR位点。利用这41个Y-STR位点,在200个上海随机男性样本中共发现200种单倍型,实现了人群内个体间100%区分,并通过对浙江江山一姜氏聚集地的9个5代以内无血缘关系的姜氏个体和7个上海随机人群的姜氏个体的单倍型的分析,发现6个江山姜氏个体具较近的亲缘关系(彼此差异位点在2~4个之间)。这41个Y-STR位点具备较高的信息度,能有效区分群体内不同家族来源的个体,这将有助于群体内个体间近代亲缘关系研究,并有望在法医学法医个体识别、亲权鉴定,人类起源、迁徙等研究中发挥重大作用。
- 彭冬铂姜正文孙斯平李才华卢大儒
- 关键词:Y-STR单倍型区分度
- 基因多态检测方法及试剂盒
- 本发明公开一种基因多态检测方法,包括以下步骤:针对目标基因设计多重PCR引物,每个目标基因包含限制性内切酶序列;设计内对照DNA片段,该内对照DNA片段包含目标基因的限制性内切酶序列;对待测样本进行多重PCR扩增;将PC...
- 姜正文 彭冬铂 孙斯平
- 分支杆菌的鉴定方法
- 本发明揭露了一种分支杆菌的鉴定方法,包括如下步骤:获取多种分支杆菌的多个标准序列,以生成分支杆菌序列数据库。对所述多个标准序列进行比对,得到这些序列共有的保守区段。根据所述保守区段制备一对PCR引物。使用所述PCR引物对...
- 丁达王一乐军
- 文献传递
- 功能性胃肠病患者中肠道菌群与脑源性神经营养因子及紧密连接蛋白ZO1表达的相关性分析被引量:10
- 2018年
- 目的分析功能性胃肠病患者中肠道菌群与脑源性神经营养因子(BDNF)及紧密连接蛋白ZO1表达的相关性。方法选取山西省人民医院消化科2014年8月至2015年3月诊断为功能性胃肠病行肠镜检查患者32例,同时收集粪便和结肠黏膜标本,提取粪便和黏膜组织DNA后,对16S rRNA基因的V3~V4区进行高通量测序。使用实时荧光定量聚合酶链反应方法检测BDNF和ZO1的mRNA表达量,并应用生物信息学方法比较粪便和黏膜菌群差异,并对粪便、黏膜菌群与BDNF和ZO1表达量的相关性进行分析。结果在属水平,许多菌的丰度在粪便菌群和黏膜菌群中存在显著差异。在种水平,十几种菌与BDNF的表达量显著负相关,而另外也有十几种菌与ZO1的表达量呈显著正相关。粪便和黏膜与同一蛋白相关的菌种不同。粪便中的Gardnerella_vaginalis和Sutterella_sp._252菌以及黏膜中的Bacteroides vulgatus,uncultured Ruminococcus sp.,uncultured bacterium adhufec236,bacterium Shr3,uncultured bacterium adhufec77.25与BDNF和ZO1同时存在显著的相关性。粪便中与BDNF呈负相关的菌株butyrate-producing bacterium_GM2/1和Bifidobacterium_longum在黏膜中与ZO1表达呈显著正相关。结论功能性胃肠病患者中多个菌株与BDNF负相关的同时与ZO1正相关,有可能成为同时调控BDNF和ZO1表达的备选菌种用于功能性胃肠病的治疗。
- 王慕董丽娜张芳王俊平李才华
- 关键词:功能性胃肠病脑源性神经营养因子肠道菌群
- 人类原癌基因KRAS的检测方法及试剂盒
- 本发明提供了一种KRAS基因突变的检测方法和试剂盒,所述检测方法包括步骤:(a)抽提样品中的DNA,用特异性引物在特定的扩增条件下进行PCR扩增;(b)对扩增产物进行测序,与正常KRAS基因比较,是否存在基因突变。所述特...
- 姜正文丁达
- 文献传递
- 一种基于多重PCR的基因组DNA完整性检测的方法
- 本发明提供了一种基于多重PCR的基因组DNA完整性检测的方法。具体地,本发明使用多对扩增产物长度呈梯度的引物对,对待测DNA和标准基因组DNA进行多重PCR扩增,分别检测对应于待测DNA的第一扩增产物的峰高F1和对应于标...
- 姜正文 方欧
- 文献传递
- 多重基因拷贝数检测试剂盒和方法
- 本发明公开一种多重基因拷贝数检测试剂盒,主要包括有:针对待测的目标基因设计的多重PCR引物;定量的针对不同待测的目标基因的内对照DNA片段;至少一对参照基因的多重PCR引物;定量的参照基因的内对照DNA片段;上述同种荧光...
- 姜正文马瑞晓
- 多重核酸分析
- 本发明提供一种多重核酸分析方法。所述方法包括步骤:将探针组与样本中的目标核酸杂交;连接杂交的探针;扩增连接的探针;和检测扩增产物以确定样本中目标核酸是否存在或量。多重性的实现可部分通过在引物中添加可检测基团和插入填充序列...
- 姜正文余锋李才华
- ERCC8基因复杂变异导致儿童发生Cockayne syndrome
- 目的:1例13岁男性患儿,具有多种医学问题:严重生长落后(<3SD)、智力低下、运动能力倒退、听力和视力异常、严重皮疹。患儿弟弟2岁,具有以上相同表型,较轻。但患者父母、姐姐发育正常,询问无家族史,孕期发育无明显异常,染...
- 谢华李小燕彭继平陈倩宋小珍李巍宇肖建球李才华钟建明陈晓丽
- 关键词:基因变异CGH外显子
- 文献传递
- 一种高通量核酸分析方法及其应用
- 本发明涉及一种高通量基因分析方法及其应用,具体地,包括步骤:对于待分析的n种目的核酸片段,针对每个目的核酸片段,提供结合于所述目的核酸片段的不同结合区的至少2个特异探针,所述的各特异探针具有特异结合区和通用序列区,并且所...
- 姜正文 杨锋
- 文献传递