中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传育种教育部重点实验室 作品数:72 被引量:315 H指数:10 相关作者: 晏萌 钟其旺 鹿宁 李纪勤 刘晓龙 更多>> 相关机构: 石河子大学生命科学学院 烟台大学生命科学学院 中国科学院海洋研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 天文地球 自动化与计算机技术 更多>>
裂殖壶菌pks基因启动子的克隆及活性检测 2022年 为了探究裂殖壶菌(Aurantiochytrium limacinum)合成DHA的关键酶基因pks1和pks3的启动子活性,本实验首先通过染色体步移技术得到pks1和pks3基因的5′端上游序列,然后经生物信息学软件分析初步确定两段序列具有启动子特征,含有上游调控元件,可能具有启动子活性;进而以绿色荧光蛋白作为报告基因,构建了原核表达载体pAcGFP1-1-pks1 promoter和pAcGFP1-1-pks3 promoter,以及真核表达载体pYD1-pks1 promoter-GFP和pYD1-pks3 promoter-GFP,并分别转化大肠杆菌E.coli BL21和酿酒酵母S.cerevisiae EBY100,通过荧光光谱及SDS-PAGE分析等来检测重组菌株绿色荧光蛋白表达情况。结果表明这两段序列,能够使绿色荧光蛋白在原核表达系统及真核表达系统中实现异源表达,具有启动活性,可以用作基因工程中的启动子元件。 王振东 臧晓南 丛晓梅 朱清关键词:启动子 荧光光谱 SDS-PAGE 黄海冷水团可培养细菌的多样性研究 2011年 本文研究了2008年7月黄海冷水团海域可培养细菌的多样性。AODC和DVC计数总菌数和活菌数分别为(1.34.8)×105/mL和(0.61.6)×105/mL;2216E平板以菌落计数法可培养细菌浓度为(0.562.2)×103cfu/mL。从分离到的475株中选取163株进行16S rDNA扩增,并用HhaⅠ酶进行ARDRA(扩增性rDNA限制酶切片段分析)多态性分析,取114株不同带型测序。结果显示,冷水团细菌归为4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Acti-nobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),共24个属,其中包括α-,β-,γ-变形菌纲;非冷水团细菌也归为这4个门类,共15个属,但未分离到β-变形菌纲。γ-变形菌纲在冷水团和非冷水团区域的不同深度都是优势菌群,不同的是冷水团区域α-变形菌纲比例较高(26.8%),而非冷水团区域α-变形菌纲比例相对较低(15.6%)。这表明黄海冷水团和非冷水团区域细菌多样性都很丰富,但其群落组成和优势菌群有所不同。此外,16S rDNA测序结果表明,6株细菌可能为海洋细菌新种。 王红 刘吉文 张晓华关键词:可培养细菌 多样性 黄海冷水团 栉孔扇贝骨形态发生蛋白2基因的克隆及表达分析 被引量:6 2013年 骨形态发生蛋白(Bone morphogenetic protein,BMP)家族成员在动物的骨骼发育及器官形成中发挥着重要作用。本文利用同源克隆策略获得栉孔扇贝(Chlamys farreri)BMP2基因(CfBMP2)的全长cDNA和基因组DNA序列。其中,DNA序列长度为11 252bp,由3个外显子和2个内含子组成;cDNA序列全长3 562bp,含有1 221bp开放阅读框,编码406个氨基酸,与合浦珠母贝(Pinctadafucata)、长牡蛎(Crassostrea gigas)、斑马鱼(Danio rerio)和人(Homo sapiens)的同源蛋白相似性分别为67%、51%、59%和57%。运用实时荧光定量反转录PCR技术(qRT-PCR)对CfBMP2基因的时空表达进行分析。结果表明,在栉孔扇贝早期胚胎中几乎检测不到CfBMP2mRNA,从囊胚期开始有少量该基因表达,在原肠胚时期表达量显著上升,至幼虫期表达量又显著下降。除原肠胚外,在检测的其它发育时期,包括受精卵、4细胞期、担轮幼虫、D型幼虫和壳顶幼虫间,CfBMP2基因表达量没有显著差异。在取样的成体组织中均检测到CfBMP2基因的表达。其中,鳃中CfBMP2的表达量显著高于其它组织,外套膜次之。在横纹肌、性腺、肾和消化腺中,CfBMP2表达量较低且在这4种组织间无显著差异。上述研究结果提示,CfBMP2可能参与栉孔扇贝的器官组织发生和壳的生长。 封利颖 郭慧慧 李雪 于茜 胡晓丽 张玲玲 王师 包振民关键词:栉孔扇贝 骨形态发生蛋白2 基因克隆 牙鲆脑垂体早期发育的组织学观察 2010年 垂体作为鱼类最重要的内分泌器官之一,在生长、发育、生殖以及其他一些内分泌相关生理活动中起重要作用。作者采用组织学方法观察了牙鲆的脑垂体发生,对不同发育时期的腺垂体细胞进行了初步鉴定。结果表明,孵化后1d仔鱼的间脑下方可见一实心细胞团,于孵化后3d迁移至间脑后方的漏斗体下,与来自漏斗体的神经内分泌细胞及其神经纤维结合共同形成脑垂体,前者形成腺垂体,后者则主要形成神经垂体。孵化后8d腺垂体分为中间部(Pars intermedia,PI)和外侧部(Pars distalis,PD)两部分。孵化后14d腺垂体分化为前外侧部(Rostral pars distalis,RPD)、中外侧部(Proximal pars distalis,PPD)和PI共3部分,为"前后型"脑垂体。稚鱼变态期间及变态完成后的幼鱼,各部分从"前后型"排列开始向"背腹型"排列转变。孵化后14d的牙鲆仔鱼中,PPD细胞多呈强嗜酸性,至变态完成后一直是PPD的主要细胞;PI靠近神经纤维的细胞呈强嗜碱性。孵化后42d的牙鲆幼鱼RPD中,与神经垂体相邻的少量细胞呈嗜碱性,而其下方细胞则呈嗜酸性。根据成体牙鲆激素分泌细胞的染色特征对上述各细胞类型进行了推测。 邵明瑜 张志峰 刘建国 李昀 张全启关键词:牙鲆 脑垂体 发育 组织学 3月龄牙鲆形态性状对体质量的通径分析 被引量:54 2010年 随机选取3月龄牙鲆Paralichthys olivaceus100尾,分别测量全长(X1)、体长(X2)、头长(X3)、体厚(X4)和体高(X5)共5个形态学指标和体质量(Y)。通过SAS软件进行相关性分析和回归分析,分别计算以形态性状为自变量对体质量的通径系数和决定系数,进而对各性状对体质量的影响进行剖分。明确影响3月龄牙鲆体质量的主要形态性状,为牙鲆选育提供数据支持和理想的测度指标。结果表明,各形态性状间及与体质量的相关系数均达到极显著(P<0.01)。体长、体厚和体高对体质量的通径系数均达到极显著的水平(P<0.01);所选形态性状对体质量的决定系数R2=0.945,表明所选形态性状是影响3月龄牙鲆体质量的主要性状。通过对各形态性状偏回归系数的显著性检验,剔除不显著的性状自变量后,建立最优的多元回归方程:Y=-4.988+0.763X2+2.997X+1.089X,各偏回归系数均达到极显著水平(P<0.01)。 严福升 王志刚 刘旭东 刘志鹏 张全启关键词:牙鲆 形态性状 通径分析 鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用 被引量:2 2011年 基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。 张鹏 杨官品 张立楠 危起伟 邹桂伟关键词:限制性片段长度多态性 硫化物代谢关键基因sqr的转录调控研究 多细胞生物体内的硫化物既可内源性合成,又可由体外渗透进入。低浓度的硫化物作为信号分子参与机体的生理过程调控,但在高浓度下它是一种有毒物质可造成机体的代谢损伤甚至死亡。线粒体的硫化物氧化是生物体解毒硫化物的主要机制,硫醌氧... 李学玉 刘晓龙 谢跃洋 张志峰关键词:单环刺螠 硫化物 转录调控 转录因子 栉孔扇贝骨形态发生蛋白Ⅰ型受体基因的克隆及表达分析 2013年 首次在栉孔扇贝(Chlamys farreri)中克隆了骨形态发生蛋白I型受体(Bone morphogenetic protein type Ⅰ receptor,cfBMPR1)基因cDNA全长序列,该基因开放阅读框长1560bp,编码为519个氨基酸。实时荧光定量反转录PCR(real-time qRT-PCR)分析结果显示,cfBMPR1基因在栉孔扇贝受精卵、4细胞期、囊胚、原肠胚、担轮幼虫期、D型幼虫期和壳顶幼虫期等发育时期均有表达,其中胚胎时期表达量高于幼虫期,提示该基因在扇贝早期发育及幼虫形态形成过程中的重要作用;在成体组织,包括外套膜、鳃、性腺、肾、横纹肌和消化腺中也均检测到了cfBMPR1的表达,其中以性腺和横纹肌中表达量最高,暗示其参与了扇贝包括繁殖和肌肉生长发育等在内的多种生物学过程。研究结果为进一步研究TGF-β信号通路在扇贝生长发育中的功能提供了基础数据。 郭慧慧 包振民 连姗姗 贺艳 胡晓丽关键词:栉孔扇贝 基因 单环刺螠转录因子基因Sp8的克隆、原核表达和重组蛋白纯化 2013年 转录因子Sp是一类广泛存在的锌指蛋白超家族成员,可与某些基因的上游调控序列结合,参与基因的转录调控。本研究采用同源克隆和RACE技术,获得单环刺螠的Sp8的全长cDNA,该序列长1 913bp,开放阅读框1 521bp,编码506个氨基酸;将其开放阅读框cDNA克隆到原核表达载体pET28a中,并转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,在37℃条件下,经1mmol/L IPTG诱导表达4h,获得以包涵体形式存在的重组蛋白pET28a-SP,使用8mol/L尿素溶解包涵体,并通过镍离子金属螯合柱纯化获得重组蛋白,SDS-PAGE分析该蛋白的分子量约为50kD。Sp8蛋白体外表达的成功将为研究单环刺螠相关基因的转录调控打下基础。 史晓丽 刘晓龙 张立涛 张志峰关键词:单环刺螠 转录因子 克隆 原核表达 通过转录组测序技术分析龙须菜藻红蛋白合成相关基因 黄小云 臧晓南 吴非