中国水产科学研究院黑龙江水产研究所农业部北方鱼类生物工程育种重点开放实验室
- 作品数：31 被引量：466H指数：14
- 相关作者：沈俊宝侯宁谷晶晶王蕾姬长虹更多>>
- 相关机构：大连水产学院生命科学与技术学院大连海洋大学生命科学与技术学院上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 草鱼三、四核苷酸重复微卫星标记的分离与特征分析被引量：14
- 2011年
- 采用磁珠富集法、通过质粒检测法结合同位素杂交检测获得草鱼(Ctenopharyngodon idellu)三、四核苷酸阳性克隆1 378个,测序705个,共得到846个微卫星座位,其中完美型632个(占74.7%),非完美型114个(占13.48%),混合型100个(占11.82%)。根据微卫星侧翼序列设计并合成100对微卫星引物,检测结果显示35对(35%)引物在邗江野生群体中表现出多态性。选择其中20对多态性稳定的引物进行遗传多样性分析,结果显示,20个位点共检测到212个等位基因,平均观察杂合度(Ho)为0.681 1,平均期望杂合度(He)为0.797 5,平均多态信息含量为0.777 7。结果表明,所筛选的微卫星标记能够用于草鱼群体遗传学研究。本研究旨在为草鱼的种群遗传结构分析、遗传图谱构建等研究奠定基础。
- 李文升刘翠鲁翠云李超孙效文
- 关键词：草鱼微卫星标记多态性
- 黄颡鱼(Pelteobagrus eupogon)不同生态地理分布群体遗传多样性的微卫星分析被引量：38
- 2009年
- 利用40个黄颡鱼微卫星分子标记对吉林省月亮湖野生黄颡鱼(YL,30尾)、四川野生黄颡鱼(SC,30尾)、黑龙江省哈尔滨市松花江段黄颡鱼(SH,18尾)、湖北省荆州市长湖野生黄颡鱼子代(YY,30尾)及其亲本(QQ,30尾)、天津市换新国家级原良种场黄颡鱼1号(TJ,30尾)6个黄颡鱼群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,x2检验估计Hardy-Weinberg平衡,采用近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化及其来源。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA进化树。6个群体共检测到5042个扩增片段,长度在150—650bp,40个基因座扩增出等位基因数从1—8个不等,共计143个等位基因,平均每个基因座扩增得到3.575个等位基因。结果显示:(1)6个黄颡鱼群体的多态性指标均适中,PIC在0.00—0.79之间,平均值为0.40、0.37、0.35、0.39、0.35和0.19,有效等位基因数(Ae)1.00—5.44个不等,平均有效等位基因数依次为2.05、2.30、1.93、2.07、1.93和1.47,无偏期望杂合度(He)在0.00—0.83之间,平均值为0.45、0.46、0.36、0.46、0.41和0.23;(2)遗传相似系数YY与QQ遗传相似度最高(0.9947),TJ与SC遗传相似系数最低(0.4846),聚类结果与地理分布呈一定相关性。
- 李大宇殷倩茜侯宁孙效文梁利群
- 关键词：黄颡鱼微卫星
- 黑龙江乌苏里白鲑遗传多样性分析被引量：18
- 2004年
- 本研究从50对虹鳟(Oncrhynchus mykiss Walbaum)的微卫星标记中筛选出在黑龙江乌苏里白鲑(Coregonus usssru-ensis Berg)基因组中扩增出的多态性SSLP标记12对。用其中的6对微卫星标记对15尾黑龙江乌苏里白鲑基因组DNA进行遗传检测。用2％的琼脂糖凝胶电泳检测微卫星引物的PCR扩增产物,计算6个SSLP基因座的等位基因频率、多态信息含量等。结果显示,最高等位基因频率的范围在0.3750-0.5385,最低为0.0250,说明这个群体为多态群体(群体具有遗传多样性)。多态信息含量(PIC值)的范围在0.4620-0.7069,说明基因座为高度多态基因座。黑龙江乌苏里白鲑群体的杂合度范围在0.5586-0.7282,表明其遗传多样性程度处于中等偏上水平。从遗传多样性角度应引起重视,采取切实可行的措施对其遗传多样性加以保护。结合资源量下降的现实,建议在保护遗传多样性的前提下对其采取人工繁殖放流的方法扩大其种群数量。
- 梁利群常玉梅董崇智
- 关键词：种群
- 微卫星DNA标记对乌苏里江哲罗鱼遗传多样性的分析被引量：71
- 2004年
- 从网上查询获得鳟微卫星标记30对,并对乌苏里江哲罗鱼的基因组进行遗传多样性分析,结果筛选出10对具多态性的微卫星标记。并用其中6对微卫星引物对17尾乌苏里江哲罗鱼进行基因组DNA扫描检测。用2%的琼脂糖凝胶电泳检测微卫星标记的PCR扩增产物,并对扩增结果进行了统计分析,计算了6个基因座的等位基因频率、杂合度等。结果表明,乌苏里江哲罗鱼等位基因频率为0.0455～0.7857,多态信息含量(PIC)为0.2801～0.6351,杂合度(H)为0.3368～0.6563。统计结果初步表明乌苏里江哲罗鱼的遗传多样性程度处于中等偏下水平。同时,结合资源量下降的事实,建议在保护遗传多样性的前提下对其采取人工繁殖和放流的方法增加其种群数量。
- 梁利群常玉梅董崇智孙效文
- 关键词：哲罗鱼微卫星标记
- 鲤鱼微卫星突变速率和模式(英文)被引量：1
- 2010年
- 利用150个微卫星分子标记在F1代家系的基因型分析过程中,共有27600个等位基因从亲本向子代传递,其中在5个微卫星座位上检测到6个突变的等位基因。对突变的等位基因数目进行统计分析后得出:鲤鱼平均每个世代每个微卫星座位的突变速率为2.53×10-4。在发现突变的5个位点中,经测序发现,突变序列中插入1个以上的重复单元就导致了突变的发生。这些突变表明,鲤鱼的微卫星突变没有遵循严格的渐变突变模型(stepwise mutation model,SMM)。该文关于鲤鱼微卫星突变速率和模式的研究将会对统计鲤鱼有效群体的统计提供有效参数。
- 张研鲁翠云曹顶臣徐鹏王书李恒德赵紫霞孙效文
- 关键词：突变速率鲤鱼
- 镜鲤两个繁殖群体的遗传结构和几种性状的基因型分析被引量：39
- 2007年
- 利用扩增效果好、在群体中具有多态性的28个微卫星标记,检测国家换新良种场的镜鲤繁殖群体和黑龙江水产研究所松浦实验场的镜鲤繁殖群体的遗传组成,计算了两个群体的有效等位基因数,期望杂合度和多态信息含量等遗传参数,换新与松浦两个群体的有效等位基因数分别为2.874和3.102,期望杂合度分别是0.565和0.603,多态信息含量分别是0.534和0.568;遗传结构分析研究结果表明这两个群体的多样性较高,信息含量丰富,具有进一步筛选出优良品种的遗传基础。但连锁不平衡分析表明这两个群体在较大的选择压力下,已严重偏离Hardy-Weniberg平衡,要保持群体的优良性状相关的遗传基础,应该在进一步的选种中注意增加群体的遗传多样性。也用28个基因座的不同基因型与换新208个亲本的体重值进行了连锁分析,得到12个与镜鲤体重相关的基因型,其中紧密相关的基因型3个;分析了一些严重偏离平衡的基因型,并分析了出现这种现象的可能原因,同时探讨了一些基因型与胚胎期致死或易感病基因连锁的可能性。为描述基因型偏离程度,创造了基因型偏离指数,并用其对群体中一些基因型出现的偏离现象进行了探讨。
- 孙效文鲁翠云匡友谊金万昆沈俊宝朱晓东李大宇马海涛于冬梅
- 关键词：镜鲤繁殖群体基因型
- 鲤的微卫星标记与体质量、体长、体高和吻长的相关分析被引量：16
- 2010年
- 利用24个鲤(Cyprinus carpio L.)EST-SSRs标记和41个SSRs标记对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系回交子代的84个个体基因组DNA进行检测,共得到182个等位基因,各座位等位基因数2～4个,片段长度142～329bp,有效等位基因数1.3913～3.9353,观察杂合度0.3214～1.0000,期望杂合度0.2829～0.7535,平均位点多态信息含量0.5120。利用统计软件SPSS的GLM程序对65个微卫星标记与鲤鱼体质量、体长、体高和吻长的相关性进行了分析,其中与体质量、体长显著相关的标记是HLJE365;与体质量、体高显著相关的标记是HLJ816;与体质量显著相关的标记是HLJ726,与体长显著相关的标记是HLJ107、HLJ1098;与体高显著相关的标记是HLJ111、HLJ817;与吻长显著相关的标记是HLJE331、HLJ906、HLJ1330。对同一标记不同基因型间进行多重比较,找到与4种性状相关的基因型,并运用数学建模的思想定位等位基因对性状的影响。
- 杨晶张晓峰储志远孙效文
- 关键词：微卫星标记体质量体长体高
- 荧光原位杂交概述被引量：4
- 2004年
- 耿波梁利群孙效文
- 关键词：荧光原位杂交探针染色体
- 鲤和牙鲆的两种雌核发育子代的基因型分析被引量：10
- 2008年
- 研究调查了鲤和牙鲆经两种雌核发育操作获得的子代的基因型纯合情况。结果显示,多数子代在母本杂合基因座上的纯合速率并不快,如鲤抑制第一次卵裂的44尾子代平均纯合化程度为30.2%,纯合化程度最高的个体为53.3%,纯合化程度最低的仅有13.3%,没有得到纯合个体;牙鲆抑制第一次卵裂22个子代中有3个纯合个体;而抑制第二极体的牙鲆4个家系中纯合化最高的个体是C家系的第18号子代为56%,平均纯合度为19%,14个子代的纯合化速率为零。结合鲤抑制第二极体和牙鲆抑制第一次卵裂的实验结果对两种雌核发育产生的纯化作用进行了分析和评价;并针对育种过程中的雌核发育技术进行了讨论。
- 孙效文张研季旭明召华鲁翠云梁利群刘海金
- 关键词：养殖鱼类基因型分析雌核发育
- 鲤鱼(Cyprinus carpioL．)头长、眼径、眼间距QTL的定位被引量：20
- 2009年
- 用265个AFLP标记、127个微卫星分子标记、37个EST-SSR标记和16个RAPD标记对大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的F2雌核发育群体44个个体进行基因型检测,构建鲤鱼遗传连锁图谱。利用软件WinQTLCart2.5采用复合区间作图法对头长、眼径、眼间距3个性状进行了QTL分析。结果显示,共检测到5个与头长性状相关的QTL,分别定位于鲤鱼连锁图谱的LG2(qHS-2-1)、LG3(qHS-3-1)、LG40(qHS-40-1)和LG4(qHS-4-2和qHS-4-3)上。其中qHS-40-1拥有最大的LOD值,为7.94,可解释的表型变异为34.29%。qHS-4-2的LOD值最小,为5.03,可解释的表型变异为11.52%。5个与头长性状相关的QTL加性效应值均为负值。检测到两个与眼径性状相关的QTL,分别定位于鲤鱼连锁图谱的LG39连锁群(qED-39-1)和LG40连锁群(qED-40-1)上,其中qED-40-1的LOD值比较大,为2.76,其加性效应值为负值,可以解释5.62%的表型变异;qED-39-1的LOD值为2.72,加性效应值为正值,可以解释9.77%的表型变异。检测到两个与眼间距性状相关的QTL,分别定位到鲤鱼连锁图谱的LG20连锁群(qEC-20-1)和LG28连锁群(qEC-28-1)上。其中qEC-20-1的LOD值比较大,为3.77,加性效应值为正值,可以解释8.29%的表型变异;qEC-28-1的LOD值为2.79,对应的加性效应值为负值,可以解释8.88%的表型变异。
- 刘继红张研常玉梅梁利群鲁翠云张晓峰徐美佳孙效文
- 关键词：鲤鱼QTL
