宁波大学医学院生物化学与分子生物学研究所 作品数:50 被引量:338 H指数:11 相关作者: 莫小燕 沈星凯 江楠 潘金昌 朱梦颖 更多>> 相关机构: 浙江大学医学院生物化学与遗传学系 浙江大学医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 宁波市自然科学基金 浙江省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 文化科学 农业科学 更多>>
在本科教学中加强非编码RNA知识介绍的必要性 被引量:1 2015年 随着基因组学和转录组学的发展,人们对非编码RNA(non-coding RNA,nc RNA)结构与功能的认识越来越深入。RNA的重要性已不再仅仅以"是否能为蛋白质编码"或"是否与蛋白质合成有关"来体现,它们在复制、复制后、转录、转录后、翻译和翻译后以及表观遗传等多个层面调控基因的表达,体现出丰富多彩的生物学功能。笔者在介绍nc RNA的概念、分类和主要功能的基础上,结合对本科生《生物化学与分子生物学》相关课程现有教学内容的分析,建议高校应通过教材编写、课堂教学、实验指导和学生科研等环节增加nc RNA知识的介绍。 郭俊明 肖丙秀 季林丹 龚朝辉关键词:教学改革 教学内容 非编码RNA 特异性微小RNA抑制剂对胃癌细胞增殖的影响 被引量:14 2009年 目的:探讨特异性微小RNA抑制剂对胃癌细胞增殖的影响。方法:设计并合成4种微小RNA(miR-17、miR-21、miR-106a和miR-421)的2-甲氧修饰的RNA寡核苷酸(微小RNA抑制剂),用脂质体分别转染到SGC-7901和MGC-803胃癌细胞,然后用实时定量逆转录-聚合酶链反应技术检测微小RNA的表达情况,最后用MTT方法检测胃癌细胞的增殖情况。结果:4种微小RNA抑制剂均有效抑制了SGC-7901和MGC-803细胞中相应微小RNA的表达;除miR-21抑制剂未见抑制胃癌细胞的增殖外,其它3种微小RNA抑制剂均以剂量依赖方式抑制胃癌细胞的增殖且对SGC-7901的效果优于MGC-803。结论:微小RNA的特异性抑制剂能有效抑制胃癌细胞的增殖,采用这种技术为研究胃癌的发病机制提供了新方法。 蒋振 郭俊明 肖丙秀关键词:胃肿瘤 微小RNA 细胞增殖 LAMA4基因对喉癌细胞增殖和侵袭的调控机制 被引量:3 2014年 目的构建层粘连蛋白α4亚基(LAMA4)的过表达和干扰序列重组慢病毒,观察其对Hep-2喉癌细胞株增值和侵袭的调控机制。方法全基因合成LAMA4序列并筛选有效的LAMA4基因干扰序列,重组入带有绿色荧光蛋白慢病毒载体。采用慢病毒感染喉癌细胞株Hep-2后,通过Western blot检测过表达和干扰效率。MTT法检测LAMA4基因表达变化时Hep-2细胞株增殖能力的变化。Transwel 实验检测喉癌细胞株感染前后侵袭能力的变化。利用Western blot和Real- time PCR检测基质金属蛋白酶-2(MMP-2)与膜型基质金属蛋白酶(MT1- MMP)的基因表达量变化情况。结果(1)携带LAMA4基因片段和小干扰片段的重组慢病毒成功构建,包装慢病毒后浓缩病毒悬液滴度达到5×105 TU/μl。(2)基因沉默组LAMA4蛋白相对表达量明显低于对照组,过表达组相对表达量明显高于对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。(3)LAMA4干扰慢病毒感染Hep-2喉癌细胞株后,细胞株增殖无明显变化。(4)Transwel 小室检测发现,基因沉默组及过表达组Transwel 细胞数与对照组的差异均有统计学意义(均P<0.05)。(5)与对照组比较,基因沉默组及过表达组MMP-2及MT1- MMP基因与蛋白表达均发生明显变化,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论 LAMA4基因可能是通过MMP-2和MT1- MMP基因相关通路调节喉癌细胞的侵袭能力,LAMA4可以作为治疗喉癌转移的潜在靶点。 邬振华 李群 龚朝晖 沈志森关键词:基因 喉癌 慢病毒 增殖 反义长链非编码RNA与基因表达调控 被引量:7 2013年 反义长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类与其它转录物序列互补的内源性lncRNA。它们通过转录抑制、染色质重塑、核内RNA-RNA相互作用和胞浆RNA-RNA相互作用等机制,在转录及转录后水平调控靶基因的表达。反义lncRNA参与了X染色体失活、基因组印记及一些疾病的发生和发展过程,有希望成为疾病治疗的新靶点。 蒋孝明 邵永富 肖丙秀 郭俊明关键词:长链非编码RNA 基因表达 环状RNA在头颈部肿瘤发生中的作用 环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类闭合环状非编码RNA,它们大量稳定存在于各种生物细胞中并具有组织特异性表达等特征。近年,circRNA功能研究表明,一些circRNA分子具有微小RNA海绵、R... 郝文娟 沈志森 李群 郭俊明遗传性耳聋家系的致病原因分析及产前诊断 2022年 目的对3个先天性耳聋家系进行遗传性耳聋基因检测及突变类型分析,为再生育的家庭提供遗传咨询及产前诊断。方法对在宁波市妇女儿童医院就诊的3例先天性耳聋患儿抽取静脉血,提取DNA。先应用目标基因捕获和高通量测序技术对先证者进行耳聋基因相关的全外显子和相邻内含子测序,利用生物信息学技术对测序数据进行分析,筛选相关变异基因并对其进行致病性分析。再应用Sanger测序法对先证者及其父母做基因突变位点验证。最后对第二胎需要进行产前诊断的孕妇采集羊水进行位点验证。结果家系1先证者中检出肌球蛋白XVA(myosinXVA,MYO15A)基因c.2075C>A、c.4520G>A、c.6668C>T和c.10250_10252del杂合突变。家系2先证者中检出MYO15A基因c.5964+3G>A和c.7395+6T>G复合杂合突变。家系3先证者中检出缝隙连接蛋白β2(gap junction protein beta 2,GJB2)基因c.299_300delAT和c.109G>A复合杂合突变。产前诊断结果显示家系1和家系2胎儿的基因型均与先证者的不同,听力表型正常的可能性大,均选择继续妊娠。家系3的胎儿基因型因与先证者的相同,听力表型异常的可能性大,但该孕妇也选择继续妊娠。结论利用目标基因捕获和高通量测序可以对遗传性耳聋患儿进行基因诊断,给家系遗传提供参考;产前诊断为遗传性耳聋家系提供生育指导,降低出生缺陷。 潘澍青 潘小莉 鲍幼维 庄丹燕 郭俊明关键词:耳聋基因 高通量测序 产前诊断 长链非编码RNA UCA1在胃癌多药耐药中的作用研究 被引量:13 2015年 目的:研究胃癌耐药细胞及其亲本细胞中长链非编码RNA UCA1的表达差异,探讨UCA1在胃癌多药耐药中的作用。方法:通过实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测胃癌耐药细胞SGC7901/ADR、SGC7901/VCR及其亲本细胞SGC7901中UCA1的表达差异;通过si RNA转染降低SGC7901/ADR中UCA1表达,MTT法检测细胞半数抑制浓度(IC50)的变化,流式细胞仪检测细胞凋亡变化。结果:QRT-PCR结果显示,UCA1在SGC7901/ADR和SGC7901/VCR胃癌耐药细胞表达显著高于SGC7901胃癌亲本细胞;MTT实验表明,干扰UCA1的SGC7901/ADR相对于阴性对照(NC)组的IC50显著降低;凋亡检测结果显示,在相同剂量化疗药物作用下,干扰UCA1后SGC7901/ADR凋亡率显著高于NC组;Western blot证实,干扰UCA1表达可显著降低BCL-2蛋白表达。结论:长链非编码RNA UCA1在胃癌耐药细胞表达显著升高,干扰UCA1表达可明显逆转胃癌耐药,UCA1可作为治疗胃癌耐药的重要分子靶标。 张哲 郭昊 董加强 蒋孝明 聂勇战 樊代明关键词:长链非编码RNA 胃癌 多药耐药 环状RNA及其在胃癌中作用的研究进展 被引量:5 2017年 环状RNA(circular RNA,circRNA)是具有闭环结构的RNA。circRNA由于具有分布广泛、序列保守、性能稳定和表达的时空特异性等特征,很有可能成为新型的诊治疾病、判断预后的生物标志物和靶点,并具有研发药物的潜在价值。胃癌居全球癌症发病率第5位。我国是胃癌的高发地区,每年胃癌新发病例占全球的近半数。在胃癌早期筛查方面,我们目前尚无简单、高效的手段。该综述就circRNA领域研究的新成果及其在胃肿瘤的作用进行探讨。 杨平 倪超 倪超 叶孟 陈思关键词:微小RNA 基因表达 胃癌 生物标志物 MiRNA影响胃癌转移的机制 被引量:8 2011年 转移是恶性肿瘤基本的生物学特征,胃癌转移是导致胃癌患者死亡的主要原因.诸多研究表明,微小RNA在胃癌转移过程中起着重要作用.本文总结了有关抑制和促进胃癌转移微小RNA的研究新进展,并从影响信号传导途径、调控癌基因和抑癌基因表达、作用于细胞因子等方面分析了其主要作用机制. 俞秀冲 宋皓军 郭俊明关键词:微小RNA 胃癌 基因表达调控 肿瘤发生过程中miRNA与lncRNA的相互作用 被引量:10 2014年 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是生物体内普遍存在,且对生命活动具有重要调控作用的生物分子.以微RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)为代表的ncRNA分子在肿瘤发生和发展过程中都有重要的作用.越来越多研究发现,miRNA和lncRNA之间的关系是非常密切的,某些lncRNA(如H19和BIC)可以作为miRNA的前体,通过加工成miRNA而发挥作用.有些miRNA通过作用于lncRNA影响肿瘤的发生(如:miR-129与MEG3,let-7与H19);同样地,有些lncRNA通过作用于miRNA影响肿瘤的发生(如:HULC与miR-372,PTCSC3与miR-574-5p,ciRS-7与miR-7,Sry与miR-138).miRNA与lncRNA之间既可以直接相互作用,也可以通过其它分子(特别是蛋白质或蛋白质复合物)间接地影响着肿瘤的发生和发展.揭示miRNA和lncRNA相互作用在肿瘤发生中的作用可以为肿瘤的诊断和治疗提供新思路. 陈声灿 肖丙秀 郭俊明关键词:微RNA 长链非编码RNA 肿瘤发生