史舵
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
- 供职机构:大连理工大学控制科学与工程学院更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于主成分分析方法的蛋白质亚细胞定位
- 近年来,随着人类基因图谱的绘制完成,人类由基因组时代步入后基因组时代。海量激增的蛋白质数据逐渐成为这个时代的特征,生物信息学研究发现蛋白质的功能和结构与亚细胞位置有很大关系,蛋白质转运到不同的位置能发挥不同的作用,在后基...
- 史舵
- 关键词:生物信息学主成分分析
- 文献传递
- PCA方法在蛋白质亚细胞定位中应用被引量:1
- 2012年
- 蛋白质的亚细胞定位与其生物功能密切相关,蛋白质数据库急剧膨胀,迫切需要设计出功能强大的高吞吐量的算法来预测蛋白质的亚细胞位置.许多预测工具都是基于伪氨基酸组成构建而成,应用一种数据分析方法——主成分分析(PCA)法,确定能反映序列次序效应的最优λ值.首先让λ取最大以包含尽可能多的序列次序信息,然后利用主成分分析法提取关键主特征.实验结果表明此方法能解决确定最优λ值困难的问题,且性能优于已有的预测工具.
- 马军伟史舵顾宏张杰
- 关键词:蛋白质亚细胞定位主成分分析K近邻分类器BP神经网络