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张珅
作品数:
19
被引量:1
H指数:1
供职机构:
中国科学院大连化学物理研究所
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发文基金:
全球变化研究国家重大科学研究计划
国家重大科学仪器设备开发专项
国家自然科学基金
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相关领域:
理学
生物学
轻工技术与工程
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合作作者
张丽华
中国科学院大连化学物理研究所
张玉奎
中国科学院大连化学物理研究所
杨开广
中国科学院大连化学物理研究所
周愿
中国科学院大连化学物理研究所
单亦初
中国科学院大连化学物理研究所
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作者
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张珅
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2017
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2016
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2015
7篇
2014
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基于同步酶解和18O标记的集成化蛋白质组定量分析平台的建立
<正>在基于酶促18O标记的蛋白质组相对定量分析中,蛋白质酶解和标记是实现蛋白质定性和定量分析的两个关键步骤。然而,传统的自由溶液酶解和18O标记不仅存在费时费力,样品易丢失污染以及标记不完全等问题,而且难与LC-MS集...
袁辉明
张珅
张丽华
张玉奎
文献传递
一种双通道SPE柱及其在定量蛋白质组学的应用
本发明涉及一种可实现蛋白质定量分析前处理全过程的新型固相萃取(SPE)装置,该装置利用隔板将SPE管分隔为两个等体积的腔室,装填色谱填料后,可原位实现蛋白质样品变性、还原、烷基化、酶解、同位素标记和混合等定量蛋白质组学中...
张丽华
周愿
赵群
张珅
杨开广
张玉奎
文献传递
等重二甲基化标记蛋白质定量方法
本发明涉及了一种新的蛋白质定量方法-等重二甲基化标记定量法,该方法利用甲醛和氰基硼氢化钠及其各自的同位素形式进行有机组合,对肽段进行标记,使得肽段在质谱的一级谱上具有相近质荷比而在二级谱上具有不同质荷比,从而在二级谱上实...
张丽华
周愿
单亦初
杨开广
吴琪
张珅
张玉奎
文献传递
一种蛋白质定量方法
本发明涉及一种使用pH选择性二甲基化标记和一级二级谱结合定量的蛋白质定量方法。包括:选择性二甲基化标记、使用mascot distiller软件对一级谱肽段定量、使用“force‑find”程序对二级谱肽段定量。蛋白质样...
张丽华
张珅
吴琪
周愿
袁辉明
杨开广
张玉奎
文献传递
集成化蛋白质组定量分析平台的构建及应用
被引量:1
2014年
为提高蛋白质组定量分析的准确度、通量和自动化程度,构建了由微升级混合离子交换色谱、亲水型固定化酶反应器(hIMER)和纳升级反相色谱-电喷雾串级质谱(nanoRPLC-ESI-MS/MS)组成的集成化蛋白质定量分析平台。该平台实现了二甲基化标记蛋白质样品在线分离、酶解、肽段分离鉴定和定量分析。采用质量比为1∶1的轻、重标记的蛋白质样品考察该平台的定量性能,发现蛋白质水平二甲基化标记效率为90%;蛋白质经hIMER在线酶解10 min产生的漏切及酶解产物在hIMER柱上的非特异性吸附对定量准确度的影响较小,所有定量到的重/轻标记的蛋白质质量比的平均值为1.01。最后将该平台应用于小鼠腹水型肝癌淋巴道高、低转移细胞系差异蛋白质的分析,发现了12种蛋白质在高转移细胞系中低表达,15种蛋白质在高转移细胞系中高表达。以上结果证明了该平台可以实现高准确度和高通量的蛋白质组定量分析。
周愿
张珅
袁辉明
张丽华
张玉奎
关键词:
定量蛋白质组学
基于化学修饰和同位素标记多肽氨基酸序列从头测序方法
本发明涉及一种基于化学修饰改性和同位素标记的多肽氨基酸序列从头测序方法。利用N端和C端标记后的多肽分子质量以及保留时间的相关性,将不同标记的相同多肽的二级质谱图进行关联。利用不同标记样品中多肽在质谱碎裂过程中形成的N端和...
张丽华
单亦初
张珅
陈玲凡
张玉奎
文献传递
一种双通道SPE柱及其在定量蛋白质组学的应用
本发明涉及一种可实现蛋白质定量分析前处理全过程的新型固相萃取(SPE)装置,该装置利用隔板将SPE管分隔为两个等体积的腔室,装填色谱填料后,可原位实现蛋白质样品变性、还原、烷基化、酶解、同位素标记和混合等定量蛋白质组学中...
张丽华
周愿
赵群
张珅
杨开广
张玉奎
文献传递
等重二甲基化标记蛋白质定量方法
本发明涉及了一种新的蛋白质定量方法-等重二甲基化标记定量法,该方法利用甲醛和氰基硼氢化钠及其各自的同位素形式进行有机组合,对肽段进行标记,使得肽段在质谱的一级谱上具有相近质荷比而在二级谱上具有不同质荷比,从而在二级谱上实...
张丽华
周愿
单亦初
杨开广
吴琪
张珅
张玉奎
文献传递
一种基于二级质谱的全离子监测定量方法
本发明涉及一种基于二级质谱的全离子监测定量方法,该方法包括质谱数据采集和质谱数据处理两部分。质谱数据采集是通过将肽段液相分级和质谱气相分级技术相结合,并采用无动态排除的数据依赖性质谱扫描模式进行质谱数据的采集,从而实现对...
张丽华
赵群
单亦初
张珅
杨开广
张玉奎
文献传递
基于两端非等重标记的蛋白质氨基酸序列从头测序方法
本发明涉及一种基于多肽两端非等重稳定同位素标记的蛋白质氨基酸序列从头测序方法。以胞内蛋白酶赖氨酸‑C对变性还原烷基化后的蛋白质进行酶切,形成含有N端α‑氨基和C端赖氨酸侧链ε‑氨基的肽段。样品分成两份后,使用含有不同同位...
张丽华
单亦初
张珅
吴琪
张玉奎
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