董辉
- 作品数:2 被引量:16H指数:1
- 供职机构:浙江大学农业与生物技术学院农学系更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆被引量:15
- 2005年
- 采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长 16 11bp的cDNA序列 ,以此为信息探针搜索HTGs数据库 ,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列———OSJNBa0 0 5 7G0 7克隆。用FGENESH分析该克隆中的联配区域得到一个包含 14个外显子和 13个内含子的基因。该基因位于水稻第 3染色体物理图谱的 136 .0~ 137.6cM区域。推导的ORF编码 4 98个氨基酸 ,经BLASTP搜索SWISS -PROT数据库和蛋白序列的亚细胞定位显示 ,该基因编码水稻的线粒体丝氨酸羟甲基转移酶 (mSHMT)。该基因受到EST序列的完全支持 ,其中不乏来自盐胁迫、稻瘟病菌侵染等逆境处理的EST序列 ,推测该基因与水稻对逆境的应答反应有关。
- 刘庆坡冯英董辉
- 关键词:水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶电子克隆EST逆境
- 转座因子对水稻同义密码子使用偏性的影响被引量:1
- 2004年
- 利用635个包含完整转座因子插入的粳稻CDS序列,对转座因子如何影响基因编码区的碱基组成及基因的表达水平,进而对基因同义密码子的使用偏性产生影响进行了详细分析。结果表明:转座因子插入极显著地影响到基因编码区的同义密码子使用但并非唯一因素;转座因子对不同基因的表达水平具有多重影响,有的基因表达被抑制,有的反而增强,但总的来说它减少了基因表达水平对同义密码子使用的影响程度。
- 刘庆坡董辉
- 关键词:水稻转座因子同义密码子