钱晓茵
- 作品数:15 被引量:190H指数:6
- 供职机构:复旦大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学文化科学更多>>
- 水稻中一个LRR-RLK基因OsInlk2的克隆与表达分析被引量:1
- 2006年
- 富含亮氨酸重复序列的类受体蛋白激酶(LRR-RLKs)在植物的生长发育过程中起到非常重要的作用,如细胞识别,抵抗病原体的入侵以及自交不亲和反应.现已克隆了一个水稻LRR-RLK基因OsInlk2,并对它进行了序列和表达分析,结果表明OsInlk2由三个部分组成,即胞外LRR结构域,跨膜区域和蛋白激酶区域.种内变异分析表明OsInlk2在籼稻中表达,而在粳稻中却不表达.另外组织表达分析表明OsInlk2在茎和幼穗中的表达量很高,而在叶片和根中的表达量较低.对珍汕97B三叶期幼苗进行盐胁迫和冷胁迫,结果表明随着NaCl浓度的提高,OsInlk2的表达呈先减后增的趋势;4℃低温处理8 h,该基因的表达量比对照降低,但随着处理时间的延长,表达量却急剧上升.
- 张青华李克贵何光明卫春钱晓茵苏伟洪芳杨金水
- 关键词:种内变异组织特异表达盐胁迫冷胁迫水稻
- 从小基因组到大基因组
- 钱晓茵
- 关键词:水稻高粱植物遗传学物理图谱基因组
- 一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆
- 1998年
- 一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆胡建广袁自强赵相山钱晓茵程宁辉杨金水(复旦大学遗传学研究所,上海200433)杂交玉米在生长势、抗逆性与产量性状等方面表现明显的超亲优势,这涉及到杂种一代的亲本基因表达方式发生改变。我们以玉米杂种一代增强表达的基因...
- 胡建广袁自强赵相山钱晓茵程宁辉杨金水
- 关键词:杂种一代玉米开放阅读框普通烟草
- 水稻凋亡基因rPDCD5的克隆和表达分析被引量:13
- 2004年
- 从水稻愈伤组织抑制消减杂交 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)文库中分离出一个PCD相关基因的EST片段 ,根据水稻基因组的序列设计引物 ,从汕优 6 3中分离与克隆出rPDCD5的全长cDNA。rPDCD5包含387bp的可译框 ,编码由 12 8个氨基酸构成的蛋白质。序列比对分析显示 ,该检测的蛋白质与已知PDCD5的高度同源。半定量实时PCR分析证实了该基因在环境因子 (低温处理和NaCl处理 )
- 米丽萍卫春黄俊生杜喜玲钱晓茵李克贵申国安杨金水
- 关键词:程序性细胞死亡凋亡
- 从小基因组到大基因组——水稻,高粱物理图谱之比较
- 该论文以高粱连锁群C(Linkage Group C,LG-C)及其在水稻中的相关区段为目的的区段,旨在对高粱和水稻的基因组构成进行比较,并着重于高粱物理图谱的间隙,试图利用基因组规模相对较小的水稻BAC克隆来填补这些间...
- 钱晓茵
- 关键词:水稻高粱基因组克隆
- 文献传递
- 应用抑制差减杂交法分离水稻幼穗发育早期特异表达的基因被引量:68
- 2000年
- 以水稻茎尖分生组织(shoot apical meristem, SAM)为对照群体,幼穗分生组织(primary andsecondary branch primordia, Pb/Sb)为目标群体,进行抑制差减杂交.用经过SAM cDNA差减的Pb/Sb cDNA群体构建了一个差减文库通过差示筛选鉴定了 40个在Pb/Sb中特异表达或表达增强的候选克隆.Northern杂交验证,至少40%的候选克隆代表了在Pb/Sb中特异表达或表达增强的基因,同时,相当一部分克隆为低丰度转录本.对40个cDNA克隆单向测序后,与GenBank中同源序列进行比较,结果表明:2个克隆为已知水稻基因;11个克隆与已知基因的同源性为60%~90%;另有18个克隆在GenBank中无法查到对应的同源基因,可能代表了新基因,或是由于序列位于变异丰富的3'端故而无法查到与其他物种基因的同源性.目前为止,已有19个基因在GenBank注册并获登录号.
- 刘军袁自强刘建东钱晓茵钱旻杨金水
- 关键词:抑制差减杂交差异表达基因水稻幼穗发育
- 一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆被引量:15
- 1998年
- 采用DD PCR方法比较玉米杂种一代及其亲本苗期基因表达产物mRNA的差异 ,分离并鉴定出一个玉米杂种一代超亲表达的cDNA .以该cDNA为探针从cDNA文库中筛选到一个全长的cDNA克隆 (ZH0 1) .ZH0 1长 1780bp ,5′端非编码区 112bp ,3′端非编码区 395bp ,开放阅读框共编码 4 14个氨基酸 .序列同源比较表明 ,ZH0 1为一个亲的玉米转译起始因子eIF4A基因家族成员 .
- 胡建广赵相山袁自强钱晓茵程宁辉杨金水
- 关键词:杂种优势玉米基因克隆
- 水稻功能基因的电子克隆策略被引量:51
- 2002年
- 电子克隆是随着基因组计划和 EST计划实施发展起来的 ,利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法。已经公布的水稻基因组序列框架图 ,使得水稻的电子克隆路线得以实施。介绍了水稻电子克隆的基本原另、应用实例、相关的生物信息资源。
- 黄骥张红生曹雅君钱晓茵杨金水
- 关键词:水稻电子克隆生物信息学功能基因
- 水稻rARF基因的克隆和鉴定水稻功能基因的电子克隆
- 植物生长素应激因子ARF(Auxin Reponse Factor)家族是植物中起源较早的一类基因.1997年,第一个ARF基因在拟南芥中被克隆,命名为ARF1,此后T.Ulmasov小组利用同源区段非严紧杂交相继在cD...
- 钱晓茵
- 关键词:水稻植物生长素应激因子基因表达
- 文献传递
- 两个水稻MADS盒基因cDNA的克隆与分析被引量:2
- 2000年
- 为研究水稻MADS盒基因与形态发生的关系,采用一个MADS盒基因家族保守区域特异的引物,运用RT-PCR方法,从水稻珍汕97B的幼穗中分离和克隆了两个新的MADS盒cDNA,命名为nmads1和nmads3。基因序列分析表明,nmads1和nmads3都含有植物MADS盒基因典型的MIK区结构,其中nmads1属于MADS盒基因的GLO亚家族,nmads3属于AGL2亚家族。分子杂交实验发现,nmads1和nmads3在水稻愈伤组织分化期和幼穗期活跃表达,在营养生长阶段的苗期表达受抑制,并发现处在同一发育阶段的水稻幼穗中,核质互作雄性不育系珍汕97A比其保持系珍汕97B多出了一个特异表达的nmads1的基因产物。
- 袁自强钱晓茵刘军刘建东钱旻杨金水
- 关键词:MADS盒基因水稻CDNA克隆