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云南蝙蝠轮状病毒的分离与鉴定被引量：5: 2013年; 蝙蝠是携带人兽共患病毒最多的一种哺乳动物,调查蝙蝠携带病毒的病原生态学本底对防范蝙蝠病毒威胁人类健康具有重要意义。本研究采集云南省部分地区蝙蝠进行病毒宏基因组学分析,在一组食虫蝙蝠样品中发现了A群轮状病毒(Group A rotaviruses,RVA)序列,经过进一步RT-PCR筛查验证及病毒的分离鉴定,最终从勐远县的1只三叶蹄蝠中分离出一株轮状病毒。扩增该毒株的VP7与VP4基因进行分型与系统进化分析,结果表明其VP7基因为G3型,与来自阿根廷的1株马轮状病毒的同源性最高,为93%;其VP4基因为P[10]型,与来自泰国的1株人轮状病毒同源性最高,为94.8%。通过与本实验室之前分离的首株蝙蝠G3P[3]型轮状病毒MSLH14的比较,确定该毒株为一株新的蝙蝠轮状病毒,命名为RVA/Bat-tc/MYAS33/2013/G3P[10],简称MYAS33。本研究结果进一步证明了蝙蝠轮状病毒的多样性,突显了蝙蝠作为轮状病毒潜在宿主的重要性。; 夏乐乐何彪胡挺松张文东王意银徐琳李楠邱薇余静范泉水张富强涂长春; 关键词：蝙蝠轮状病毒系统进化分析

云南一种新型蝙蝠博卡病毒的鉴定与分析被引量：3: 2016年; 目的进一步发现云南新型蝙蝠病毒,并鉴定云南省蝙蝠携带博卡病毒(bocavirus)的遗传多样性。方法对采自景洪市的26只三叶蹄蝠进行了病毒宏基因组学分析,根据其结果对博卡病毒进行了PCR检测和全基因分析。结果与结论根据检测结果,从3只(11.5%)蝙蝠的肠道中发现了一种新型博卡病毒;通过全基因组扩增和分析,发现该病毒全长5203 nt,编码NS1、NP和VP1/VP2蛋白,分析显示该病毒NS1和VP1基因分别与博卡病毒代表种犬博卡病毒(canine bocavirus)1和犬微小病毒(canine minute virus)有最高的氨基酸序列相似性,达到58.7%和53.3%。依据国际病毒分类委员会病毒新种判断标准,NS1蛋白基因氨基酸序列相似性低于85%,为博卡细小病毒属新种,因而该病毒是一新博卡病毒种;该研究为进一步了解我国蝙蝠携带病毒的多样性提供了参考,同时为研究博卡病毒的宿主范围和进化关系提供了重要的基础数据。; 李兴宇陈刚夏乐乐周卫国徐琳余静邱薇张富强范泉水涂长春胡挺松何彪; 关键词：蝙蝠博卡病毒进化分析

蝙蝠轮状病毒的分离与鉴定: 蝙蝠是许多病毒的重要储存库，能携带和传播多种人兽共患病毒。本研究对中国云南省108只食虫蝙蝠肠道组织样品进行病毒宏基因组学分析，发现了100条序列注释到了A群轮状病毒(RVA)。经过进一步RT-PCR筛查及细胞分离，获得...; 夏乐乐何彪杨凡力涂长春

中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析被引量：15: 2013年; 蝙蝠携带有60多种病毒,其中许多对人有高度致病性。为了解中国蝙蝠携带病毒的自然本底、蝙蝠病毒的多样性和挖掘潜在的病毒病原,通过基于Solexa高通量测序的病毒宏基因组学技术对从吉林、云南、湖南采集的蝙蝠组织进行病毒组学研究,获得了11 644 232条读长(Reads),并拼接出44 872条重叠序列(Contig)。通过核酸序列注释发现,其中8.2%(4 002/44 872)的重叠序列与病毒相关,能进一步注释到36个病毒科,包括19种脊椎动物病毒、6种植物病毒、4种昆虫病毒和4种噬菌体。通过对重叠序列的遗传进化分析、多序列比对显示,被注释为细小病毒、腺联病毒、博卡病毒、腺病毒、小双节RNA病毒等的重叠序列与已知病毒相似,部分序列却又呈现出明显的序列差异。通过对腺病毒和博卡病毒进一步的PCR扩增证实了此研究方法可靠。旨在了解我国蝙蝠携带病毒组的构成,对建立高效的野生动物源人兽共患病的监测方法提供参考。; 杨凡力王意银郑文成何彪江廷磊李莹莹夏乐乐冯烨范泉水涂长春; 关键词：蝙蝠高通量测序

蝙蝠轮状病毒分离与鉴定: 蝙蝠因能携带和传播多种人兽共患病毒,在病原生态学上具有重要意义。为了了解我国蝙蝠携带病毒情况,本研究对采自云南省不同种类蝙蝠进行病毒宏基因组学研究,发现了轮状病毒序列。通过泛轮状病毒RT-PCR方法,检测到两份阳性蝙蝠肠...; 夏乐乐何彪杨凡力徐琳涂长春; 关键词：蝙蝠轮状病毒; 文献传递

蝙蝠轮状病毒分离与鉴定: 蝙蝠因能携带和传播多种人兽共患病毒,在病原生态学上具有重要意义.为了了解我国蝙蝠携带病毒情况,本研究对采自云南省不同种类蝙蝠进行病毒宏基因组学研究,发现了轮状病毒序列.通过泛轮状病毒RT-PCR方法,检测到两份阳性蝙蝠肠...; 夏乐乐何彪杨凡力徐琳涂长春; 关键词：人兽共患病轮状病毒细胞分离基因鉴定; 文献传递

Shotgun质谱筛选与猪瘟病毒囊膜蛋白E^rns相互作用的候选宿主蛋白: 2013年; 猪瘟病毒(CSFV)Erns蛋白是瘟病毒属成员特有的囊膜糖蛋白,在病毒吸附和侵入靶细胞过程中发挥重要作用。本研究利用Erns特异性抗体对CSFV石门强毒株感染的PK-15细胞进行免疫共沉淀(Co-IP),对获得的蛋白复合物进行Shotgun质谱鉴定。结果显示,与阴性对照相比,病毒感染细胞样品中含有199种差异蛋白,其中可能包含与Erns作用的宿主细胞蛋白。同时,实验还对Co-IP蛋白样品进行SDS-PAGE,切取差异条带进行质谱分析以进一步验证Shotgun技术的蛋白筛选结果。通过Co-IP和Shotgun质谱分析,本研究筛选出一些可能在CSFV生命周期中与Erns互作用的宿主蛋白,为进一步研究CSFV在宿主细胞中的感染和复制的分子机制奠定基础。; 尹凝蒋大良龚文杰郭焕成谢金鑫夏乐乐余兴龙涂长春; 关键词：猪瘟病毒蛋白质相互作用 SHOTGUN

蝙蝠轮状病毒分离与鉴定: 蝙蝠因能携带和传播多种人兽共患病毒,在病原生态学上具有重要意义。为了了解我国蝙蝠携带病毒情况,本研究对采自云南省不同种类蝙蝠进行病毒宏基因组学研究,发现了轮状病毒序列。通过泛轮状病毒RT-PCR方法,检测到两份阳性蝙蝠肠...; 夏乐乐何彪杨凡力徐琳涂长春; 关键词：蝙蝠轮状病毒; 文献传递

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夏乐乐