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一种与肉鸡生长性状相关的分子标记选育肉鸡的方法及其应用: 本发明属于生物分子标记技术领域，具体涉及一种与肉鸡生长性状相关的分子标记选育肉鸡的方法及其应用，该方法具体的为：(1)提取被检肉鸡血液DNA；(2)以被检肉鸡的基因组DNA为模板，根据目的基因引物SMOX和内参基因引物V...; 饶友生王樟凤盛文涛柴学文

一种利用快大型白羽肉鸡和隐性白羽洛克鸡培育隐性白羽品系的方法: 本发明公开了一种利用快大型白羽肉鸡和隐性白羽洛克鸡培育隐性白羽品系的方法，涉及生物技术领域。该方法包括以下步骤：选择得到同时为Ii基因型和cc基因型的快大型白羽肉鸡公鸡个体，以及同时为ii基因型和cc基因型的隐性白羽洛克...; 许继国许桥崔芳芳周敏贡继尚柴学文陈春燕王海波孙雪梅

芦笋叶绿体基因组序列微卫星分布规律研究被引量：4: 2017年; 利用NCBI数据库收录的芦笋(Aaparagus officinalis L.)叶绿体基因组序列,对其序列中的微卫星分布规律进行分析。结果发现,芦笋叶绿体基因组中共有81个微卫星,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区,分别占总数的66.7%和23.4%,且分布类型以单碱基和二碱基为主。在单碱基微卫星中,又以A/T重复为主,二者共占微卫星类型总数的55%。单碱基微卫星的重复次数以10~12次为主,二碱基微卫星的重复次数以5~6次为主。研究结果为开发天门冬属植物叶绿体通用引物提供了理论依据。; 盛文涛柴学文邹家华饶友生; 关键词：芦笋叶绿体基因组微卫星

芦笋叶绿体基因组序列与系统进化位置分析: 芦笋是一种重要的药食同源性保健型蔬菜。为了探明芦笋在天门冬科中的进化位置,通过Hiseq4000高通量测序对栽培芦笋品种Atlas雄株进行测序,并选取天门冬科中的42种植物进行叶绿体基因组的进化分析。芦笋叶绿体基因组结构...; 盛文涛柴学文饶友生杜尚广; 关键词：芦笋叶绿体基因组系统进化; 文献传递

野生稻种质在水稻抗虫育种上的研究及应用进展: 2016年; 本研究综合了国内外抗虫研究相关文献,主要介绍了野生稻在抗褐飞虱、白背飞虱与灰飞虱抗虫基因的遗传定位与克隆,以及在常规育种、单个抗虫基因分子标记辅助育种、多个抗性基因聚合育种上的研究进展,并讨论了野生稻优异抗虫基因在水稻遗传育种上存在的问题和发展建议。; 盛文涛柴学文饶友生; 关键词：野生稻抗虫基因遗传育种

甜叶菊EST序列特征分析与分子标记开发被引量：1: 2019年; 为了明确甜叶菊EST序列中SSR的总体特点,开发甜叶菊EST-SSR分子标记,为利用EST-SSR标记开展甜叶菊分子遗传研究提供科学依据。本研究从NCBI数据库中下载获得了5 646条EST序列,利用在线软件SSRtool和Websat检测所含SSR位点进行分析。结果共检索出88个SSR位点序列,分布于79条EST序列中,检出率为1.6%。其中,六核苷酸重复基元的EST-SSR占主导地位,占总SSR数目的 63.7%。利用在线软件Primer 3.0设计了62对EST-SSR引物,经筛选验证获得了多态性较好的引物32对,表明通过甜叶菊EST序列开发SSR标记是可行的。; 盛文涛邓建兰饶友生柴学文邹鑫; 关键词：甜叶菊 NCBI 多态性 EST-SSR

一种鉴别慢羽公鸡慢羽基因座基因型的方法: 本发明公开了一种鉴别慢羽公鸡慢羽基因座基因型的方法，属于生物育种领域。本发明以已知基因型的慢羽杂合子和慢羽纯合子为材料，通过直接测序后对SNP位点的测序结果进行解析，结果显示：若解析结果为“R”则判定为慢羽纯合子，若是G...; 许继国贡继尚柴学文涂序堂崔芳芳马荆鄂占雅婷陈春燕

鸡基因组差异表达基因翻译起始密码子上下游序列的比较研究: 2014年; 翻译起始调控是基因表达调控的一个关键步骤之一。本文以鸡为研究材料,比较研究了鸡基因组高表达基因和低表达基因翻译起始密码子上下游的碱基序列差异,旨在寻找影响鸡基因表达水平的特异性调控位点。全部3 020个单剪接基因完整的mRNA序列及有详细注释的5'UTRs序列从Ensembl下载。编写计算机程序,读取每个基因mRNA起始密码子上下游各位点的碱基。研究发现,起始密码子上游-3、-2位点可能是鸡基因组基因表达起始密码子正确识别的关键位点。起始密码子上下游的碱基组成分析发现,高表达基因和低表达基因起始密码子的上游均倾向使用(G+C),高表达基因的使用偏倚尤为强烈。序列差异比较发现,高表达基因在-9、-6、-3、+4位点显著偏向G,在-1、-2、-4、-5位点显著偏向C。低表达基因起始密码子上游使用A、U的频率显著高于低表达基因。在-19位点强烈偏向A,在+1、+11、+14位点强烈偏向U。; 王樟凤卓亮亮黄子琦柴学文饶友生; 关键词：基因表达调控起始密码子

鸡Z染色体基因表达的密码子偏性被引量：6: 2010年; 从NCBI数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载鸡Z染色体上全部基因完整的cDNA,最终共有626个基因的CDS序列纳入统计分析.使用CodonW(1.4.2)进行密码子偏性分析,确定了CGG、AGC、UGC等26个密码子为Z染色体基因表达的"最优"密码子.对应分析表明,影响鸡Z染色体基因表达的密码子偏性的主要因素分别为GC3s、基因的表达丰度、GC含量、CDS长度及氨基酸的疏水性.鸡Z染色体基因表达的密码子用法受到了核苷酸组成偏好的显著影响,这种核苷酸组成偏好很可能是突变偏畸、固定偏畸及基因转换导致的.对于鸡这种群体有效规模较大的群体,密码子的偏性更有可能是核苷酸组成偏好及选择等因素综合作用的结果.; 饶友生梁菲菲王樟凤柴学文张细权; 关键词：Z染色体密码子偏性

辣椒EST资源的SSR信息分析被引量：3: 2019年; 为了在辣椒中开发EST-SSR功能性标记,对来源于NCBI公共数据库中EST序列进行简单重复序列搜索,共获得了非冗余序列110 396条和6 182个EST-SSR,平均每相隔11.23 kb/SSR。在所有的650种重复基序中,二核苷酸重复基序的SSR所占比例最高为45.6%,其次是三核苷酸(30.2%)和六核苷酸(16.3%)。其中,GA/TC出现的频率最高有767次,占全部重复基序的12.41%(767/6 182)。在收集获得的6 182个EST-SSR位点中,共设计出5 874对引物,并随机合成了30对引物进行SSR位点扩增,其中27对扩增出产物;24对有清晰的目标扩增条带,占引物总数的80%;且所检测出的辣椒等位基因数量丰富,平均4.93个/对。这些EST-SSR标记的开发,将有助于辣椒分子遗传的研究。; 盛文涛邓建兰饶友生柴学文尧云萍; 关键词：NCBI EST-SSR 等位基因

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