王晓雷
- 作品数：5 被引量：7H指数：1
- 供职机构：上海交通大学更多>>
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- 相关领域：理学自动化与计算机技术环境科学与工程更多>>
- 一种用于生物医学的全链条数据分析系统
- 本发明涉及一种用于生物医学的全链条数据分析系统，包括与个人中心模块分别连接的用户管理系统、仓储管理系统和在线分析系统，仓储管理系统包括代码仓储模块、软件仓储模块和数据仓储模块，在线分析系统设有工作流应用发布子系统，调用代...
- 吕晖张悦宁任永永程志伟李磊杰顾坚磊王晓雷
- 文献传递
- 漆酶与酚类模式底物的结合及反应活性的理论研究被引量：7
- 2014年
- 通过生物信息学分析、分子动力学模拟及量子化学计算,对21种邻对位取代酚类模式底物与漆酶的结合能力以及反应活性进行了探讨.生物信息学结构比对分析发现漆酶的活性口袋含有Asp/Glu206,Asn/His208,Asn264,Gly392和His458等保守的氨基酸残基(氨基酸残基编号以Trametes versicolor漆酶为例,PDB:1KYA);采用MM-GBSA方法计算了21种酚类模式底物与T.versicolor漆酶的结合自由能.分子力学计算结果表明,漆酶与底物的结合力主要来自Asp206和Asn264等残基与底物分子形成的分子间氢键,并且Phe265残基和酚类底物的芳香环形成π-π相互作用.量子化学计算表明,芳环上取代基的推拉电子效应显著影响协同电子转移的底物去质子化过程,其中推电子能力较强的—NH2,—OH,—OCH3和—CH CHCH3等基团能够明显增强酚羟基反应活性,而吸电子的—CONH2和—Cl则具有相反的效应.
- 齐艳兵朱吉人孙尧金杜芸褚建君石婷赵一雷王晓雷
- 关键词：漆酶反应活性分子力学量子化学
- 基于同分异构体底物的漆酶催化氧化分子机制研究
- <正>由于漆酶催化氧化反应利用空气中的氧气作为电子受体,不需要添加过氧化氢,因此在生物降解环境有机污染物方面具有很大的应用潜力。我们运用高阶量子力学计算和反应动力学分子光谱分析的手段[1-2],对两种植物酚类的同分异构体...
- 王晓雷赵一雷
- 关键词：漆酶反应机理酚类化合物
- 文献传递
- 恶臭假单胞菌S16尼古丁降解途径中酰胺水解酶的底物选择性研究
- <正>在烟草废弃物有机污染物微生物降解中,恶臭假单胞菌S16尼古丁吡咯降解途径关键酶N-甲酰马来酰胺酸去甲酰基酶(Nfo)和马来酰胺脱酰胺酶(Ami)分别负责进入主代谢三羧酸循环系统前的两步脱氮反应。我们对该微生物代谢途...
- 王晓雷陈启华吴更许平赵一雷
- 关键词：酰胺水解酶
- 文献传递
- 一种用于生物医学的全链条数据分析系统
- 本发明涉及一种用于生物医学的全链条数据分析系统，包括与个人中心模块分别连接的用户管理系统、仓储管理系统和在线分析系统，仓储管理系统包括代码仓储模块、软件仓储模块和数据仓储模块，在线分析系统设有工作流应用发布子系统，调用代...
- 吕晖张悦宁任永永程志伟李磊杰顾坚磊王晓雷
