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环五肽的合成方法及其在抗丙肝药物中的应用: 本发明提供了一种环五肽，其氨基酸序列为：环‑5‑天冬氨酸‑谷氨酸‑精氨酸‑酪氨酸‑精氨酸。本发明提供的环五肽抑制剂具有良好的结构稳定性，能够与p7通道蛋白高效结合，有效发挥抗丙肝病毒的功效。; 王树青董卫莉魏树琨欧阳波周界文; 文献传递

噻唑啉酮类衍生物及其药物组合物与应用: 本发明公开了一类化学结构如通式（I）所示的5-取代亚甲基-4-噻唑啉酮类化合物或其药学上可接受的盐，其中R1、R2、R3的定义同说明书的定义。本发明同时也...; 董卫莉王润玲岳海王树青邓治荣; 文献传递

环五肽的合成方法及其在抗丙肝药物中的应用: 本发明提供了一种环五肽，其氨基酸序列为：环‑5‑天冬氨酸‑谷氨酸‑精氨酸‑酪氨酸‑精氨酸。本发明提供的环五肽抑制剂具有良好的结构稳定性，能够与p7通道蛋白高效结合，有效发挥抗丙肝病毒的功效。; 王树青董卫莉魏树琨欧阳波周界文; 文献传递

芳香族酰亚胺类化合物及其制备方法与应用: 本发明公开了一类化学结构如通式（Ⅰ）所示的芳香族酰亚胺类衍生物，及其制备方法和抗癌活性,其中R1，R2的定义同说明书的定义。所述部分化合物具有较好抗癌活性，作为一类新型化合物，...; 董卫莉蔡文玺王树青王润玲; 文献传递

5-取代亚甲基-4-噻唑啉酮类衍生物及其药物组合物与应用: 本发明公开了一类化学结构如通式（I）所示的5-取代亚甲基-4-噻唑啉酮类化合物或其药学上可接受的盐，其中R1、R2、R3的定义同说明书的定义。本发明同时也...; 董卫莉王润玲岳海王树青邓治荣; 文献传递

芳香族酰亚胺类化合物及其制备方法与应用: 本发明公开了一类化学结构如通式（Ⅰ）所示的芳香族酰亚胺类衍生物，及其制备方法和抗癌活性,其中R1，R2的定义同说明书的定义。所述部分化合物具有较好抗癌活性，作为一类新型化合物，...; 董卫莉蔡文玺王树青王润玲; 文献传递

PPARs泛激动剂设计、分子对接及分子动力学模拟研究: 2013年; 目的:得到治疗效果好,副作用小的PPAR泛激动剂。方法:用core hopping的方法对LY465608中间链部分和尾链部分进行结构替换。得到新的化合物并与3个蛋白质受体进行分子对接。应用分子动力学模拟先导化合物与PPAR-α、β、γ受体的相互作用情况。基于Lipinski’s rule of five,对得到的先导化合物进行ADME预测。结果:对接结果表明得到的目标化合物能与PPAR-α、β、γ活性位点区域的氨基酸残基形成氢键,使AF-2螺旋稳定于激活构象。分子动力学模拟结果表明模拟过程中受体与激动剂复合物体系是稳定的。ADME预测发现它们体内的吸收、分布、代谢和排泄情况符合作为药物的一般特点。结论:得到的8个化合物可以作为PPAR泛激动剂予以进一步的研究。; 张立松王树青王润玲程先超徐为人; 关键词：分子对接分子动力学

基于神经氨酸酶结构的流感病毒抑制剂的计算机辅助药物设计被引量：2: 2013年; 目的:虚拟筛选更高活性的神经氨酸酶(NA)抑制剂,提高抵抗变异病毒的能力,为以后相关疾病治疗新药的设计提供科学依据。方法:利用Schrodinger Suite2009中的Glide模块对Leadnow数据库进行高通量虚拟筛选,对选出的结构用"Core Hop-ping"模块改造结构;利用Desmond2.4软件包进行分子动力学模拟研究,将NA的空载蛋白及靶点与筛选结果较好的配体小分子复合物共3个模型分别进行10 ns的分子动力学模拟。结果:高通量虚拟筛选得到一个五元环结构的化合物ZINC13219479,并以此为核心向150-cavity延伸,得到8个能很好进入的结构。建立了靶向这些位点的配体库,方便后续有关研究的进行。分子动力学结果表明模拟过程中各靶点与配体复合物体系稳定,结合位点正确。作为抑制剂,小分子配体与NA酶的150-cavity区域残基形成稳定的氢键作用,牢牢占据NA的催化位点。结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与NA的结合能力理论上优于抑制剂达菲。在动力学模拟这些化合物后,更加确定了这些化合物的有效性,具有一定的科研价值。; 刘磊马英王润玲王树青徐为人; 关键词：神经氨酸酶计算机辅助药物设计达菲

PPAR α/γ双重激动剂的设计及分子动力学研究: 2012年; 目的:设计PPARα/γ双重激动剂,提高其降糖活性,为以后相关疾病的治疗提供科学的方法和依据。方法:应用Schrodinger Suite 2009中的Glide模块对drug-like数据库进行高通量虚拟筛选,对筛选出的结构利用"Core Hopping"模块进行修饰,利用Gromacs 4.0软件包进行分子动力学模拟研究,将PPARα/γ的空载蛋白及其与选出的配体小分子复合物体系分别进行10 ns的分子动力学模拟,最后应用Qikprop模块做ADME(吸收、分布、代谢、排泄)预测来推测这些化合物的成药可能性。结果:设计出一系列新的PPARα/γ双重激动剂。用分子对接方法和分子动力学模拟分析了新激动剂和PPARα/γ的相互作用机制,与临床应用的激动剂ragalitazar相比有更好的结合能力。通过ADME预测得出设计出的化合物均符合类药5原则。结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与PPARα/γ的结合能力理论上优于激动剂ragalitazar。预期这些化合物可能成为新的治疗2型糖尿病的目标化合物。; 王业柳马英王润玲王树青徐为人; 关键词：PPAR 药物设计分子动力学 ADME

糖原合成酶激酶3β活性调节机制的分子动力学模拟被引量：1: 2012年; 目的:探讨研究糖原合成酶激酶(GSK-3β)的活性调节机制。方法:利用Desmond 9.0软件对GSK-3β-轴素复合物和GSK-3β-FRATtide复合物进行分子动力学模拟研究。结果:与GSK-3β-轴素复合物相比,在GSK-3β-FRATtide复合物中,Lys205同Glu211、Asn213之间的氢键作用消失,Lys205与Glu211不能形成稳定的盐键;FRATtide的Arg219与GSK-3β的Asp264,GSK-3β的Gly259与Arg220之间能形成稳定的氢键。此外,Phe67和Phe93显示出位置的偏移。这些都将导致GSK-3β活性环的构象变化进而抑制GSK-3β的催化活性。结论:GSK-3β的活性调节是通过改变其活化环构象来实现的。; 胡鳞方刘梦源董卫莉徐为人王树青王润玲; 关键词：糖原合成酶激酶-3Β WNT信号通路分子动力学模拟

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王树青