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薛明: 作品数：45 被引量：198H指数：10; 供职机构：广东海洋大学水产学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学文化科学环境科学与工程更多>>

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水产养殖用蛭弧菌类生物制剂的检测被引量：10: 2009年; 通过双层平板法以不同细菌为宿主测定了8个厂家蛭弧菌类生物制剂的噬斑含量及噬斑分离物的宿主裂解范围;以3对靶向不同类群蛭弧菌类生物的特异引物对各产品及其噬斑分离物进行了PCR检测;对两株代表性蛭弧菌分离物的16S rRNA基因进行了测序,并通过构建蛭弧菌科进化树分析了它们的系统地位。结果表明,被检测的8个蛭弧菌类生物制剂中有6个质量明显不合格,仅两个样品被蛭弧菌科特异引物检测为阳性,被双层平板法证实有噬斑出现。其中一个样品JSF中存在两种形态和宿主范围不同的噬斑分离物,且不同宿主菌计数结果存在明显差异。16S rRNA基因序列分析表明这两种噬斑分离物JSF1和JSF2,分别属于蛭弧菌科的类群1(噬菌蛭弧菌)和未定种的类群5。但另一样品的噬斑分离物则被证实为非蛭弧菌类生物。; 温崇庆薛明张金燕黄瑜周世宁; 关键词：水产养殖微生物制剂 RRNA基因

基于分离培养和高通量测序分析一种自然发酵饲料的微生物组成: 2023年; 为揭示一种对虾养殖用自然发酵饲料的微生物组成,通过MRS、营养肉汤(NB)、豆芽汁(BSJ)平板分别计数其微生物含量,并对分离代表菌株16S rRNA或5.8S-ITS基因进行测序分析和鉴定;分别利用高通量测序16S rDNA V4区和ITS2区研究发酵饲料细菌和真菌菌群的多样性。分离培养结果表明:MRS、NB和BSJ平板对发酵饲料乳酸菌、细菌和酵母菌的计数结果分别为4.80×10^(7)、5.00×10^(6)、3.95×10^(6) cfu/g;从分离代表菌中鉴定出3种芽孢杆菌,4种分别属于慢生乳杆菌属、宿主关联乳杆菌属、干酪乳酪杆菌属和黏液乳杆菌属的乳酸菌,以及1种酵母菌库德毕赤酵母。高通量测序分析表明:乳杆菌科在发酵饲料细菌群落中占绝对优势,并包含20个分类操作单元(OTU)和9个属,其中乳杆菌属和黏液乳杆菌属相对丰度分别为66.95%和3.36%;假单胞菌科、依格纳季氏菌科和微杆菌科分别为第2、第3和第4优势科,其下的假单胞菌属、食肉蝇单胞菌属、假棍状杆菌属相对丰度分别为11.81%、10.16和3.58%;真菌群落中毕赤酵母科占绝对优势,其次为丝孢酵母科,两者分别完全由毕赤酵母属和丝孢酵母属构成,相对丰度分别为85.73%和12.54%。综上,该自然发酵饲料中富含乳酸菌、芽孢杆菌和毕赤酵母等有益活菌,且乳酸菌种类丰富。; 梁国健洪居恳丁茂昌薛明陈伟哲梁华芳温崇庆; 关键词：发酵饲料高通量测序酵母菌芽孢杆菌

湛江海水虾池免培养蛭弧菌类生物的多样性被引量：3: 2015年; 【目的】揭示湛江地区海水虾池蛭弧菌类生物(Bdellovibrio-and-like organisms,BALOs)多样性特点,为了解BALOs在虾池生态系统中的作用与合理应用其防治养殖对虾细菌病害提供基础。【方法】从8个热带海水虾池采集水样,提取总DNA,利用BALOs科特异引物对水样总DNA进行扩增,通过构建16S rRNA基因克隆文库与系统发育分析,对虾池水体BALOs多样性和种群结构进行研究。【结果】从嗜盐噬菌弧菌科(Halobacteriovoracaceae)和吞菌弧菌科(Peredibacteraceae)克隆文库中分别获得726个和664个有效克隆子,在16S rRNA基因序列99.5%相似性水平上分别划分为68和44个OTUs(operational taxonomic units)。在16S rRNA基因序列97%相似性上,嗜盐噬菌弧菌可划分为37个种群,且绝大多数属于未培养型,但仅有的5个可培养类群占总文库克隆数量43.5%,其中可培养类群IX和未培养类群B28分别是最优势和次优势者;吞菌弧菌文库共包含28个种群,未培养类群pa12最为优势,唯一可培养类群A3.12是第2优势者。嗜盐噬菌弧菌与吞菌弧菌多样性大小随盐度高低呈相反趋势,但两者合起来的总BALOs多样性大小在不同虾池间则比较接近。【结论】湛江地区海水虾池中普遍存在高度多样的嗜盐噬菌弧菌和吞菌弧菌种群,盐度显著影响虾池BALOs种群结构组成。; 温崇庆薛明梁华芳周世宁; 关键词：RRNA基因多样性

蜡样芽孢杆菌对凡纳滨对虾幼体变态的影响被引量：8: 2007年; 研究了1株蜡样芽孢杆菌zou8对数期细胞对凡纳滨对虾无节幼体Ⅲ期到溞状幼体Ⅱ期幼体变态的影响;并通过zou8与弧菌的平板拮抗、共培养试验探讨其促进幼体变态的机制是否与拮抗病原弧菌有关。结果表明:高数量zou8细胞对凡纳滨对虾无节幼体Ⅲ期到溞状幼体Ⅱ期幼体的变态具有极显著(P<0.01)促进作用,尤其是多次加菌;zou8促进幼体变态作用的发挥并非通过产生拮抗物质直接抑制病原弧菌,而是通过其他可能机制。; 温崇庆薛明何红刘慧玲周世宁; 关键词：蜡样芽孢杆菌凡纳滨对虾幼体变态拮抗

四个类群海洋蛭弧菌类生物生长特性的比较被引量：9: 2009年; 研究了噬菌弧菌科(Bacteriovoracaceae)4个类群共12株海洋蛭弧菌类生物(Bdellovibrio-and-like organisms,BALOs)的生长温度和盐度范围及其对6种常见对虾病原弧菌的裂解能力,并通过透射电镜分析了其中4个代表菌株的形态特征。结果表明,同一群或亚群内菌株的生长温度或盐度相同,即类群IV、VI、IX、X菌株的生长温度范围分别为20°C～35°C、15°C～35°C、15°C～40°C和10°C～40°C,最适生长温度为30°C或35°C;生长盐度范围分别为5‰～40‰、2.5‰～30‰、5‰～60‰和5‰～60‰,最适生长盐度分别为10‰、5‰、20‰和20‰。测试的6种弧菌中有3种可被全部BALOs裂解,而其它弧菌仅被部分BALOs裂解,但即使同一类群菌株,对某些弧菌也表现不同的裂解能力。形态上,4株不同类群BALOs均呈典型的弧状细胞,具极生单鞭毛。; 温崇庆薛明周世宁; 关键词：温度盐度弧菌

食物缺乏对方斑东风螺幼螺代谢的影响被引量：4: 2011年; 通过室内模拟测定了方斑东风螺幼螺在禁食120 d中耗氧与氨氮排泄的连续变化。结果显示,随着饥饿时间延长,幼螺耗氧率呈指数式下降;排氨率先较快下降后有一定程度回升,实验结束时分别下降为对照的37.02%,75.32%。饥饿60 d前,氧氮比(O/N)较高(35.34～46.56),60～90 d有所下降(25.92～28.50),90 d后维持在一更低水平(13.33～19.80)。结果表明,饥饿90 d前幼螺主要以消耗脂肪与糖原供能,90 d后则以蛋白质和脂肪为主,并逐步加大蛋白质的动用量;幼螺通过减少活动和降低代谢以适应长期饥饿胁迫环境。; 薛明柯才焕狄桂兰; 关键词：饥饿耗氧率排氨率

凡纳滨对虾烂尾病病原的分离鉴定及药敏分析被引量：6: 2019年; 【目的】研究广东湛江地区凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)烂尾病主要病原及其药敏特征。【方法】从对虾病灶部位分离纯化细菌,用2株代表菌株对健康虾进行创伤浸浴感染试验,分析菌株形态特征、生理生化特征以及16SrRNA和HSP60基因序列,以哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)和坎氏弧菌(V.campbelli)溶血素基因特异引物扩增菌株基因组DNA,通过纸片扩散法测试菌株对17种药物的敏感性。【结果】从患病亲虾和养殖对虾分别分离获得编号2018B22和2018MZ1的代表菌,两株菌16SrRNA和HSP60基因序列均与哈维氏弧菌最相似,且均可被哈维氏弧菌溶血素基因引物特异扩增,表型特征亦与哈维氏弧菌相近;两株菌均可引起凡纳滨对虾烂尾病,其中菌株2018B22的致病力较2018MZ1更强,而后者的耐药谱更广。【结论】湛江地区凡纳滨对虾烂尾病主要病原为哈维氏弧菌。; 黄雪敏梁华芳薛明余文智李成聪陈耀温崇庆; 关键词：凡纳滨对虾烂尾病哈维氏弧菌药敏试验

高通量测序分析DNA提取引起的对虾肠道菌群结构偏差被引量：28: 2016年; 【目的】通过高通量测序技术,评价不同DNA试剂盒提取引起的对虾肠道菌群结构偏差,了解健康凡纳滨对虾肠道菌群结构特征。【方法】分别以细菌、粪便和组织DNA试剂盒3次重复提取凡纳滨对虾肠道总DNA(分别编号为SIB,SIS和SIT),检测DNA含量、纯度及其16S r DNA V4区可扩增性,进一步采用Illumina Mi Seq高通量测序比较SIB和SIS样品菌群组成和多样性。【结果】细菌试剂盒提取的虾肠总DNA效果最好,粪便试剂盒次之,而组织试剂盒所提DNA含量低且难以被扩增。从SIB和SIS样品分别获得52151±5085和55296±5147条有效序列,同一(46800条)测序深度下,SIS样品OTU(operational taxonomic unit)数量和Shannon多样性指数均显著高于SIB的,而SIB样品间OTU重复性则优于SIS样品间的。从SIB和SIS样品鉴定的优势门一致,均包括变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、放线菌门(Actinobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria),但不同分类水平上绝大多数优势菌群丰度在两种样品间差异明显。【结论】高通量测序分析表明对虾肠道菌群结构因DNA提取方法不同而呈现显著偏差;本研究健康凡纳滨对虾肠道核心菌群主要由发光杆菌属(Photobacterium),乳球菌属(Lactococcus),弧菌属(Vibrio),Aliivibrio和3个分类未定属构成。; 温崇庆何瑶瑶薛明梁华芳董俊德; 关键词：DNA提取凡纳滨对虾肠道菌群高通量测序

基于BIM和失败知识的地铁盾构施工风险识别和可视化表达研究: 盾构法施工在隧道工程建设中得到了广泛应用，是城市地下基础设施、地铁、管廊施工的首选技术，但伴随而来的是失败数量的不断增加。目前的风险识别方法存在遗漏的因素，人们对失败的认识不够全面，而当失败发生之后，若不能准确识别出失败...; 薛明; 关键词：地铁隧道盾构施工建筑信息模型

海洋蛭弧菌DA5全基因组测序及序列分析: 2018年; 为深入挖掘和利用海洋蛭弧菌及其基因资源,本研究利用IlluminaHiSeq测序平台对一株属于嗜盐噬菌弧菌(Halobacteriovorax)的海洋蛭弧菌DA5进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释,并与其他8株蛭弧菌进行了比较基因组分析。结果显示:DA5基因组大小为3.27Mb, GC含量为36.5%,预测编码基因3175个。在DA5基因组中注释到303个基因具有直系同源蛋白簇分类,与代谢通路相关基因1239个。比较基因组分析表明:DA5符合海洋蛭弧菌基因组的基本特征,与其他8株蛭弧菌共有467个同源基因家族,而DA5特有基因为266个。DA5中与细胞运动相关基因62个,其中编码甲基受体趋化蛋白、鞭毛蛋白、鞭毛马达及其开关蛋白基因均与嗜盐噬菌弧菌BAL6_X的对应基因亲缘关系最近。对DA5全基因组序列的注释和功能分析,为深入研究其捕食特性和作用机制,并更有效地利用其防控海水养殖细菌病害提供了基础。; 陆友云薛明李志桦温崇庆; 关键词：全基因组测序基因功能

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