项俊平
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：安徽大学更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于概率神经网络的蛋白质相互作用分类器被引量：1
- 2008年
- 蛋白质-蛋白质作用面上的结构特征对于研究蛋白质功能具有重要意义。提出了一种新的、基于统计直方图提取蛋白质作用面特征的方法,并且利用提取出的作用面特征,结合概率神经网络,实现了对作用面结构类型的分类预测。从预测结果来看,统计直方图提取出的特征,对蛋白质作用面结构具有很好的区分能力,而且可以通过调节划分的区间个数和节点的选取方式,达到对作用面结构的不同粒度的描述,以适用于不同目的的研究,这可能对与结构有关的某些生物信息学问题的研究具有启发性。利用概率神经网络对作用面结构进行分类预测,避开了费时的结构比对和数据库搜索,且训练快速,扩展能力强,正确率高,对独立测试集的911个蛋白复合物视在正确率达到90.67%。基于该算法的MATLAB分类器软件可以通过E-Mail与作者联系获取。
- 张伟郝江锋项俊平胡茂林
- 关键词：统计直方图概率神经网络分类器
- 一种快速的序列次序无关的结构比对方法
- 本文我们提出一种全新的蛋白质结构比对方法，它是完全意义上的序列次序无关的结构比对方法，可以发现所谓的“循环排列”和逆序的比对。首先我们给出了蛋白质主链α碳坐标的四面体序列等价表示，证明了这种表示是充分的;对每个四面体提取...
- 项俊平胡茂林
- 关键词：蛋白质结构动态规划
- 文献传递
- 蛋白质三维结构比对和表面建模的研究
- 本文主要研究了与蛋白质三维结构分析相关的两个课题:结构比对和表面建模,并用两章分别详细介绍之。 第一章简要介绍了何为生物信息学以及硕士期间接触的主要生物信息学技术,并叙述了文章主要内容和创新点。 第二章提出了一种新的...
- 项俊平
- 关键词：蛋白质生物信息学偏微分方程
- 文献传递
