黄静茹
- 作品数:3 被引量:10H指数:2
- 供职机构:厦门大学海洋与地球学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 中国鲎β-actin基因的克隆与组织表达被引量:1
- 2015年
- 中国鲎(Tachypleus tridentatus)是一种古老的海洋动物.利用RT-PCR和RACE等分子生物学技术,获得中国鲎β-肌动蛋白基因(中国鲎β-actin,简称为TTBA)全长cDNA序列,总共1 515bp,包括70bp 5′非编码区(untranslated regions,UTR)、314bp 3′UTR和一个1 131bp的开放阅读框(open reading frame,ORF).ORF可编码376个氨基酸残基,总分子质量约为41 807.7u.同源蛋白的序列比较结果显示,TTBA推导氨基酸序列与其他物种具有很高的相似性,推测β-actin基因具有很高的遗传保守性.而基于β-actin蛋白序列比对而绘制的系统进化树显示中国鲎与其他节肢动物具有较高的相似性,此结果与其现行的分类地位基本一致.以Real-time RT-PCR法检测表明,在卵子发生各期的卵巢组织中TTBA表达量保持稳定(p>0.05),可作为定量检测的内参基因.
- 李文杏黄静茹叶海辉黄辉洋李少菁
- 关键词:中国鲎Β-ACTIN基因克隆
- 中国鲎(Tachypleus tridentatus)雌激素相关受体基因的克隆与分析被引量:4
- 2011年
- 采用RT-PCR、RACE、Genome Walking等方法从中国鲎克隆得到了雌激素相关受体基因的cDNA全长及基因组DNA序列,命名为ttERR(GenBank登录号为HQ386702),并采用生物信息学方法对其序列和编码的蛋白质的理化性质、分子系统进化关系等进行预测和推断。结果表明,ttERR基因cDNA全长2722bp,包含一个1413bp的开放阅读框、626bp的5’-UTR和683bp的3’-UTR,编码一个由470个氨基酸组成的蛋白质。ttERR基因由10个内含子和11个外显子组成。系统发育分析表明,ttERR属于核受体超家族第三亚族。本文为将来深入研究中国鲎ttERR的功能奠定了基础。
- 黄静茹李文杏黄辉洋叶海辉李少菁
- 关键词:雌激素相关受体中国鲎分子克隆生物信息学分析
- 拟穴青蟹β-肌动蛋白基因的克隆与分析被引量:6
- 2012年
- β-肌动蛋白广泛存在于真核生物中,在维持细胞结构、细胞运动和细胞分裂等生理活动中发挥着重要作用.运用RACE技术克隆了拟穴青蟹(Scylla paramamosain)β-肌动蛋白基因,并用RT-PCR方法检测该基因在成体各组织中的表达情况.拟穴青蟹β-肌动蛋白cDNA全长1 337bp,5′端非编码区为67bp,3′端非编码区为139bp,开放阅读框1 131bp编码376个氨基酸.拟穴青蟹β-肌动蛋白与其他节肢动物β-肌动蛋白氨基酸序列的相似性高达98%~99%.系统进化树显示拟穴青蟹β-肌动蛋白基因的分子进化地位与其生物学分类地位一致.半定量RT-PCR分析结果表明,β-肌动蛋白基因在拟穴青蟹视神经节、脑神经节、胸神经节、性腺、鳃、心、胃、肌肉、肝胰腺共9个组织器官中的表达基本一致,具有良好的稳定性.
- 黄静茹黄辉洋叶海辉李少菁
- 关键词:Β-肌动蛋白拟穴青蟹CDNA末端快速扩增