吕军 作品数:34 被引量:110 H指数:5 供职机构: 内蒙古工业大学理学院 更多>> 发文基金: 内蒙古自治区自然科学基金 国家自然科学基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 轻工技术与工程 医药卫生 更多>>
高质量蛋白质空间结构数据库的构建方法 2000年 根据不同的研究需要 ,提出了不同的建库标准 .在以分辨率为主要选择依据的基础上 ,采取综合打分的方法 ,全面地衡量一个序列质量的高低 .引入同一性因子 S,找到了序列的同一性 S和序列同源性 V的关系 ,从而在判别序列之间同源程度时由序列的同一性因子 S取代序列同源性参数 V. 张颖 吕军 李炜疆关键词:数据库 蛋白质 空间结构 用多样性增量特征选择技术识别蛋白质磷酸化位点 2018年 磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,在许多细胞过程中扮演重要角色。发展磷酸化位点精确识别的计算生物学方法,有助于对磷酸化信号转导机制的理解。本文给出一种激酶无关的磷酸化位点识别模型,称为FSID_PhSite。模型以k间隔氨基酸对组分和位置保守氨基酸组分为特征,应用多样性增量特征选择技术进行特征筛选,将选出的特征输入到支持向量机算法进行识别。在正负样本数之比为1:1的情形下,对磷酸化丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸在独立测试集检验,识别精度分别达到84.34%、82.32%和68.89%。结果优于现有的激酶无关磷酸化位点识别模型。 胡世赛 梁珍 陈宇翔 张颖 吕军关键词:支持向量机 用主链局域结构关联特征识别疟原虫分泌蛋白 2018年 应用生物信息学方法识别疟原虫分泌蛋白和非分泌蛋白,为了提供快速的抗疟疾药物和疫苗的设计药物靶标筛选手段,采用径向核函数支持向量机进行疟原虫分泌蛋白和非分泌蛋白的分类识别.Jackknife检验结果表明,敏感性为85%,特异性为90%,总精度为88%.与现有的其它模型相比,在保证较高识别精度的前提下,大幅降低了模型所使用的特征数,增强了识别模型的鲁棒性.构建精度高且鲁棒性好的药物靶标蛋白质生物信息学识别模型,一方面可以为理解蛋白质功能机制提供有价值的线索,另一方面可作为针对病源蛋白进行药物和疫苗设计的快速筛查手段. 陈宇翔 李彦儒 张颖 吕军基于Weibull分布函数的熟牛肉电流体动力学干燥过程模拟 被引量:2 2016年 为了研究Weibull分布函数中各个参数的影响因素及其在电流体动力学干燥中的应用,以熟牛肉为对象进行电流体动力学干燥和对比试验,电压取值分别为0、6、14、21、32 k V,用Weibull分布函数和均方根误差、约化卡方值、建模效率等统计参数对干燥数据进行了模拟和分析;同时基于Fick第二定律对电流体动力学干燥过程中熟牛肉的水分扩散系数进行研究。结果表明,电流体动力学能够提高熟牛肉的干燥速度,且干燥速度随电压升高而升高;发现Weibull模型比较适合薄层熟牛肉的电流体动力学干燥;干燥过程中熟牛肉的有效水分扩散系数随着电压的增加而增加。 丁昌江 吕军 宋智青蛋白质局域结构、折叠及功能的预测 胡秀珍 张颖 贾芸 吕军 鲍卫华 高苏娟 石瑞佳 刘星星 王莹 在四个省级基金的支持下,该成果对蛋白质的局域结构(二级结构和超二级结构)进行了统计分析预测;对蛋白质折叠子进行了统计分析及分类预测;对蛋白质的折叠速率问题给予研究;对蛋白质的功能(酶分类、膜蛋白质分类及亚细胞定位)进行了...关键词: 用蒙特卡洛方法估计蛋白质折叠速率 2023年 采用蛋白质残基间的非局域接触距离构造接触得分函数,将蛋白质结构映射为接触得分序列。假设接触是独立形成的,应用蒙特卡洛方法对146个蛋白质的实验折叠速率值进行了估计,结果显示,蒙特卡洛步骤数与折叠速率之间存在良好的相关性,拟合优度达到0.69。进一步,若仅保留那些由特定氨基酸参与的非局域接触得分,认为这些接触在折叠过程中扮演了重要角色,此时蒙特卡洛步骤数与折叠速率之间的相关性将提高到0.72。结果表明,由特定残基参与形成的非局域接触数量是决定蛋白质折叠速率的主要因素。 邓洁旖 吕军关键词:蒙特卡洛方法 人类基因组转录调节模体距离保守性的研究与转录起始位点的预测 对人类基因组转录调节相互作用网络的理解,是现代分子生物学面临的一个直接的挑战。这里的一个中心问题是,如何从近邻物种的启动子的比较,来提取进化信息和搜索进化保守性。通过对人类转录因子结合位点(transcriptionfa... 吕军关键词:人类基因组 转录调节 转录起始位点 基因组序列 生物信息学 大肠杆菌σ^(70)启动子的识别 被引量:7 2007年 应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对大肠杆菌σ70启动子进行识别。使用受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线和精度召回率曲线(Precision Recall Curves,PRC)进行性能评估。10-fold交叉检验给出,在正负集之比为1∶1时,ROC曲线下面积和PRC曲线下面积均为95%。结果表明,IDQD算法有能力应用于原核启动子的识别。识别精度高于现有算法。 张颖 贾芸 吕军关键词:大肠杆菌 启动子 二次判别分析 酵母基因组核小体定位序列预测 被引量:1 2018年 核小体是染色质结构的基本单位,其在整条DNA序列上的定位分布情况,对于真核生物的基因表达调控起关键作用。用机器学习方法预测核小体定位成为近年来的研究热点。以DNA序列6-mer组分为参数,采用我们提出的多样性增量特征选择技术,筛选出8个6-mer作为分类特征。进一步,采用支持向量机算法,10折交叉检验的总精度达到98.2%。结果表明,核小体定位序列和连接序列核苷k-mer组分的特异化分布,是影响酵母核小体定位的主要因素。 胡世赛 陈宇翔 张颖 吕军一种膨胀系数测量仪 本实用新型涉及物理实验装置技术领域,尤其是一种膨胀系数测量仪。它包括显示连通器、内部填充有液体介质的介质容器、与介质容器的内周壁滑动接触的活塞、与显示连通器并行设置且具有顶端口的加热炉、横置于加热炉的顶端口与介质容器的顶... 王利福 张颖 付艳明 丁昌江 吕军