杜玉珍
- 作品数：51 被引量：125H指数：7
- 供职机构：上海交通大学附属第六人民医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市浦东新区科技发展基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学轻工技术与工程更多>>
- 肺癌骨转移患者血清NFKBIA和LETMD1的表达及诊断价值被引量：7
- 2021年
- 目的筛选肺癌骨转移患者血清外泌体中差异表达的mRNA,分析其作为肺癌骨转移标志物的诊断价值。方法回顾性研究2016-01-01-2019-07-31上海交通大学附属第六人民医院肺癌骨转移患者临床资料,挑选3例肺癌患者发生骨转移前及骨转移后共6例自身对照样本进行高通量测序,采用基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)对差异基因进行生物信息学分析。通过qPCR对同期本院168例肺癌患者血清外泌体样本中差异最显著的10个基因进行验证。采用受试者工作特征曲线(ROC)评估外泌体差异基因相对表达量对肺癌骨转移的预测价值。结果高通量测序结果发现461条差异表达基因。GO及KEGG分析结果显示,他们参与骨骼肌细胞分化、端粒酶活性的调节、TGF-β信号通路和丙戊酸盐代谢等多种骨转移相关的生物学进程。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证结果发现,核因子-κB抑制因子α(NFKBIA)和亮氨酸拉链EF-hand结构域跨膜蛋白1(LETMD1)基因在肺癌骨转移组中表达上调,P<0.05。ROC分析结果显示,NFKBIA和LETMD1曲线下面积(AUC)分别为0.788和0.708。进一步将2个差异基因与肺癌血清学诊断标志物CA125、Cyfra211联合分析,发现AUC进一步提高至0.822。结论肺癌骨转移患者血清外泌体中NFKBIA和LETMD1显著高表达,检测血清外泌体NFKBIA和LETMD1表达水平对诊断肺癌骨转移有一定参考价值,可作为肺癌骨转移患者诊断的潜在参考指标。
- 夏前林付亚文滕小艳魏丽荣杜玉珍
- 关键词：肺癌骨转移外泌体肿瘤标志物
- 用cDNA-AFLP技术筛选新生牛软骨无血管区的高表达基因被引量：5
- 2008年
- 软骨一直被认为是内源性血管生成抑制物的重要来源.为更好理解软骨血管生成抑制的遗传学基础,对软骨中与血管生成抑制有关的基因进行了初步的探索.本研究应用cDNA-AFLP技术对新生牛关节骨骺软骨无血管区和有血管区的差异表达基因进行分析,筛选无血管区特异表达或高表达的基因,共得到43个无血管区高表达的片段.通过对片段进行亚克隆、测序及同源性分析,结果发现,16个片段与已知基因同源,25个片段只在牛的基因组数据库中找到同源序列,另有2个片段未找到同源序列.在同源基因中,肌钙蛋白Ⅰ亚型其血管生成抑制作用已有较详细报道;S100A7与血管生成和肿瘤发生的关系也已有阐述.另外14个同源基因按生物过程分析,发现参与了细胞周期调节、信号传递、细胞间相互作用及新陈代谢等多个生物过程.研究结果提示,牛软骨组织无血管区的无血管状态可能由多基因介导,其中一些可能是已知或未知的新基因.
- 杜玉珍高锋
- 大鼠外周血淋巴细胞生物钟基因的昼夜表达及钟控基因的筛选鉴定
- 目的：建立免疫系统生物钟的细胞模型;探寻Clock的钟控基因，为免疫系统昼夜节律调控机制的研究提供基础性资料，同时也为免疫性疾病的防治提供新的思路。
方法：用半定量逆转录PCR进行钟基因Clock和相关基因褪黑素受...
- 杜玉珍
- 关键词：淋巴细胞
- 全自动尿沉渣仪分析法与显微镜法判断血尿来源的准确性比较
- 李莉陈卫宾杜玉珍李莉雅高锋
- 视交叉上核中褪黑素受体mRNA的昼夜节律性表达
- 目的:探讨视交叉上核(SCN)中不同亚型褪黑素受体mRNA的表达节律.方法:采用竞争性RT-PCR法定量检测不同时点SCN中褪黑素受体基因的mRNA表达.结果:两种褪黑素受体亚型mRNA的表达都具有昼夜节律性,但节律参数...
- 杜玉珍童建
- 关键词：视交叉上核褪黑素受体昼夜节律生物学功能
- 文献传递
- 昼夜生物钟分子调控研究进展
- 昼夜节律是生物体最普遍的一种节律.本文探讨昼夜节律的特性及启动,分子遗传学基础,负反馈环模式,以及昼夜节律对钟控基因的分子调控机制.
- 童建杜玉珍
- 关键词：分子调控
- 文献传递
- 肺腺癌m6A甲基化调控因子相关预后风险模型的构建及临床意义
- 2023年
- 目的构建基于N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化调控因子的肺腺癌预后风险模型,为肺腺癌的预后评估提供科学依据。方法从TCGA数据库下载mRNA表达和临床数据。使用R软件对24种m6A甲基化调控因子进行差异表达分析。利用单因素Cox回归分析初步筛选出与生存相关的m6A调控因子,在此基础上通过Lasso回归进一步筛选纳入模型的变量,将Lasso回归得到的m6A调控因子用于构建Cox回归模型并计算每个样本的风险评分。qRT-PCR检测模型基因HNRNPC及IGF2BP1在正常肺上皮细胞(REAS-2B)及肺腺癌细胞株(A549、H1299、PC9)中的表达。采用TCGA数据库中配对组织的差异分析检测模型基因在肺腺癌及正常肺组织的差异表达。使用Kaplan-Meier生存曲线及ROC曲线对模型效能进行评估。通过热图分析不同风险组的临床特征,并结合其他临床参数进行单因素和多因素Cox回归分析对风险模型的独立预后性进行检验。结果19个m6A甲基化调控因子在肺腺癌和正常组织中显著差异表达。单因素Cox回归分析发现4个肺腺癌生存显著相关的m6A调控因子(P<0.01),进一步采用Lasso回归联合Cox回归算法构建了包含2个基因(IGF2BP1、HNRNPC)的预后风险模型。qRT-PCR结果显示HNRNPC和IGF2BP1相对表达量在肺腺癌细胞株A549、H1299和PC-9中高于正常肺上皮细胞REAS-2B,差异具有统计学意义(P<0.01)。TCGA数据库的59对肺腺癌及相邻的正常肺组织的匹配差异分析发现HNRNPC和IGF2BP1在肺腺癌中表达高于正常肺组织,差异具有统计学意义(P<0.001)。生存曲线分析显示相比低风险组患者,高风险患者总体生存期明显降低(P<0.01)。ROC曲线结果表明模型可以较好地预测肺腺癌患者预后(AUC=0.724)。多因素Cox回归分析显示该预后风险模型可作为独立预后因素(HR=2.357,P<0.001)对肺腺癌患者的预后进行预测。结论本研究构建了基于m6A甲基化调控因子的预后风险
- 夏前林仇荣陆悦张琼杜玉珍
- 关键词：预后模型风险评分肺腺癌
- 基于骨转移特异性骨标志物的肿瘤骨转移预测系统及方法
- 本发明提供一种基于骨转移特异性骨标志物的肿瘤骨转移预测系统及方法，涉及机器学习技术领域，包括：指标获取模块，用于获取对患者进行血清检测得到的患者血清中与骨转移相关的多个骨标志物指标；骨转移预测模块，连接指标获取模块，用于...
- 杜玉珍滕小艳
- 斯钙素1的表达对肺癌细胞A549细胞周期及凋亡的影响被引量：1
- 2016年
- 背景与目的:斯钙素1(stanniocalcin l,STC1)在多种癌组织中表达上调,且与癌组织的恶性程度相关,但STC1在肺癌细胞中的分子作用机制尚不明确。本研究旨在探讨STC1的表达对肺癌细胞A549细胞周期及凋亡的影响。方法:构建STC1基因RNA干扰的肺癌细胞株A549-STC1-si RNA和对照细胞株A549-Vector,用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白[质]印迹法(Western blot)检测A549-Vector及A549-STC1-si RNA细胞株的细胞周期蛋白基因Cyclin A、Cyclin B1、Cyclin D1、Cyclin E、CDK2、CDK4,凋亡抑制基因Bcl-2、Bcl-xl及凋亡诱导基因Caspase-3、Bax、Bak、Bid的表达水平,用流式细胞术检测STC1基因对A549细胞周期的影响,用原位末端标记(terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated nick-end labeling,TUNEL)检测STC1基因对A549细胞凋亡的影响。结果:与A549-Vector细胞相比,A549-STC1-si RNA的细胞周期蛋白基因Cyclin A、Cyclin B1、Cyclin D1、Cyclin E、CDK2和CDK4在转录和蛋白表达水平上均显著减少(P<0.05),G_0/G_1期细胞比例明显增加,S期及G_2/M期细胞比例降低(P<0.05),细胞周期受阻;A549-STC1-si RNA的凋亡抑制基因Bcl-2和Bcl-xl表达下调(P<0.05),而凋亡诱导基因Caspase-3、Bax、Bak及Bid显著上调(P<0.05);TUNEL实验表明,A549-STC1-si RNA细胞的凋亡率明显增加。结论:STC1基因的低表达可阻滞肺癌细胞A549的细胞周期,抑制细胞增殖,同时促进细胞凋亡。
- 李妮娅左雪梅李莉刘华杜玉珍
- 关键词：RNA干扰细胞周期细胞凋亡
- 在基因表达定量检测中内参照基因的选择
- 杜玉珍彭伟高锋
