杨榕
- 作品数:7 被引量:22H指数:3
- 供职机构:中南大学更多>>
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- 东方田鼠分子遗传学标志的初步研究
- 东方田鼠是日本血吸虫疫区唯一具有天然抗日本血吸虫感染特性的啮齿类哺乳动物,这种抗性可稳定遗传.为了建立东方田鼠的分子遗传学标记,我们根据小鼠MHCⅡ类基因Aβ外显子2及其两侧序列,合成引物扩增东方田鼠基因组DNA,得到数...
- 杨榕
- 关键词:东方田鼠单核苷酸多态性
- 文献传递
- 东方田鼠特异DNA序列及其用途
- 本发明公开了一种东方田鼠特异DNA序列,该序列为抗日本血吸虫相关基因序列。依据小鼠H2外显子2及其两侧序列,设计引物,抗增东方田鼠基因组DNA,将扩增产物测序后设计合成内引物再进行东方田鼠基因组DNA体外扩增,得到特异性...
- 胡维新杨榕彭兴华
- 文献传递
- 东方田鼠特异DNA片段的克隆及核苷酸序列分析被引量:15
- 2001年
- 目的 获得东方田鼠的特异DNA序列。方法 Aβ基因使用PCR ,基因克隆 ,斑点杂交 ,DNA序列分析 ,生物信息学技术。结果 根据小鼠MHCⅡ外显子 2及其两侧序列 ,合成引物并扩增东方田鼠基因组DNA ,将PCR产物回收、测序后 ,分别设计内引物扩增东方田鼠基因组DNA ,其中一对引物可得到特异性扩增带 ,将得到的DNA片段插入PGEM Teasy载体 ,进行序列分析。用这对引物扩增人、昆明小鼠、BALB c小鼠及C57BL 6J小鼠基因组DNA ,均无扩增产物。以东方田鼠特异性扩增产物为探针进行斑点杂交 ,除东方田鼠基因组DNA外 ,其他几种动物基因组DNA均为阴性结果。进一步对该DNA片段进行了BLAST同源性搜索和外显子预测 ,在Genbank中没有发现高度同源序列 ,并且找到一个可能的外显子 ,该外显子由 69个氨基酸组成。结论 获得的DNA片段为东方田鼠的特异片段 ,这将为从分子水平深入研究东方田鼠的遗传背景、生物进化规律以及东方田鼠抗日本血吸虫的机理奠定基础。
- 杨榕胡维新朱敏彭兴华
- 关键词:东方田鼠DNA片段斑点杂交动物基因组生物进化
- 东方田鼠长江亚种和指名亚种基因组DNA序列比较分析
- 根据东方田鼠基因组DNA序列片段(Genbank登录号:AF277394),用PCR技术扩增东方田鼠长江亚种(Microtus Fortis calamorum)和宁夏指名亚种(Microtus Fortis forti...
- 许冰胡维新杨榕王勇刘新发彭兴华
- 文献传递
- 洞庭湖日本血吸虫疫区东方田鼠生化与分子遗传学标记的初步研究被引量:8
- 2002年
- 目的 建立东方田鼠生化与分子遗传学标记检测法。方法 参考近交系小鼠、大鼠生化遗传标记检测方法 ,对东方田鼠某些同功酶进行活性测定。根据东方田鼠特异DNA序列 ,合成引物 ,扩增东方田鼠基因组DNA ,将PCR产物回收、序列分析并进行生物信息学分析。结果 东方田鼠Trf、Es 3和Ce 2三个生化位点呈现遗传多态性 ,而Id1、Mod 1、Car 2、Gpd 1、Gpi 1、Hbb、Es 1七个生化位点无遗传多态性。用合成的特异引物扩增东方田鼠基因组DNA ,得到了丰富的多态性资料。对其中的 2 0只东方田鼠的扩增产物进行测序并进行多序列比较 ,发现10个等位基因以及 16个单核苷酸多态性 (SNP)位点。结论 初步建立了东方田鼠生化及分子遗传学标记。分子遗传学标记与生化遗传标记相比 ,具有杂合率高、重复性好、易于操作等优点。这些结果为深入研究东方田鼠的遗传背景、生物进化规律积累了基础资料。
- 胡维新杨榕许冰曾海涛刘新发彭兴华
- 关键词:洞庭湖东方田鼠生化遗传标记单核苷酸多态性
- 东方田鼠特异DNA序列
- 本发明公开了一种东方田鼠特异DNA序列,该序列为抗日本血吸虫相关基因序列。依据小鼠H2外显子2及其两侧序列,设计引物,扩增东方田鼠基因组DNA,将扩增产物测序后设计合成内引物再进行东方田鼠基因组DNA体外扩增,得到特异性...
- 胡维新杨榕彭兴华
- 文献传递
- 东方田鼠长江亚种和指名亚种基因组DNA序列比较分析被引量:6
- 2003年
- 根据东方田鼠基因组DNA序列片段 (GenBank登录号 :AF2 77394 ) ,通过PCR方法扩增东方田鼠长江亚种(Microtusfortiscalamorum)和宁夏指名亚种 (Microtusfortisfortis)基因组DNA ,得到一 6 70bp左右的特异扩增片段。将PCR扩增产物克隆到pGEM Teasy载体 ,进行DNA序列分析 ,并用生物信息学方法比较东方田鼠长江亚种与指名亚种之间该序列的差异。结果表明 :在东方田鼠两个亚种中共发现 19个不同的等位基因 ,不同的个体在该序列存在广泛的单个核苷酸多态性 (SNP) ,多态性位点多达 2 5个 ;变换类型包括 :转换 (G→A、A→G、T→C、C→T)、颠换 (G→T、A→T、T→A、C→A)、插入 (CA)和缺失 (TGTTTT)。东方田鼠长江亚种和指名亚种两个种群之间存在明显差别 ,尤其是在 14 6、192、2 2 3、2 2 4、2 35位 ,但两种群间同源性仍高达 98%。同时采用系统发育树 (phylogenetictree)分析方法 ,对两个亚种的亲缘关系进行了分析和比较 ,结果显示 。
- 许冰胡维新杨榕俞远京王勇刘新发彭兴华
- 关键词:东方田鼠SNP生物进化