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职晓阳: 作品数：33 被引量：148H指数：8; 供职机构：云南大学生命科学学院微生物研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学医药卫生轻工技术与工程化学工程更多>>

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滇重楼根茎内生细菌生物多样性研究: 滇重楼[Paris polyphylla,mith var.yunnanensis(Franch.)Hand.-Mazz.]为百合科重楼属多年生草本植物,以根茎入药,是我国常用的传统中药.作为西南地区道地药材,滇重楼具有...; 杨玲玲职晓阳徐丽华; 关键词：滇重楼植物内生细菌细菌多样性

云南江城和黑井盐矿沉积物未培养放线菌多样性比较被引量：17: 2008年; 类群特异性引物的应用使得研究者可以对感兴趣的微生物类群进行针对性研究。围绕云南江城和黑井两个地区的3个盐矿样点沉积物中放线菌的多样性和群落组成,我们通过放线菌特异性引物对总DNA进行16SrRNA基因扩增,经过克隆文库构建,利用酶切并选择其中不同带型的133个克隆的16SrRNA基因插入片段进行测序。系统发育分析和统计学结果表明,两地放线菌16SrRNA基因克隆广泛分布于整个放线菌门,同时发现部分序列可能属于放线菌的新类群。分析结果还预示,江城和黑井两地盐矿虽处云南不同地域含盐区,但两地未培养放线菌物种多样性和系统发育关系均较为相似。; 吴晋元职晓阳李岩关统伟唐蜀昆徐丽华李文均; 关键词：盐矿极端环境放线菌多样性

新疆高盐环境可培养放线菌的分离、快速筛选及系统分类研究: 高盐环境放线菌的研究远落后于嗜盐古菌和嗜盐细菌，主要原因是是对其适应高盐环境的特殊生理机制不清楚，无法为纯培养分离技术提供理论指导。随着分子生物学理论和技术的不断发展而出现的免培养技术，虽然可以不依赖于纯培养物就可以从一...; 李文均唐蜀昆职晓阳张玉琴徐丽华; 关键词：高盐环境嗜盐放线菌菌株筛选

涅斯捷连科氏菌特异性引物PCR分子鉴定(英文)被引量：1: 2008年; 涅斯捷连科氏菌属的建立基于对 Micrococcus halobius 的再分类,这是一类广泛分布于高盐土壤环境的革兰氏阳性细菌,属放线菌类。在对我国西部盐湖环境放线菌的生物多样性及分类学研究中,大量类似菌株被分离。【目的】为了对其进行快速鉴定,特别是筛选出属于优势类群的涅斯捷连科氏菌,【方法】本研究根据前人以报道的方法设计了一对针对其16S rRNA 基因的特异性PCR 引物(Nes1/Nes2),【结果】并通过部分典型菌和野生菌株的PCR实验验证,结合16S rRNA基因的测序验证,证明了Nes1/Nes2 的 PCR 反应有效性及其对涅斯捷连科氏菌的特异性。【结论】利用该引物可以快速准确的对涅斯捷连科氏菌进行鉴定。; 职晓阳杨玲玲王芸唐蜀昆娄恺李文均; 关键词：分子鉴定

极端耐盐放线菌白色普氏菌YIM 90005T四氢嘧啶合成相关基因的克隆与分析: @@选取形态经典的SMM培养基培养的不同盐浓度梯度经典的丝状产抱耐高盐放线菌白色普氏菌YIM 90005T培养至指数期收集菌体并冻干。氨基酸自动分析仪检测定量了的胞内氨基酸含量，HPLC检测定量了胞内四氢嘧啶的含量，研究...; 李岩职晓阳唐蜀昆李文均; 关键词：基因克隆

硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性被引量：23: 2008年; 【目的】认识和了解盐湖沉积环境中放线菌的多样性,为今后的开发和利用奠定基础。【方法】应用免培养技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对新疆硝尔库勒盐湖沉积物中放线菌的多样性进行了研究。实验采用SDS-CTAB法提取土样中总DNA,利用放线菌特异性引物对土样总DNA进行16S rRNA基因扩增,并构建16S rRNA基因克隆文库;对随机挑选的160个克隆通过酶切筛选出51个不同图谱的重组克隆,并对其测序。【结果】所获得的51个克隆序列属于39个OTUs,其中52.9%的克隆序列分布于放线菌门(phylum Actinobacteria)放线菌亚(Actinobacteridae)的5个亚目和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)中,并且在这两个亚纲中有大量克隆序列属于放线菌的新类群,另外47.1%的克隆序列以极高的自展值在放线菌门内支持形成一个独立的大分支,极有可能代表一个新亚目或更高级分类单元的类群。【结论】这些研究结果说明硝尔库勒盐湖中存在有较为丰富的放线菌系统发育多样性,并且潜藏着新类型的放线菌资源。; 关统伟吴晋元职晓阳唐蜀昆徐丽华李文均张利莉; 关键词：系统发育放线菌多样性

我国放线菌系统学研究历史、现状及未来发展趋势被引量：32: 2013年; 放线菌系统学是以实现对放线菌进行分类、鉴定、命名为目标的基础学科,因此它是放线菌资源研究和开发利用的重要理论基础。自20世纪50年代起,我国放线菌系统学的奠基人阎逊初院士及同事们就开创了我国放线菌系统学的研究,经过近六十年、几代人的艰苦努力,我国放线菌系统学工作者在国际微生物系统学权威杂志(International Journal of Systematics and Evolutionary of Microbiology,IJSEM)发表的有关放线菌新分类单元的论文数量连续十年排名稳居前列,部分学者在国际上发表的某些改良的分类技术和新修订的分类系统等为国际同行所广泛采用,这些均标志着我国放线菌系统学研究在国际上已成为微生物系统学界的一支重要力量。本文全面介绍了我国放线菌系统学研究的发展历程,同时对其发展现状给予理性分析,并就未来发展方向进行了展望。; 李文均职晓阳唐蜀昆; 关键词：放线菌多样性系统学

PCR-SSCP技术在嗜盐放线菌链单孢菌属快速筛选中的应用被引量：2: 2008年; 为提高嗜盐放线菌的研究效率,快速、准确的从大量分离菌株中去除重复菌株、筛选出目的菌株,在特异性引物快速定属的基础上,以嗜盐放线菌链单孢菌属的34株菌株为研究对象,采用与PCR相结合的单链构象多态性分析(PCR-SSCP),扩增出16SrRNA基因中的两个高变区,根据结果对34株菌株进行聚类分析,并将其16SrRNA基因片段测序予以验证。结果表明,聚类后34株菌株可大致分为3类,且与16SrRNA基因片段分析结果一致。从而可快速去除重复菌株并反映出菌株间的系统进化关系。同时实验数据可构建成库,使后续分离菌株的筛选工作只需比对数据即可完成,利于提高工作效率,降低实验成本。; 蔡曼职晓阳吴晋元唐蜀昆李文均; 关键词：PCR-SSCP

新疆艾丁湖可培养嗜盐放线菌生物多样性研究: 在嗜盐放线菌营养、生理、生长条件等研究的基础上,对新疆艾丁湖地区的土样进行了可培养嗜盐放线菌分离方法研究,在营养生理上抑制拟诺卡氏菌属的出菌率等嗜盐放线菌分离方法上取得了较大的突破,克服了原先只能分离到大量拟诺卡氏菌属的...; 唐蜀昆李文均职晓阳姜怡田新朋徐丽华; 关键词：嗜盐放线菌生物多样性

云南盐矿和新疆盐湖拟诺卡菌株生物地理分布及遗传进化初探: 本研究通过新疆盐湖和云南拟诺卡氏属菌株遗传进化差异来阐述拟诺卡属菌株地理分布的特征。利用DNA-DNA序列相似性和16S rRNA基因序列相似性相关性来进一步确定拟诺卡氏属菌株之间的亲缘关系，并通过gyrB、rpoB、s...; 何松涛职晓阳杨玲玲唐蜀昆李文均; 关键词：生理生化特性遗传进化

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