唐向荣 作品数:12 被引量:25 H指数:3 供职机构: 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 更多>> 发文基金: 中国科学院知识创新工程 江苏省科委资助项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
乙型肝炎病毒基因检测芯片的研制及临床研究 基因芯片,亦称为DNA芯片或DNA微阵列,是指采用原位合成或点样等方法将核酸探针固定于固体支持物表面,从而形成核酸探针阵列,然后与标记的样品进行杂交,通过检测杂交信号来实现对生物样品的高通量检测和分析。基因芯片是由传统的... 唐向荣关键词:乙型肝炎 寡核苷酸基因芯片检测HBV基因型方法的建立与临床研究 被引量:2 2007年 目的建立寡核苷酸基因芯片检测 HBV 基因分型的方法并对 HBV 携带者基因型进行临床分析。方法根据 Genbank 中已发表的128株 HBV 全基因组序列系统进化分析结果设计了A~H不同 HBV 基因型的特异探针及巢式 PCR 引物。利用反向杂交原理,先将不同 HBV 基因型特异的寡核苷酸探针固定在芯片上,再与地高辛(Dig)标记的扩增产物杂交从而检测 HBV 基因型。本研究检测了200例 HBV DNA 阳性患者,为了验证基因芯片检测的结果,随机选取其中40份样本进行直接测序。结果在200份血清样本中检测到 B、C 基因型以及 BC 混合型,依次占11.5%(23/200),80.5%(161/200),8%(16/200)。在与测序方法进行对比的40份样本中,除3份例混合型用测序方法不能检出混合感染外,利用测序结果进行系统发育分析得到的结果与基因芯片检测结果一致。进一步的克隆分析发现这3份样本均为混合感染。结论基因芯片是进行 HBV 基因分型的方便可靠的工具,并能更好地检测不同基因型混合感染的情况。本研究中,HBV基因型以 C 型为主,与 B 型相比,C 型 HBV 感染者病情较为严重。 唐向荣 张冀申 赵辉 赵建龙关键词:肝炎病毒 乙型 芯片分析技术 芯片显色法检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药基因实验条件优化研究 2007年 目的优化研究芯片显色法检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药基因的最佳条件。方法自制DNA芯片,每条寡核苷酸探针片段长度为19bp,点样浓度在15μmol/L,以痰液为待检标本,分别用不同引物、Mg2+、核苷酸、DNA聚合酶浓度等进行多重聚合酶链反应;分别在不同时间、温度下进行杂交,分别在不同酶作用时间和显色时间进行分析,比较不同条件芯片检测结果。结果引物、Mg2+、核苷酸、DNA聚合酶浓度分别为0.2μmol/L、1mmol/L、0.2mmol/L、5U效果最好,杂交时间和杂交温度分别为0.5h、60℃信号最强,酶作用时间和显色时间均为0.5h时得到最佳结果。结论在最佳条件下,该技术的重复性、特异性、灵敏度与可靠性均较好,适合基层医院推广应用。 王万相 郭乃洲 严爱华 马达 马力 周步全 景奉香 唐向荣 朱殊关键词:痰标本 结核分枝杆菌DNA 显色法 耐药基因 肝癌患者外周血白细胞中p16蛋白的表达及其意义 被引量:1 2006年 目的了解肝癌患者外周血白细胞中P16蛋白的表达及其意义。方法对20例正常献血员,32例慢性乙型肝炎,28例肝硬化,35例肝癌患者外周血白细胞进行P16蛋白的流式细胞荧光染色检查。结果P16蛋白在正常献血员,慢性乙型肝炎,肝硬化,肝癌中阳性率分别为(76.57±6.07)%、(43.09±8.08)%、(30.54±10.61)%、(16.29±6.86)%,正常献血员中的阳性率明显高于后三者(P<0.05),慢性乙型肝炎阳性率明显高于肝硬化和肝癌(P<0.05)。结论肝细胞癌的发生可能与P16表达减少有关。 周国平 白敬羽 潘永军 芮冬妹 时静 唐向荣 王永忠 杭双荣关键词:P16蛋白 外周血白细胞 利用微系统技术研究氧化铁纳米粒子与细胞的作用机理 赵建龙 金庆辉 唐向荣 吴蕾 构建了细胞芯片微系统平台。初步研究了不同粒径和不同表面修饰的氧化铁纳米粒子的细胞的作用机理。关键词:关键词:微系统技术 细胞 显色法芯片检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药基因 被引量:7 2006年 目的建立显色法芯片检测结核分枝杆菌耐药基因的方法。方法设计4对地高辛标记引物,扩增结核分枝杆菌rpoB、katG、inhA和ahpC 4个基因部分片段,根据结核分枝杆菌利福平(RFP)和异烟肼(INH)4条耐药相关基因上8个位点的25种单核苷酸多态性设计探针制作芯片,扩增产物与芯片杂交,显色法判断结果;用该法检测46株结核分枝杆菌临床分离株。结果扩增产物琼脂糖电泳可见4条大小分别为165、181、245、315 bp DNA条带;结核分枝杆菌菌液浓度为1.6×103/ml时,该法仍可检测到各位点野生及突变信号;19种非结核分枝杆菌标准株和9种非分枝杆菌标准株扩增产物无DNA条带,与芯片杂交亦无信号,H37Rv结核分枝杆菌标准株芯片检测各位点均为野生型;5株结核分枝杆菌临床分离株重复检测5次,结果完全一致;6份PCR产物的测序结果与芯片检测结果完全一致;46株结核分枝杆菌临床分离株中,RFP耐药株28株,芯片检出突变株24株,突变率为85.7%,RFP敏感株18株,芯片检出突变株2株。INH耐药株31株,芯片检出突变株20株,突变率为64.5%,INH敏感株15株,芯片检出突变株4株。结论显色法芯片检测结核分枝杆菌耐药基因具有较高的敏感性和特异性,无需特殊仪器设备,有一定的推广应用价值。 郭乃洲 王万相 严爱华 马达 周步全 景奉香 唐向荣关键词:显色法 结核分枝杆菌 利福平 异烟肼 萍乡地区HBV前C区和BCP区基因突变研究 2007年 乙型肝炎病毒是一个双链DNA病毒。HBV感染能导致急、慢性的肝病。其中全球慢性乙型肝炎(CHB)患者超过3.6亿。每年由于HBV慢性感染引起的肝硬化、肝细胞癌死亡患者超过47万人。而由于HBV病毒的复制过程缺乏校对机制.在慢性感染的过程中发生基因突变的几率很高.相关研究最多的HBV突变株主要有;一是发生在翻译水平的前C突变(G1896A); 王长奇 陈燕萍 罗娜 林志铭 龙承明 唐向荣 王康关键词:HBV前C区 BCP区 HBV慢性感染 双链DNA病毒 乙型肝炎病毒 不同样本处理方法对显色法芯片检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药基因的影响 被引量:2 2006年 目的:选择一种较为理想的从痰标本中直接抽提结核分枝杆菌DNA的方法,用于显色法芯片检测结核分枝杆菌利福平(RFP)和异烟肼(INH)的耐药基因。方法:选择3份含结核分枝杆菌分别为4.325×103、6.857×104、5.356×105Copies/ml的痰液,分别用Chelex100树脂法、煮沸法、蛋白酶K消化-异丙醇沉淀法、蛋白酶K消化-酚/氯仿抽提法、碱裂解法、异硫氰酸胍裂解法、盐酸胍裂解法、离心柱法抽提结核分枝杆菌DNA作多重聚合酶链反应,显色法芯片检测结核分枝杆菌RFP和INH耐药基因。结果:离心柱法检测结果阳性,其余方法检测结果均为阴性,离心柱法检测灵敏度为2.743×103Copies/ml。结论:离心柱法是一种较为理想的从痰标本中直接抽提结核分枝杆菌DNA的方法,可用于显色法芯片检测结核分枝杆菌RFP和INH耐药基因。 王万相 郭乃洲 严爱华 马力 周步全 马达 景奉香 唐向荣 庄严关键词:痰标本 结核分枝杆菌DNA 显色法 耐药基因 肝癌患者血清中乙型肝炎病毒前C和BCP区基因变异的临床研究 被引量:5 2006年 目的了解常州地区乙型肝炎病毒(HBV)DNA前C区(1896)、BCP区(1762/1764)基因的变异,探讨与肝癌的相关性。方法运用基因芯片和核苷酸序列分析技术,对HBVDNA进行分析。结果前C区1896位、BCP区1762/1764位突变普遍存在。(1)在39例HBeAg(+)标本组中1896突变为5例(12.8%),1762/1764突变为15例(38.5%);在75例HBeAg(-)组中1896突变为26例(34.7%),1762/1764突变为55例(73.3%)。(2)在114例标本中,慢性乙型肝炎、慢性重型乙型肝炎、乙肝肝硬化、肝癌组中前C区1896、BCP区1762/1764位的总突变率分别为55.9%、71.4%、75.7%、88.9%。结论前C区1896、BCP区1762/1764位突变与HBeAg(-)显著相关,两者总突变率在肝癌患者中显著升高,尤其前C1896、BCP区1762/1764同时突变与肝硬化和肝癌密切相关。 周国平 白敬羽 罗立波 唐向荣 王永忠 陈敏 杭双荣关键词:乙型肝炎病毒 基因变异 基因芯片 血液多病毒检测芯片和肝炎诊断芯片研究 赵建龙 徐元森 景奉香 毛红菊 闻玉梅 袁正宏 康来仪 潘启超 薛以乐 唐向荣 张宏莲 张华 赵辉 张为 该课题提供了乙肝病毒基因多态性检测芯片样品,可检测乙肝病毒基因52种基因分型和13种以上的基因多态性;提供了丙肝病毒基因分型检测芯片样品,可检测丙肝病毒5种基因型,8种以上的基因亚型(1a,1b,2a,2b,3a,3b,...关键词: