李建华
- 作品数：5 被引量：17H指数：2
- 供职机构：东北大学中荷生物医学与信息工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学化学工程更多>>
- 基于增广拉格朗日的全变分正则化CT迭代重建算法被引量：1
- 2018年
- 采用一种基于增广拉格朗日方法 (augmented Lagrangian method)求解全变分正则化(total variation regularization)算法(ALMTVR)来进行CT图像重建.将ALMTVR算法与经典的代数重建算法(algebraic reconstruction technique,ART)进行比较,并采用仿真数据与实际数据进行实验.在实验中,使用ALMTVR算法与ART算法分别进行图像重建,并对重建图像进行对比分析.实验结果表明:所提算法与ART算法相比,显著提高了图像重建的质量与速度,显示了其对图像重建的有效性及在CT成像系统中潜在的应用价值.
- 孝大宇郭洋李建华康雁
- 关键词：仿真数据
- 基于功能网络信息传播预测疾病-miRNAs的关联被引量：1
- 2018年
- 为了快速发现与疾病关联的miRNA,基于功能网络信息传播,提出PMBP算法用于改进随机游走法,使用留一交叉验证评估了算法性能,最后进行案例分析.实验结果表明:对于尚未发现关联miRNA的疾病,随机游走法是失效的,而PMBP以疾病相似性作为先验信息,能够有效预测;对于已经关联miRNA的疾病,PMBP提高了预测性能,AUC值为0.866.对乳腺癌进行案例分析,预测的前50个miRNAs都被证实与乳腺癌相关,体现了PMBP算法的有效性.
- 李建华雒士源张建营康雁
- 关键词：网络传播随机游走
- BP神经网络在甘油水溶液粘度预测中的应用被引量：6
- 2009年
- 二维数据表广泛应用于科学与工程计算,当出现数据缺失时,由于数据间存在的非线性关系,采用传统方法在两列数据中插值将产生较大的误差。结合甘油水溶液粘度的预测,提出使用人工神经网络的插值方法,对神经网络模型、参数以及训练样本集的选择进行了实验与优化。实验表明,利用BP神经网络预测25°C甘油水溶液粘度时,网络收敛速度快,预测精度高,优于传统的最邻近插值和双线性插值,能够满足一般科学与工程计算的需要。提出的插值预测方法对类似条件的二维数据表具有普遍指导意义。
- 李建华陈自宽
- 关键词：人工神经网络非线性插值
- 基于Android的移动化学计算平台研究被引量：2
- 2014年
- 化学发现较多地依赖于研究者的经验与创意。随着信息技术的进步,计算化学作为化学的一个分支也在迅速地发展。移动互联网和云计算的出现使计算突破了时间和空间的制约,为计算化学提供了新的发展空间。本文研究并开发了一个基于Android的化学数据计算移动平台,实现了化学项目管理、数据分析以及数据查询等功能。项目管理包括项目创建、项目修改、项目删除和项目查询。在创建面向实验的项目时,本平台支持对化学方程式的编辑,在确定反应物和生成物的分子式后,系统将自动计算分子量并配平方程式。数据分析是对实验或计算结果进行处理和分析,包括计算化学反应的转化率、产率,对数据进行中心化、对数化等预处理,以及数据拟合与回归等,同时引入了图形化显示技术,可直观反映各种因素之间的关系。数据查询包括元素周期表查询、平台存储化合物查询和在线化合物数据库查询。在平台内部,构建了一张电子元素周期表,能够完成元素查询以及相关计算的自动检索:同时存储了与化学项目相关的化合物信息,并提供了一些常用在线化学数据库链接以扩展平台的功能。测试表明,所研发的移动化学计算平台实现了预期功能,性能稳定。
- 李建华徐明杰张济慈康雁李岭
- 关键词：计算机化学ANDROID
- 在线孟德尔人类遗传数据库数据挖掘的研究进展被引量：7
- 2014年
- 在线孟德尔人类遗传数据库(OMIM)是描述人类遗传病及其相关基因的知识库,其词条包括疾病的临床特征、基因连锁分析、染色体定位以及动物模型等,是研究疾病与基因关系的重要依据。疾病表型的相似性可能提示分子之间的相互作用。进行表型比对将有助于预测疾病候选基因以及分析分子之间的关系。OMIM数据库采用文本描述疾病表型,并不适用于计算机分析。对OMIM数据进行标准化对于大规模比对和分析疾病的表型数据、建立表型与基因的对应关系具有重要的意义。研究者近期通过引入标准的医学语言系统,采用文本挖掘中的词频-逆文档频率技术以及用于文档分类的余弦定理方法,结合基因本体论及其比对方法,推动了OMIM数据挖掘的快速发展。本文总结了近年来OMIM数据标准化、表型相似性度量及数据挖掘研究的主要成果,并对其发展趋势进行了预测。
- 李建华李哲人康雁李岭
- 关键词：文本挖掘候选基因分子通路
