蔡惠芬
- 作品数：104 被引量：280H指数：9
- 供职机构：贵州大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：贵州省农业科技攻关项目贵州省科技计划项目贵州省农业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 黔北麻羊FABP3基因多态性及其与生长性状的相关性研究被引量：6
- 2021年
- 旨在探究脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因在黔北麻羊中的遗传多态性,进一步揭示FABP3基因与黔北麻羊生长性状间的关联性,为今后运用分子标记辅助育种方法提高黔北麻羊的生长性状提供理论依据。本研究以120只6月龄黔北麻羊为试验对象,采用PCR产物直接测序技术检测FABP3基因全部外显子区的遗传多态性,并与体重、体高、体斜长、胸围、管围等生长性状进行关联性分析。结果:在黔北麻羊FABP3基因第5外显子和3′非翻译区筛选出2个SNPs位点,分别为g.13665051C>T和g.13664737G>A,其中g.13665051C>T位点为同义突变,产生3种基因型:CC、CT和TT,g.13664737G>A位点产生3种基因型:GG、AG和AA,卡方(χ^(2))检验结果显示,这2个SNPs位点处于中度多态且在黔北麻羊群体中均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。关联分析显示,g.13665051C>T位点中CT基因型个体的体高、体斜长、胸宽和管围显著高于CC和TT基因型个体(P<0.05);CT基因型个体的胸深、胸围显著高于TT基因型个体(P<0.05),g.13664737G>A位点中不同基因型的生长性状指标均未达到差异显著(P>0.05)。因此,推测黔北麻羊FABP3基因外显子5的g.13665051C>T突变位点可能是影响个体生长性状的重要位点。
- 艾锦新龙安炬罗卫星蔡惠芬
- 关键词：黔北麻羊生长性状多态性
- 一种多功能琼脂糖凝胶电泳槽
- 本实用新型公开了一种多功能琼脂糖凝胶电泳槽，包括槽体（1），左、右两个缓冲液槽（13）和左、右电极（2），在所述左、右缓冲液槽（13）之间设置有置胶台（12），在所述置胶台（12）上设置有凝胶点样板（3），所述缓冲液槽（...
- 蔡惠芬钱成黄兰康建兵孙岩岩刘彬罗卫星
- 文献传递
- 贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析
- 2014年
- 目的:采用DNA池结合PCR技术,筛选TFB1M基因启动子区SNP位点,并分析其对启动子区的影响。方法:利用多种生物信息学软件预测TFB1M基因核心启动子范围、转录因子结合位点、CpG岛。结果:TFB1M基因启动子区发现1个SNP位点G-234A。TFSEARCH软件预测结果显示TFB1M基因启动子区转录因子ADR1与Sp1位置调换,且ADR1位置的提前导致TFB1M基因转录效率增高。结论:G-234A位点可能影响TFB1M基因转录,试验结果为进一步分析TFB1M基因启动子区功能奠定基础。
- 孙岩岩罗卫星谢海强宋桃伟刘彬蔡惠芬
- 关键词：SNP启动子
- 贵州地方山羊BMPR-ⅠB基因启动子区多态性及生物信息学分析
- 2020年
- 为探究骨形态发生蛋白受体ⅠB(bone morphogenetic protein receptorⅠB,BMPR-ⅠB)基因启动子区多态性及其与繁殖性状的相关性,本试验以贵州3个地方山羊品种(黔北麻羊、贵州黑山羊及贵州白山羊)为研究对象,通过构建混合DNA池PCR产物直接测序技术筛选SNPs位点,并采用多种生物信息学软件预测SNPs位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响。结果显示,BMPR-ⅠB基因启动子区存在4个SNPs位点:g.29893005 T>C、g.29893016 C>T、g.29893729 C>G和g.29894370 C>T。生物信息学软件预测得到BMPR-ⅠB基因核心启动子区和CpG岛,SNPs位点导致转录因子结合位点发生改变,g.29893005 T>C和g.29893016 C>T突变使原来的转录因子结合位点Sp1消失;g.29893729 C>G突变使原来转录因子结合位点AP-1消失,从而产生新的转录因子结合位点USF;g.29894370 C>T突变产生新的转录因子结合位点C/EBPalp,使原来的转录因子结合位点Sp1改变为C/EBPalp和Sp1。由此推测,SNPs位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。
- 艾锦新龙安炬罗卫星蔡惠芬
- 关键词：启动子生物信息学
- 贵州黑山羊和黔北麻羊LEPR基因第7、8、10和18外显子的多态性分析
- 2016年
- 为探究LEPR基因的遗传多态性,丰富山羊LEPR基因的研究,本研究以贵州黑山羊和黔北麻羊为试验材料,运用DNA池结合直接测序方法进行LEPR基因SNPs位点的筛选,从而对突变的SNPs位点进行RNA二级结构以及所编码蛋白质的二级结构和三级结构进行生物信息学分析。在试羊LEPR基因中共发现4个SNPs,分别为Exon7-T81C(同义突变)、Exon8-C39T(同义突变)、Exon10-A70G(Asn-Ser)和Exon18-C94T(Ser-Leu)。分析表明,4个位点突变前后的等位基因频率、mRNA二级结构的最小自由能、LEPR蛋白质二级结构和三级结构均有改变。结果表明,LEPR基因拥有较为丰富的遗传多态性。
- 封竣淇徐伟康建兵钱成黄兰罗卫星蔡惠芬
- 关键词：SNPS贵州黑山羊黔北麻羊生物信息学
- 妊娠母猪膘情对繁殖性能的影响被引量：28
- 2010年
- 为研究妊娠母猪膘情与繁殖性能的关系,试验随机选用32头妊娠母猪,用B超活体测定其产前3 d倒数3、4肋骨间、胸腰椎结合处、腰荐椎结合处偏离背中线5-8 cm处背膘厚,并与其窝产仔数、产活仔数、死胎数、、仔猪初生重、初生窝重、18日龄断奶重、断奶窝重及断奶后发情天数等指标进行比较。结果显示,背膘厚度较薄组各项繁殖指标普遍优于背膘厚组,说明保持适当膘情对妊娠母猪繁殖性能的提高具有促进作用。
- 罗卫星蔡惠芬费佐元
- 关键词：妊娠母猪繁殖性能背膘厚B超
- 估测羊骨骼肌蛋白降解率的3-MH三分域模型构建与分析
- 2005年
- 蛋白降解率的准确测定一直是蛋白质周转代谢研究中的难点问题,本研究根据羊体内3-MeHis代谢和分布特点,以代谢动力学为基础理论,构建了由血液、非蛋白结合和肌肉蛋白结合3-MeHis组成的三分域模型,通过测定血液和尿液中被标记的3-MeHis的丰度,估测出了肌肉蛋白的降解分速率、肌肉3-MeHis库容量等12个变量。
- 施晓丽周安国郭春华蔡惠芬杨正德
- 关键词：骨骼肌蛋白降解
- 黄鳝不同发育阶段血清蛋白含量及电泳分析被引量：5
- 1999年
- 为研究黄鳝性逆转机理，对黄鳝不同发育阶段进行了血清蛋白含量的测定及血清蛋白醋酸纤维薄膜电泳分析，结果表明，雌雄黄鳝血清蛋白含量基本相同，而雌雄间体黄鳝的血清蛋白含量则有所增加。从电泳分析结果来看，黄鳝的雌、雄和雌雄间体三个不同发育阶段的各组分血清蛋白百分含量基本相似，都是α１球蛋白含量较高，其次是γ球蛋白，再次是α２球蛋白，白蛋白和β球蛋白较低。
- 范家佑蔡惠芬林艳红张小雪
- 关键词：黄鳝性腺发育血清蛋白电泳分析
- 一种动物组织采样刀
- 本实用新型公开了一种动物组织采样刀，包括刀片以及与刀片连为一体的压样筒，所述刀片的刀刃是由前段的锋利刃和后端的锯齿刃构成，在压样筒的筒壁上设置有取样孔。本实用新型采样刀的刀刃是由前段的锋利刃和后端的锯齿刃构成，在采集韧性...
- 罗卫星黄兰徐伟封竣淇蔡惠芬康建兵钱成刘彬孙岩岩
- 文献传递
- 黔北麻羊DKK1基因CDS区及部分内含子的多态性与生物信息学分析被引量：1
- 2018年
- 【目的】为黔北麻羊种质资源的综合开发利用提供参考。【方法】应用DNA池结合PCR产物直接测序方法检测黔北麻羊DKK1基因CDS区及部分内含子的多态性,应用生物信息学方法对黔北麻羊DKK1基因的蛋白特性进行预测和分析。【结果】在黔北麻羊的DKK1基因CDS区及部分内含子序列中筛选出8个SNP位点,分别为第1内含子C1626T位点,第3内含子A3083G位点,编码区的T3000C、T3228C、T3238C、G3240A、T3271A和T3411C位点。其中,T3271A为错义突变,导致半胱氨酸(Cys)变为丝氨酸(Ser),其他编码区的SNP位点均为同义突变。DKK1基因的CDS区包含有1条长789 bp的核苷酸序列,编码262个氨基酸,蛋白分子量为28 349.17 D;DKK1基因编码的整个多肽链表现为亲水性,并具有信号肽序列,剪切位点最有可能位于第31~32位氨基酸,在第15~37位氨基酸间存在1个典型的跨膜结构域;其二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲组成,属于mixed型蛋白;黔北麻羊DKK1基因编码的氨基酸与普通山羊、绵羊和牛等物种均具有较高同源性,基因系统进化情况与其亲缘关系基本一致。【结论】DKK1基因在进化上较保守,其可作为动物骨骼生长发育研究和相关疾病鉴定的重要候选基因。
- 封竣淇罗卫星张依裕蔡惠芬罗铮徐伟翁吉梅陈说
- 关键词：黔北麻羊多态性生物信息学
