郑将臣
- 作品数：10 被引量：20H指数：3
- 供职机构：中国水产科学研究院东海水产研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项安徽省教育厅项目农业部农业科技跨越计划项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 基于12S rRNA序列研究龟鳖类的系统进化特征
- 郑将臣万全程起群赵金良
- 关键词：龟鳖类12SRRNA基因分子分类系统进化
- 基于线粒体和核基因标记研究龟鳖目部分种类的系统发育关系
- 本论文基于线粒体12S核糖体RNA(mitochondrial12SribosomalRNA，12SrRNA)、线粒体16S核糖体RNA(mitochondrial16SribosomalRNA，16SrRNA)以及两个...
- 郑将臣
- 关键词：龟鳖目线粒体分子系统学
- 基于形态可量和框架性状的日本鲭和澳洲鲭的鉴别方法
- 本发明涉及一种基于形态可量和框架性状的日本鲭和澳洲鲭的鉴别方法，包括：选取体高、头长、吻长、眼径、眼间距、尾柄长和尾柄高7个可量参数；选取8个坐标点构建的15个框架参数；将上述的7个可量参数和15个框架参数分别进行判别分...
- 程起群黄昊郑将臣
- 文献传递
- 基于两个核基因序列研究龟鳖类的系统进化特征被引量：4
- 2011年
- 为从核基因的角度探讨龟鳖类的系统发育特征,采用PCR扩增和测序的方法,获得两种龟的R35内含子部分序列以及6种龟的RAG2基因部分序列,结合NCBI其它龟鳖的同源序列一并进行分析。结果表明:将R35序列比对后得到941 bp的一致序列,将RAG2比对后得到620 bp的一致序列,二者合并后,比对排序后得到1561 bp的一致序列,其中共有505个可变核苷酸位点,总变异率为32.35%;简约信息位点为239个,插入/缺失为139个,转换/颠换比率为1.64。碱基A、T、G、C的平均含量分别为29.5%、28.5%、22.8%、19.2%。海龟科和鳄龟科之间Kimura双参数(K-2-P)遗传距离最小(0.025),鳖科和南美侧颈龟科之间的遗传距离最大(0.182)。分子系统树结果显示:1)陆龟科与潮龟科先聚在一起,再与龟科聚在一起,陆龟科与潮龟科构成一个单系类群;2)支持陆龟总科与鳄龟科+海龟总科构成姐妹群;3)鳄龟科和海龟总科是姐妹群的关系。
- 郑将臣万全程起群赵金良
- 关键词：龟鳖类分子分类系统进化
- 基于12SrRNA序列研究龟鳖类的系统进化特征被引量：10
- 2010年
- 为研究龟鳖类的系统进化关系,以期为龟鳖类的保护和合理开发利用提供基础资料,测定了15种龟类线粒体12SrRNA基因片段的序列。比对后获得一致序列长为433 bp,有191个变异位点,总变异率为43.2%,其中简约信息位点108个。A、T、G、C的平均含量分别为21.46%、34.42%、25.85%和18.27%。A＋T含量（55.9%）高于G＋C含量（44.2%）。在433个核苷酸位点中,有插入/缺失35个,转换为34,颠换为21,转换/颠换比率为1.67。与NCBI上其它一些龟鳖的序列进行比对后,得到414 bp的一致序列,其中236个为变异位点,总变异率为57.00%;简约信息位点181个。A、T、G、C的平均含量分别为35.7%、22.2%、18.1%、24.0%。A＋T含量（57.9%）高于G＋C含量（42.1%）。在414个核苷酸位点中,转换为30,颠换为14,转换/颠换比率为2.12。基于Kimura双参数模型分析龟鳖类种间、属间、科间遗传距离,并用邻接法构建分子系统树。结果显示：7种闭壳龟种间差异在0~0.043,平均为0.022;淡水龟科属间遗传距离为0.007~0.140,平均为0.074;曲颈龟亚目9个科间（不包括平胸龟）遗传距离为0.055~0.197,平均为0.139。由此认为,淡水龟科与陆龟科亲缘关系比龟科更近;不支持将闭壳龟属拆分为闭壳龟属和盒龟属;支持将平胸龟属归为鳄龟科的一个属。
- 万全郑将臣程起群赵金良
- 关键词：龟鳖类12SRRNA基因分子分类系统进化
- 基于16SrRNA序列探讨龟鳖类的遗传分化和系统发生被引量：11
- 2011年
- 用PCR和测序的方法,获得13种龟鳖类的线粒体16SrRNA基因片段序列,结合NCBI收录的47种龟鳖的线粒体16SrRNA基因序列,分析龟鳖类的遗传分化和系统发生。结果表明,对60条序列进行比对后得到480 bp的一致序列,其中,可变位点229个,总变异率为47.7%;简约信息位点186个,插入/缺失80个。腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)4种碱基的平均含量分别为33.6%、24.3%、18.5%、23.7%,转换与颠换比为1.95。7种闭壳龟种间的遗传距离为0.004～0.063,平均为0.03;潮龟科17个属间的遗传距离为0.053～0.120,平均为0.091;曲颈龟亚目8个科间(不包括平胸龟)的遗传距离为0.071～0.259,平均为0.169。龟科是陆龟科与潮龟科的姐妹群,潮龟科与陆龟科的亲缘关系比龟科与陆龟科的亲缘关系要近;应将乌龟重新归入拟水龟属,将锯缘龟纳入闭壳龟属;闭壳龟属不应拆分为闭壳龟属和盒龟属,即不将黄缘盒龟和黄额盒龟归入盒龟属。
- 郑将臣万全程起群赵金良
- 关键词：龟鳖类16SRRNA基因遗传分化分子进化
- 基于线粒体细胞色素b序列的日本鲭和澳洲鲭的鉴别方法
- 本发明涉及一种基于线粒体细胞色素b序列的日本鲭和澳洲鲭的鉴别方法，包括：提取日本鲭与澳洲鲭肌肉组织中总基因组DNA；PCR扩增反应；PCR产物测序及校对；Cytb碱基矩阵的构建。本发明方法简单、快速、准确、高效的鉴别这两...
- 程起群黄昊郑将臣
- 文献传递
- 一种日本鲭和澳洲鲭的鉴别引物及其鉴别方法
- 本发明涉及一种日本鲭和澳洲鲭的鉴别引物及其鉴别方法，引物序列为：FP：5’-TTCCTATTTTGAACCCTTGTCG-3’；RP：5’-GCGTCGTGGGCTTCTGTAT-3’鉴别方法，包括：提取日本鲭与澳洲鲭肌...
- 程起群黄昊郑将臣
- 文献传递
- 基于形态可量和框架性状的日本鲭和澳洲鲭的鉴别方法
- 本发明涉及一种基于形态可量和框架性状的日本鲭和澳洲鲭的鉴别方法，包括：选取体高、头长、吻长、眼径、眼间距、尾柄长和尾柄高7个可量参数；选取8个坐标点构建的15个框架参数；将上述的7个可量参数和15个框架参数分别进行判别分...
- 程起群黄昊郑将臣
- 基于形态和分子标记的三种鲭科鱼类鉴别新方法被引量：2
- 2011年
- 为找到日本鲭(Scomber japonicus)、澳洲鲭(S.australasicus)和羽鳃鲐(Rastrelliger kanagurta)这三种鲭科鱼类鉴别的新标记,采用形态框架等形态分析方法和线粒体标记的方法开展研究。共分析采自海南的33 ind样本,其中日本鲭19 ind,澳洲鲭9 ind,羽鳃鲐5 ind。形态判别分析显示,利用2个可量参数(体高和眼径)或者3个框架参数[D(2-3)、D(3-5)、D(2-4)]构建的判别公式均能鉴别这三种鲭科鱼类,判别准确率均为100%。通过PCR扩增和测序,获得三种鲭科鱼类的线粒体细胞色素b(Cytb)和控制区(D-loop)序列。经对位排列,得到33 ind样本Cytb和D-loop的一致序列分别为1 118 bp和846 bp。Cytb基因共检出17个单倍型,变异位点195个,其中10个固定位点是日本鲭所特有,8个固定位点是澳洲鲭所特有,147个固定位点为羽鳃鲐所特有;D-loop序列共得到27个单倍型,变异位点239个,其中13个固定位点为日本鲭所特有,10个固定位点为澳洲鲭所特有,182个固定位点为羽鳃鲐所特有。这些固定位点可以作为三种鲭科鱼类鉴别的分子标记。
- 黄昊程起群郑将臣
- 关键词：鲭科形态分析分子标记物种鉴别资源管理
