闫杰
- 作品数：4 被引量：25H指数：3
- 供职机构：上海海洋大学海洋科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科委重大科技攻关项目上海市卫生系统百名跨世纪优秀学科带头人培养计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 东太平洋公海茎柔鱼种群遗传结构初步研究
- 茎柔鱼/(Dosidicus gigas/)属头足纲、枪行目、柔鱼科、柔鱼亚科、茎柔鱼属。茎柔鱼为大洋性浅海种，分布在中部太平洋以东的海域，即在125°W以东加利福尼亚半岛（30°N）至智利（30°S）一带水域，范围甚广...
- 闫杰
- 关键词：茎柔鱼CYTB系统发育树
- 文献传递
- 西南大西洋阿根廷滑柔鱼遗传多样性的微卫星分析被引量：3
- 2013年
- 西南大西洋阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)是重要的经济大洋性头足类,其种群结构较为复杂。本研究采用8个微卫星标记,对西南大西洋阿根廷滑柔鱼群体的遗传多样性进行了检测。8个基因座位上,共检测出172个等位基因,每个基因座位检测到10～30个等位基因不等。8个位点的平均观测等位基因数为21.500 0,平均有效等位基因数为12.074 1。各位点的观测杂合度(Ho)变化范围为0.300 0～0.775 0,期望杂合度(He)为0.484 2～0.977 0,平均观测杂合度为0.504 6,平均期望杂合度为0.873 4。8个微卫星位点的多态信息含量(PIC)平均值为0.853 6。以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡,发现8个基因座位均不符合Hardy-Weinberg平衡。Fst分析显示该群体无明显的遗传分化。研究结果揭示:西南大西洋阿根廷滑柔鱼种群显示了高水平的微卫星多态性,该海域阿根廷滑柔鱼群体的遗传多态性水平在经历了近十年的密集捕捞压力后没有明显的变化,同时证明微卫星分子标记是研究该物种自然种群的有利工具。
- 闫杰许强华陈新军
- 关键词：阿根廷滑柔鱼微卫星
- 基于线粒体DNA分子标记的东太平洋茎柔鱼群体遗传多样性比较分析被引量：11
- 2013年
- 为合理开发利用东太平洋茎柔鱼资源，需要准确掌握其种群结构。基于线粒体细胞色素b（Cytb）与细胞色素氧化酶Ⅰ（COⅠ）2个分子标记对茎柔鱼赤道海域与秘鲁外海2个地理群体的遗传多样性现状进行比较分析。分析认为，基于Cytb基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、（0．397±0．079）、（0．00109±0．00096）和0．600，秘鲁外海群体单倍型多样性指数仅为（0．282±0．101），明显低于赤道海域群体。基于COⅠ基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为17、（0．787±0．051）、（0．00290±0．00138）和1．802。单倍型网络关系图及两两群体间遗传分化系数Fst分析结果显示，赤道海域群体与秘鲁外海群体不存在显著的遗传差异（Cytb：Fst=0．00591，P〉0．05；COⅠ：Fst=0．05523，P〉0．05），2个地理群体可能在赤道海域海流的作用下发生基因交流。单倍型网络关系图、中性检验和核苷酸不配对分析结果均表明，茎柔鱼经历过近期群体扩张事件，发生群体扩张的时间在138900～167900年前。
- 刘连为许强华陈新军闫杰余为王从军
- 关键词：茎柔鱼细胞色素B基因
- 东太平洋公海茎柔鱼种群遗传结构初步研究被引量：14
- 2011年
- 根据2009年7月到10月我国大型鱿钓渔船在东太平洋(81.9°～94.9°W,8.9°N～11.3°S)秘鲁和哥斯达黎加外海作业期间采集的样本,利用线粒体DNA细胞色素b基因的724 bp部分序列,分析了采自秘鲁7个采样点和哥斯达黎加3个采样点的155个个体的序列多样性与种群遗传结构。结果显示,724 bp片段中发现了16个变异位点,155个个体出现43个单倍型。序列多样性分析结果揭示,155个个体的平均单倍型多样性指数为0.873,核苷酸多样性指数为0.003 69。群体间共享6个单倍型,秘鲁外海茎柔鱼群体享有最多特有单倍型(20个)。分子方差分析揭示,82.70%的遗传变异性出现在种群内;群体间的FST分析揭示部分秘鲁群体与哥斯达黎加群体,部分秘鲁群体间存在着显著的遗传分化;而哥斯达黎加群体内部不存在显著的遗传分化。
- 闫杰许强华陈新军李纲刘必林
- 关键词：茎柔鱼细胞色素B系统发育树
