关鹰
- 作品数:6 被引量:7H指数:1
- 供职机构:浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金浙江省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析
- 2013年
- 以紫竹(Phyllostachys nigra)一年紫嫩叶的cDNA为材料获得一个多酚氧化酶基因(命名为PnPPO1)片段,测序显示,该序列长438 bp,该片段编码有146个氨基酸残基组成的多酚氧化酶保守区,该区域包含CuB结合区,其编码的蛋白属于酪氨酸酶(tyrosinase)。Blastp分析显示,该氨基酸序列与小麦(Triticum aestiv)、水稻(Oryza sativa)中的多酚氧化酶有很高的同源性。该蛋白片段分子量约为36.2 kD,pI为5.03。比对一年紫和台湾紫中该基因的序列发现,两者同源性为84.45%,两者间还存在明显的SNP位点会导致酶切点位发生变化和新酶切位点的产生。RT-PCR分析结果表明,PnPPO1基因在叶芽中表达最高,鞭根中微量表达,其余供试组织中未检测到其表达。
- 关鹰王弋郭小勤林新春方伟
- 关键词:多酚氧化酶单核苷酸多态性
- 孝顺竹中INDETERMINATE1同源基因的克隆及表达分析
- 本文采用同源克隆的方法从孝顺竹(Bambusa multiplex)中克隆到了ID1同源基因,并命名为BmID1。核苷酸序列分析表明:BmID1基因含有4个外显子和3个内含子。氨基酸序列显示:其具有ID-domain基因...
- 关鹰王倩郭小勤方伟
- 关键词:孝顺竹同源基因基因克隆原核表达
- 毛竹IDD基因家族的生物信息学分析被引量:7
- 2014年
- IDD基因家族编码一种混合型的转录因子,本文通过本地Blast从毛竹(Phyllostachys heterocycla)基因组数据库获取到了9个IDD家族基因,并命名为PhID1和PhIDD1-8,其氨基酸序列均具IDDdomain结构特征,一个假定的核定位信号、2个C2H2和2个C2HC。氨基酸理化性质分析发现,PhIDD蛋白均为亲水性蛋白,含量较多是丙氨酸(Ala)、丝氨酸(Ser)和甘氨酸(Gly),全序列等电点分布在8.8-9.7之间,仅PhIDD2蛋白的等电点为5.6。除PhIDD2外,IDD-domain的等电点与全序列等电点基本一致。PhIDD蛋白二级结构含量分析发现无规则卷曲和α-螺旋含量最多,β-转角和延伸链分布在整个蛋白中。蛋白磷酸化位点预测结果显示磷酸化位点数量在20-29个不等。三维结构分析显示,PhIDD1在63-175氨基酸处,会形成α-螺旋,β-折叠及无规则卷曲及明显的锌原子结合位点。
- 关鹰许在恩郭小勤
- 关键词:毛竹转录因子生物信息学
- 孝顺竹成花决定同源基因BmID1的克隆及表达特性分析
- 竹子开花后会出现死亡的现象,给竹林经营带来严重的负面影响。研究和解决竹子开花已成为竹林可持续经营不可忽视的问题。水稻(Oryza sativa)和玉米(Zea mays)成花相变开关基因RID1//OsID1//Ehd2...
- 关鹰
- 关键词:孝顺竹启动子分析
- 文献传递
- 雷竹中PvFT同源基因的克隆及表达特性分析
- 本论文通过同源克隆方法克隆了雷竹(Phyllostachys violascens)中FT的同源基因,获得了FT同源基因PvFT-2的编码区序列。基因组DNA序列与cDNA序列比对表明,该基因含4个外显子和3个内含子,该...
- 王弋关鹰郭小勤林新春方伟
- 关键词:雷竹成花机理同源基因克隆表达
- 文献传递
- 雷竹PvFT1基因的原核表达分析
- 本论文通过对雷竹(Phyllostachys violascens)中的PvFT1进行表达特性分析。将PvFT1基因的整个ORF区构建到原核表达载体中,并将其转入大肠杆菌,用IPTG进行诱导表达。蛋白电泳结果表明:不同温...
- 王倩关鹰郭小勤林新春方伟
- 关键词:雷竹原核表达大肠杆菌