余斐 作品数:43 被引量:363 H指数:13 供职机构: 浙江大学医学院附属第一医院 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 浙江省教育厅科研计划 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 天文地球 更多>>
苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者病毒检测及临床特征分析 被引量:16 2019年 目的分析苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者常见病毒及患儿临床特征,为婴幼儿急性腹泻的流行病学研究和临床治疗提供参考。方法选取2010至2014年苏浙闽地区多家医院门诊就诊的急性腹泻患儿1 452例,采用ELISA法检测A组轮状病毒(HRV),多重PCR法检测诺如病毒(NoV)、肠道腺病毒(EAdV)和星状病毒(HAstV),并用RT-PCR法对A组轮状病毒阳性的样本进行G和P分型。结果 1 452例患儿中由常见病毒引起的急性腹泻患儿有707例,占总调查患者的48.69%。急性腹泻患儿常见病毒感染中单一病毒感染占90.10%(637/707),其感染病毒的构成以轮状病毒最多(47.52%,336/707),其次为诺如病毒(36.07%,255/707)以及星状病毒(2.40%,17/707)和肠道腺病毒(4.10%,29/707)。病毒感染腹泻患儿中多重感染者共70例,占9.90%(70/707),以A组轮状病毒合并诺如病毒感染最为常见,占多重感染者的68.57%(48/70)。226份A组轮状病毒阳性标本中,G分型以G1为优势分型,占33.19%;P分型中则以P [11]比例最高,占38.50%;G、P型组合以P [11]G11为主(38.50%)。结论 A组轮状病毒是引发婴幼儿急性腹泻的主要病毒,诺如病毒次之,且婴幼儿病毒性腹泻患者可合并多种病毒感染。不同地区腹泻患儿病毒感染阳性率有差异,轮状病毒基因型表现则具有多样性。 何佳慧 崔大伟 杨先知 谢国良 郑书发 余斐 董月皎 陈瑜关键词:婴幼儿 急性腹泻 2009~2013年189株嗜水气单胞菌的临床分布与耐药性 被引量:10 2016年 目的了解本地区临床感染嗜水气单胞菌的分布特点及耐药情况。方法对该院2009~2013年感染性患者标本中分离的嗜水气单胞菌的分布和耐药性进行回顾性分析。结果 5年间共分离到嗜水气单胞菌189株,其中肠道内感染菌株132株,肠道外感染的57株。肠道外感染的菌株多来源于肝胆疾病(20例)、血液系统肿瘤(10例)等患者的血液(26.3%)、胆汁(21.1%)等标本。嗜水气单胞菌的感染多发于夏秋季,50岁以上的中老年人。肠道内与肠道外感染的嗜水气单胞菌的耐药率存在差别,但对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑啉、阿莫西林-克拉维酸、头孢西丁均有较高的耐药率(〉51.1%),肠道外感染嗜水气单胞菌仅对左氧氟沙星、亚胺培南、阿米卡星、美洛培南较敏感(耐药率〈10%)。结论该地区嗜水气单胞菌的感染高发于夏秋季、中老年人,以肠道内感染常见,但其对抗菌药物的敏感性较好;肠道外感染多见于肝胆疾病、肿瘤等患者,耐药率较高且在不断上升。临床医师应根据感染部位区别对待,参考药敏选药并继续加强监测。 万颖 陈晓 余斐 张文 陈瑜关键词:嗜水气单胞菌 耐药性 浙江5个地区2010~2012年沙门菌流行特征及分子分型研究 被引量:11 2013年 目的了解浙江部分地区沙门菌感染的流行病学特点,为防治提供科学依据。方法收集浙江省杭州、宁波、嘉兴、衢州、绍兴5个地区2010~2012年临床分离的沙门菌94株,对其进行血清分型、K-B纸片法药物敏感性试验。用二重PCR法检测毒力岛基因invA和毒力质粒基因spvB,并进行多位点序列分型;用多位点序列分型软件Dna SP version 5.0对7个管家基因进行核苷酸多态性分析。结果 94株沙门菌共测出18种血清型,其中肠炎沙门菌29株(30.9%),鼠伤寒沙门菌27株(28.7%),甲型副伤寒沙门菌10株(10.6%),纽波特沙门菌和伊鲁慕沙门菌各5株(5.3%),猪霍乱沙门菌4株(4.3%),伤寒沙门菌和婴儿沙门菌各2株(2.1%),其余10种血清型均各分离到1株。94株沙门菌耐药率最高的为氨苄西林47株(50.0%),耐药率最低的为头孢吡肟1株(1.1%);非耐药菌株占所有菌株的46.8%(44/94)。毒力岛基因invA和毒力质粒基因spvB阳性率分别为97.9%(92/94)和45.7%(43/94)。94株沙门菌经MLST分析分为24种ST型,以ST11型菌株最多,占29.8%(28/94);上报网站http://mlst.ucc.ie/mlst/新ST型5型,分别为ST1746、ST1747、ST1748、ST1749和ST1750。结论浙江5个地区临床分离的沙门菌以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,质粒毒力基因spvB在这两种主要血清型中有较多的分布。94株沙门菌的耐药情况尚好,非耐药株数量接近半数。血清分型与多位点序列分型存在一定的联系。 杨燕 孙长贵 陈晓 余斐 陈瑜关键词:沙门菌属 血清分型 多位点序列分型 流行病学特征 杭州地区2014-2015年急性胃肠炎患者感染诺如病毒的流行病学特征分析 被引量:29 2016年 目的 了解2014-2015年杭州地区急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学特征。方法 收集1 109份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便样本,采用一步法双重荧光RT-PCR对样本中诺如病毒(GⅠ、GⅡ型)进行初筛,然后随机选择诺如病毒阳性的样本核酸进行多重RT-PCR扩增,对产物进行测序分析。结果 1 109份的粪便样本中,诺如病毒检出率为26.87%(298/1 109),以GⅡ亚型为主,占25.52%(283/1 109),GⅠ亚型占1.35%(15/1 109);不同性别人群诺如病毒检出率差异无统计学意义(P〉0.05);不同年龄组人群中诺如病毒检出率分别为16.94%(〈5岁)、19.45%(5~18岁)和32.26%(≥18岁);全年均可检出诺如病毒感染,高发季节为12月至次年3月,阳性率为29.67%~37.08%。序列分析显示,GⅡ基因亚型中以GⅡ-4/Sydney株为主(46.43%,13/28),其次为GⅡ-4/2006b株;GⅠ基因亚型中以GⅠ-1亚型为主(55.56%,5/9)。结论 诺如病毒是导致2014-2015年杭州地区急性胃肠炎的主要病原之一,GⅡ基因亚型特别是GⅡ-4/Sydney变异株和GⅡ-4/2006b变异株是该地区流行的优势毒株。 崔大伟 李中杰 林洁 靳淼 杨先知 谢国良 郑书发 余斐 陈瑜关键词:诺如病毒 急性胃肠炎 聚合酶链反应 基因型 两种流感病毒快速抗原检测试剂与rRT-PCR方法结果的比较 目的:以rRT-PCR方法为标准,评估两种流感病毒快速抗原检测试剂盒筛查甲型流感病毒和乙型流感病毒的敏感性,为临床实验室选择合适的方法提供数据支持。方法:挑选来源于浙江大学医学院附属第一医院发热门诊的流感病毒阳性标本11... 余斐 曾英 陈瑜国产实验室新型冠状病毒核酸快速检测试剂上市后多中心临床评价 2022年 目的对我国已批准上市的5种新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸快速检测试剂进行多中心临床评价。方法2020年11月在浙江大学医学院附属第一医院、华中科技大学同济医学院附属同济医院和中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所3家机构选取共计57份确诊2019-nCoV感染者及15份非感染者的咽拭子样本,对获批上市的5种2019-nCoV核酸快速检测试剂进行检测,分析阳性符合率、阴性符合率、总符合率,并分析阳性强度与阳性符合率的关系,检测时间和复检率情况。结果5种试剂盒阳性符合率为92.59%(50/54)、83.64%(46/55)、98.25%(56/57)、94.44%(51/54)和98.18%(54/55);阴性符合率为93.33%(14/15)、93.33%(14/15)、86.67%(13/15)、100%(14/14)和93.33%(14/15);总符合率为92.75%(64/69)、85.71%(60/70)、95.83%(69/72)、94.20%(65/69)和97.14%(68/70)。5种试剂盒对强阳性和中阳性标本的检出率均为100%(90/90、84/84),对循环阈值33以上的弱阳性样本检出率为82.18%(83/101),2种试剂盒的复检率高于10%,分别为15.28%(11/72)和12.50%(9/72)。5种试剂盒从提取到扩增检测所需平均总时长在32.33~65.33 min。结论5种2019-nCoV核酸快速检测试剂盒性能均较好,可以作为常规核酸检测的补充。 冯永辉 余斐 鲁艳军 杨梦婕 张靖 韩晓旭 尚红关键词:新型冠状病毒 实时荧光定量PCR 浙江省腹泻患者致泻性大肠埃希菌血清型分布及其鉴定效率的评价 被引量:5 2017年 目的 了解浙江省致泻性大肠埃希菌(DEC)血清型分布并探讨其血清学鉴定分类方法的鉴定效率。方法 对2009年7月至2013年6月浙江省腹泻症候群病原谱监测网络菌株库中的696株DEC菌株(通过毒力基因鉴定)开展血清学凝集试验,比较毒力基因和血清学鉴定分类的结果。结果 696株DEC中288株(41.4%)能明确O抗原型别,分属于35种O血清群。171株(24.6%)H血清凝集,分属于21种H型。肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)、产肠毒素性大肠埃希菌(ETEC)、肠致病性大肠埃希菌(EPEC)和肠出血性大肠埃希菌(EHEC)凝集率分别为31.9%(130/408)、70.6%(127/180)、31.5%(29/92)和14.3%(2/14),分属于30、18和15种O血清群,1株EHEC为O157∶H7。EAEC和EPEC血清群相对较多样化,而ETEC则相对集中,不同类型DEC可具有同一血清群/型。根据血清学结果可分类的75株DEC中,42株毒力基因和血清学分类结果一致,33株不一致。结论 浙江省DEC血清群/型种类多样,单纯采用血清学筛查可造成极大的漏检或误分,建议采用毒力基因鉴定分类。 余斐 王若南 陈晓 郑书发 王忆吟 陈瑜关键词:致泻性大肠埃希菌 毒力基因 血清型 浙江省急性腹泻副溶血弧菌的流行及多位点序列分型分析 被引量:8 2012年 目的了解浙江省2010年急性腹泻患者中副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)的分布与分子分型特征,为副溶血弧菌的分子流行病学研究提供参考依据。方法对急性腹泻病例的粪便标本进行致病菌分离培养,采用纸片扩散法(Kirby-Bauer)开展副溶血弧菌分离株药敏试验,利用多位点序列分型(MLST)进行副溶血弧菌分子分型研究。结果从1 812例腹泻病患者粪便标本中检出病原菌552株,其中副溶血弧菌150株,分离率为8.3%(150/1 812),居细菌性病原第二位。副溶血弧菌感染主要发生在7—9月份,并以18~45岁青壮年发病为主。副溶血弧菌对头孢吡肟和碳氢酶烯类抗生素(亚胺培南、美洛培南)的敏感性达到100%,但对氨苄西林、头孢唑啉耐药率却分别达到了81.3%和63.4%。50株副溶血弧菌菌株MLST分型结果为ST-3型47株,ST-120型2株,ST-8型1株。结论浙江省副溶血弧菌感染在夏秋季急性腹泻中占有重要地位,ST-3是最主要的流行克隆株。长期持续监测副溶血弧菌,对于防控其在环境和人群中的传播具有重要意义。 韩东升 陈晓 李中杰 郑书发 余斐 陈瑜关键词:急性腹泻 副溶血弧菌 多位点序列分型 杭州地区2009-2014年非结核分枝杆菌流行状况分析 被引量:30 2016年 目的研究近6年杭州市非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)的流行状况。方法采用基因芯片和16SrRNA测序法鉴定2009年1月至2014年12月本院微生物实验室结核菌培养阳性的分离,并对相关资料进行总结分析。结果 6年间,从789例患者标本中分离798株分枝杆菌(剔除重复菌株),NTM分离株171株,占21.4%,从2009年的11.9%上升到2014年的25.8%,MTB的构成比例降低和NTM比例升高的趋势有统计学意义(P=0.014)。NTM种群分布达18种,最常见的是胞内分支杆菌、鸟分支杆菌和脓肿分支杆菌,分别占30.4%、26.3%和20.5%。NTM阳性患者中,男性占66.3%,女性占33.7%,45-74岁年龄段合计占65.5%。抗酸杆菌涂片检查阳性的病例中NTM检出率由2009年的8.0%上升到2014年的22.0%,趋势分析P=0.014。结论杭州地区分枝杆菌中NTM构成比例持续升高,2014年已达25.8%,以胞内分支杆菌、鸟分支杆菌和脓肿分支杆菌为主。开展NTM菌种鉴定,对鉴别诊断和有效治疗有重要意义。 余斐 陈晓 嵇仲康 徐凯进关键词:分枝杆菌 非结核分枝杆菌 菌种鉴定 基因芯片 RRNA 杭州地区2009-2010年急性腹泻患者中杯状病毒的检测和分型 被引量:6 2011年 目的了解2009--2010年杭州地区急性腹泻患者中杯状病毒基因型别和分子流行病学特征。方法收集2009--2010年杭州地区920例急性腹泻患者的粪便标本和流行病学资料,用多重PCR方法进行杯状病毒检测,测定部分标本的阳性扩增片段基因序列,并对序列进行系统进化分析。结果急性腹泻患者杯状病毒检出率为21.8%(201/920),其中诺如病毒(Nv)GI型25例、GⅡ型170例、札如病毒(SAV)11例,4例为NVI型和Ⅱ型混合感染、1例为NVⅡ型和SAV混合感染。NV基因型别包括:GI-1(3株)、GI-2(1株)、GⅡ-4/2006b变异株(7株)、GⅡ-2(1株)、GⅡ-7(1株)和GⅡ-4/2008变异株(2株);SAV基凶型别包括:GI-2(5株)、GI-1(4株)和GⅡ-1(1株)。杯状病毒的流行在不同季节、年龄组人群均有发病。结论杯状病毒是2009—2010年引起杭州地区急性腹泻的主要病原之一,其病原具有病毒多样性和基因型别多样性,NVGⅡ-4/2006b变异株或类似株可能是2009--2010年杭州地区流行的优势株。 诸葛小玲 崔大伟 吴英萍 郑书发 靳淼 段招军 余斐 许世佳 陈凌晓 陈瑜关键词:杯状病毒 诺如病毒 札如病毒 基因型别