孙琳
- 作品数：14 被引量：2H指数：1
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生文学文化科学更多>>
- 依折麦布联合他汀类药物对肾病作用的研究进展
- 目的:研究依折麦布（Ezetimibe，EZ）联合他汀类降脂药物在降低血脂的同时，对患者血管内皮细胞及对肾功能的保护作用，探讨依折麦布联合他汀类降脂药物在降低心血管事件发生率和患者全因死亡率方面的益处，并为今后肾脏病合并...
- 孙琳
- 关键词：依折麦布他汀类药物血管内皮细胞肾脏疾病肾功能保护
- 磁共振检测脑出血敏感性及梗死后T1高信号病例分析
- 本研究的目的是评价磁共振序列检测脑出血的敏感性，鉴别及分析梗死后T1WI高信号病例。
方法：33位磁共振常规序列怀疑、不能除外脑出血的患者分别追加磁共振FFET*2WI及CT扫描。判别不同磁共振序列及CT对脑出...
- 孙琳
- 关键词：脑出血
- 文献传递
- PLS-DA变量筛选中偶然相关效应的评价研究
- 偏最小二乘判别分析(PLS-DA)是代谢组学中常用的多元分析方法,利用PLS-DA建立多变量模型常涉及差异变量的筛选.通过变量筛选剔除数据中的非信息噪声变量,简化模型复杂程度,提升模型性能.由于高维组学数据变量和观测数不...
- 孙琳刘美娜
- 基于PLS-DA的IgG介导的鸡肉不耐受差异蛋白筛选及通路识别
- 2023年
- 目的筛选鸡肉不耐受患者与健康人之间的差异蛋白,富集分析识别差异蛋白的相关通路,为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。方法收集鸡肉不耐受患者及健康对照的血清样本,利用DIA技术平台对样本进行蛋白组学检测;PLS-DA结合PPI分析筛选具有相互作用的蛋白质,Cytoscape获得鸡肉不耐受患者与对照组间的差异蛋白;GO和KEGG富集分析获得差异蛋白的生物学通路与代谢通路。结果血清样本的蛋白表达数据检测结果,共获得2210种蛋白质。PLS-DA分析筛选出和鸡肉不耐受相关的蛋白质786个,结合蛋白互作分析获得PPI网络,聚类后得到两个主要的模块:cluster1和cluster2;cluster1包括18个蛋白质,cluster 2包括12个蛋白质。两模块蛋白质进行重要性排序,筛选出鸡肉不耐受患者与健康对照间的差异蛋白为:ORM1、FGB、SERPINF2、HRG、A2M、ORM2和QSOX1。前五个为上调蛋白质,后两个为下调蛋白质。cluster1评分为10.12,GO富集分析发现差异蛋白主要参与血小板脱颗粒、肽链内切酶活性的负调节、炎症反应等生物学通路,KEGG分析富集到补体和凝血级联通路;cluster 2评分6.00,共包括12个蛋白质,GO富集分析发现差异蛋白与急性期反应、血小板脱颗粒、固有免疫应答等生物学通路有关,KEGG分析富集到补体和凝血级联通路、阮病毒病和系统性红斑狼疮的疾病通路。结论本研究筛选出7个与IgG介导的鸡肉不耐受相关的差异蛋白,其参与的生物学和代谢通路与机体免疫、炎症过程有关,在免疫、炎症发生发展中可能起重要作用,将为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。
- 赵思渊孙琳田伟刘美娜
- 关键词：差异蛋白蛋白组学
- 压缩感知理论在小样本量蛋白质组学变量筛选研究中的应用被引量：1
- 2019年
- 目的探索基于压缩感知理论变量筛选方法在小样本量蛋白质组学研究中应用的效果和特点,为小样本量的蛋白质组学的变量筛选提供更灵敏、可靠的方法。方法模拟实验比较基于CS理论的变量筛选方法与偏最小二乘(PLS)及随机森林(RF)筛选变量的能力,通过灵敏度、特异度及平衡准确度评价其变量筛选效果;利用CS变量筛选方法筛选非小细胞肺癌两亚型组(腺癌和鳞状细胞癌)的差异蛋白。结果模拟实验表明,CS理论的变量筛选方法在样本量较小时具有较好的变量筛选效果,灵敏度、特异度及平衡准确度均较高;利用基于CS理论的变量筛选方法筛选,获得肺腺癌和鳞状细胞癌间差异表达蛋白22种,被证明是肺腺癌和鳞状细胞癌间有差异的蛋白为:Cytokeratin 6A、Cytokeratin 6B、Cytokeratin 6C、PKP1、P63、MCT1。结论基于CS理论的变量筛选方法在样本量特别少时,筛选变量的效果优于PLS和RF,更适用于小样本蛋白质组学数据变量筛选研究。
- 张薇张秋菊王玉鹏谢彪孙琳高兵叶倩田伟侯小文刘美娜
- 关键词：压缩感知蛋白质组学小样本
- 基于ESPCA模型的结肠癌差异基因筛选研究
- 2021年
- 目的验证ESPCA模型降维及变量选择的效果优于SPCA;利用ESPCA模型分析结肠癌基因数据,寻找不同主成分的通路信息,筛选结肠癌的差异基因。方法模拟实验比较ESPCA模型与SPCA的降维及变量选择能力,通过灵敏度、特异度、准确度评价其变量筛选效果;收集TCGA结肠癌基因数据,利用ESPCA模型对结肠癌基因数据进行降维及变量筛选。结果模拟实验获得的ESPCA模型具有较高的灵敏度、特异度和准确度,降维及变量选择效果优于SPCA。结肠癌数据分析结果显示:降维后ESPCA模型第一主成分中基因与18条GO-BP通路及7条KEGG通路有关,ESPCA模型第二主成分中基因与19条GO-BP通路有关;根据度中心性及中介中心性对主成分基因排序筛选出6个差异基因:MYC、CD44、PKM、FBL、PSMA7、RPS2,经GSE137327数据集验证具有较高的AUC值。结论ESPCA模型在降维过程中既考虑数据本身信息,又考虑了生物网络信息,具有良好的降维及变量选择效果。结肠癌数据分析中ESPCA第一主成分中基因参与癌症相关的通路;ESPCA第二主成分中基因参与的通路与免疫相关;通路中基因参与癌症的发生发展过程、可能通过免疫反应相关通路调节结肠癌的发生发展过程;获得的6个结肠癌差异基因可为研究疾病发生机制和鉴别诊断提供依据。
- 李称张秋菊孙琳丛雨欣赵敏刘美娜
- 关键词：降维方法
- 计算机辅助诊断房颤患者左心耳功能及血栓--经食道超声心动图的评价
- 孙琳
- 心肌肌钙蛋升高类型、心血管疾病的辅助判识系统及设备
- 心肌肌钙蛋升高类型、心血管疾病的辅助判识系统及设备，属于心肌肌钙蛋判识技术和心血管疾病判识技术领域。为了解决现有的依赖于人工的缺血性/非缺血性心血管疾病的cTn的指标判断存在判识的效率慢的问题，以及可能增加误诊或延误治疗...
- 陈文佳孙琳傅羽刘越蒋弼瀛黄佳宇
- 基于WGCNA识别IgG介导的西红柿不耐受枢纽蛋白被引量：1
- 2021年
- 目的基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别IgG介导的西红柿不耐受相关蛋白质共表达模块及枢纽蛋白,为其发生机制研究提供依据。方法收集IgG介导的西红柿不耐受患者及健康对照血清样本,使用DIA全扫描蛋白质组学定性定量技术获得蛋白质表达数据;利用WGCNA方法构建共表达网络,识别与IgG介导的西红柿不耐受相关的模块,并进行模块GO功能注释及KEGG通路富集分析;利用Cytoscape获得IgG介导的西红柿不耐受相关模块的枢纽蛋白。结果获得IgG介导的西红柿不耐受相关的蛋白质模块两个,分别为blue模块和turquoise模块。blue模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为-0.90;GO富集分析发现,该模块中蛋白主要参与脂蛋白重构、脂质代谢等相关生物过程以及蛋白质级联激活、补体激活等免疫调节过程;KEGG分析富集到5条通路,包括胆固醇代谢通路、PPAR信号通路、补体和凝血级联通路、类维生素A代谢和运输通路、维生素和辅酶因子代谢通路。turquoise模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为0.72;GO富集分析发现,该模块主要与蛋白质级联激活、补体激活经典途径、体液免疫应答、受体介导的内吞,血小板脱颗粒、抗氧化活性等生物过程有关;KEGG分析富集到2条通路,补体和凝血级联通路、吞噬体通路。筛选出IgG介导的西红柿不耐受相关模块中的枢纽蛋白为APOA1、APOA4、APOC3、APOA2、APOC1、C3、HRG、FGB、HP、TF。结论WGCNA方法进行IgG介导的西红柿不耐受蛋白质表达数据分析发现:脂质、胆固醇代谢等过程的改变可能是其发生的重要环节;获得的载脂蛋白类蛋白质及其他枢纽蛋白是其潜在关键调控蛋白;本研究从系统生物学的角度,为IgG介导的西红柿不耐受发生机制探索提供了依据和研究方向。
- 张薇孙琳王玉鹏刘美娜
- 预防呼吸机相关性肺炎的护理措施
- 目的：探论机械通气病人如何降低呼吸机相关性肺炎的发生率，预防呼吸机相关性肺炎的发生。方法：对96例机械通气病人通过器械的消毒灭菌以及气管插管和呼吸机管道等的管理，预防呼吸机相关性肺炎的发生。结果：96例机械通气病人呼吸机...
- 王慧毕迎隋冰冰郑希岚孙琳
- 关键词：机械通气呼吸机吸入性肺炎护理措施
- 文献传递
