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霍阿基亚型羊驼显性白毛调控基因外显子2的克隆与序列分析: 2013年; 羊驼作为一种高品质毛皮经济动物,对其毛色的研究可以为提高羊驼经济价值提供理论依据。本试验应用RT-PCR技术克隆羊驼显性白位点基因(KIT)第2外显子(exon2),并与其他动物相应区域进行同源性比较,结果发现其序列与牛和山羊的同源性较高,可达到96%,其编码的氨基酸更高,达98%;而与人和家鼠的同源性较低,只有78%和57%。该研究结果为加快霍阿基亚型羊驼育种进展提供了理论依据。; 高荣琨李建平曲海娥江倩陈伟王莹张巧灵; 关键词：毛色

不同脂肪源饲粮育成猪肝脏转录组差异分析被引量：4: 2015年; 本试验旨在肥育猪饲粮中分别添加红花籽油和椰子油,采集育成猪肝脏组织,进行高通量转录组测序,找出2种处理间的差异表达基因。利用Illumina HiSeqTM 2500高通量RNA-seq测序技术对2种处理育成猪肝脏进行转录组测序,使用TopHat2软件将测序得到的Reads序列与猪参考基因组(Sscrofa 10.2)序列比对,找出差异表达基因,并在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果显示:红花籽油组和椰子油组肝脏差异表达基因共有938个,与椰子油组相比,红花籽油组表达上调基因有479个,下调基因有459个;GO功能分类注释到细胞组成、生物学过程和分子功能数据库中差异表达基因数分别有773、768和729个;注释到KEGG通路中差异表达基因数346个,显著富集通路为酮体生成与降解通路和类萜骨架生物合成通路(P<0.05)。; 李建平秦贵信赵志辉张巧灵王大力孙博兴姜海龙; 关键词：转录组代谢通路育成猪

细毛羊黑素皮质激素受体1(MC1R)基因与毛色表型的研究被引量：2: 2012年; 为了研究黑素皮质激素受体1(MC1R)基因与黑色素生成的关系及该基因突变导致毛色发生改变的机理,研究采用RT-PCR和PCR等技术克隆得到了白色东北细毛羊MC1R基因长1 093 bp的cDNA片段,编码364个氨基酸,其中包括70个氨基酸信号肽和294个氨基酸的成熟肽,具有7个跨膜结构域。结果表明:细毛羊cDNA与绵羊、牛、马、人、小鼠、犬等同源性均大于91%,氨基酸序列与其他动物的同源性高于89%;除绵羊外与其他动物相比有5处发生突变,且这5处突变均位于MC1R蛋白跨膜结构区;而细毛羊和绵羊之间只有1处发生突变,由K→M,同源性达98.97%。说明细毛羊与绵羊的亲缘关系最近。; 陈伟曲海娥李建平黄清华张佳莹张巧灵刘波; 关键词：MC1R基因细毛羊克隆毛色

流式细胞分离法在哺乳动物精子分离中的应用及前景被引量：9: 2016年; 动物性别控制技术是指通过人为干预使成年雌性动物产出人们期望的性别后代的一种生物技术,该技术在畜牧业生产中具有重大意义,已广泛应用于牛、鹿等大型动物的繁殖中。哺乳动物子代性别主要由父代的X/Y染色体决定,X/Y精子分离是控制动物性别最直接有效的一种方法。近年来,关于哺乳动物(如牛、羊等)精子分离的研究有着较大的进展,目前应用最多且最准确的方法就是流式细胞法。笔者就流式细胞法分离哺乳动物精子及其应用前景进行简单综述。; 曲蕾李建平苏权张巧灵; 关键词：精子分离流式细胞法性别调控

绒山羊黑素皮质素受体4(MC4R)基因的克隆与序列分析被引量：1: 2012年; 绒山羊是绒肉兼用型动物,国内外对绒山羊绒用性能研究广泛,但对肉用性能研究相对较少。黑素皮质素受体4(melanocortin 4receptor,MC4R)主要分布在脑组织和肾上腺髓质及皮肤中,该基因突变会引起动物的体质量、能量稳态及采食量的改变。本研究采用PCR及RT-PCR等技术克隆得到了绒山羊MC4R基因的DNA及cD-NA片段,对比发现MC4R无内含子,长924bp,编码304个氨基酸,具有7个跨膜结构域。同源性比较显示:与绵羊、牛、马、猪、人、小鼠、兔、犬等同源性均高于85%,与绵羊同源性最高,达98%;与系统进化树分析结果一致。与其他哺乳动物相比,9处突变频率较高,分别位于93、152、160、162、165、182、213、221、230,且这些突变大多位于MC4R蛋白跨膜结构域及拓扑结构域,该研究对改良哺乳动物繁育性状提供了依据,对提高绒山羊肉用市场价值的研究发挥重要作用。但该突变是否与绒山羊特殊的毛肉用兼用性能有关,还有待进一步研究。; 曲海娥陈伟李建平王莹黄清华张巧灵; 关键词：MC4R基因绒山羊 RT-PCR PCR

基于高通量转录组测序的红花籽油对肥育猪肝脏差异表达基因的影响被引量：3: 2015年; 18头肥育猪按饲粮均分为2组,添加红花籽油组和不添加油脂组(对照组)。试验期60d结束,全部屠宰,分别采集肝脏组织样品,进行高通量转录组测序,找出2处理组间的差异表达基因和差异代谢通路。利用Illumina HiSeqTM2500高通量RNA-seq测序技术对2组肥育猪肝脏RNA测序,使用TopHat2软件将测序得到的reads序列与猪(Sscrofa10.2)参考基因组序列比对,找出差异表达基因,在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果显示,红花籽油组和对照组肝脏中差异表达基因共有1 114个,与对照组相比,红花籽油组表达上调的基因有579个,下调的基因有535个。GO功能分类注释到细胞组成、生物学过程和分子功能数据库中的差异表达基因分别有902,903,857个。注释到KEGG通路中差异表达基因414个,显著富集通路4个(P<0.05)。; 李建平秦贵信任艳蕾张巧灵王大力孙博兴赵志辉姜海龙; 关键词：转录组差异表达基因代谢通路肥育猪

黑素皮质素受体1(MC1R)基因与VC-獭兔毛色关系的研究被引量：7: 2013年; 为研究黑素皮质素受体(Melanocortin1receptor,MC1R)基因对獭兔毛色的影响,本试验采用RT-PCR技术克隆了MC1R基因的cDNA片段,发现MC1R基因长951bp,编码317个氨基酸的前体蛋白,蛋白质PI为9.26,分子量36.28ku,具有7个跨膜结构域,与其他动物MC1R蛋白性质相符。其氨基酸序列经同源性比对结果显示:其与牦牛,马、绵羊、骆驼、牛等哺乳动物的同源性均高于93%,有14个突变频率较高的位点,其中第42、82、176、18、185位点为VC-獭兔特异性突变位点,表明该序列在哺乳动物中较为保守。但这些突变位点均发生极性、亲水疏水性等变化,这些突变可为进一步探测不同群种间的MC1R基因及该基因与獭兔毛色的关系提供理论依据。; 高荣琨陈伟曲海娥李建平张巧灵; 关键词：MC1R RT-PCR 毛色

miR-let7a及其靶基因IGF-1R在绒山羊毛囊发育周期中的表达被引量：7: 2014年; 从miRNA这类新的调控水平出发,在Solexa高通量测序的基础上,以毛囊发育不同阶段的绒山羊皮肤组织为研究对象,针对绒山羊不同发育阶段皮肤组织差异表达的miR-let7a进行分析,同时利用生物信息学软件预测和筛选与毛囊发育相关靶基因IGF-1R,并通过实时荧光定量PCR技术检测miR-let7a、IGF-1R在绒山羊毛囊不同发育时期中的表达规律。结果显示,miR-let7a与其靶基因IGF-1R在绒山羊毛囊不同发育阶段均有表达,但存在表达差异;miR-let7a在绒山羊生长期中的表达较退行期的弱,而其靶基因IGF-1R在绒山羊生长期中的表达较退行期的强,其表达量正好相反,从而进一步证实了IGF-1R为miR-let7a的靶基因,同时也为后期人工调控绒山羊的毛囊发育及提高绒山羊毛发产量提供新的思路和研究平台。; 江倩李建平曲海娥姜怀志张巧灵; 关键词：IGF-1R

椰子油对育成猪肝脏转录组高通量测序的影响被引量：1: 2016年; 试验设计了椰子油组和对照组2个处理。采集育成猪肝脏组织,进行转录组高通量测序,找出2种处理间的差异表达基因及差异代谢通路。利用Illumina Hi SeqTM2 500高通量RNA-seq测序技术测序,使用Top Hat2软件将测序得到的reads序列与猪参考基因组(Sscrofa10.2)序列比对,找出差异表达基因,并在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析。结果表明:椰子油组和对照组肝脏中差异表达基因共有487个,与对照组相比,椰子油组表达上调的基因有222个,下调的基因有265个。在差异表达上/下调前15位基因中,有多个基因是参考基因组中没有的新基因和功能未知基因。GO功能分类注释到细胞组成、分子功能和生物学过程数据库中的差异表达基因数分别有398、368个和398个;注释到KEGG通路中差异表达基因数188个。; 李建平秦贵信张巧灵赵志辉王大力孙博兴姜海龙; 关键词：椰子油差异表达基因育成猪

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