陈玉星
- 作品数：2 被引量：48H指数：1
- 供职机构：华中农业大学更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 蜡梅两种分子标记的开发及F/_1代杂交群体分离方式的评价
- 蜡梅/(Chimonanthus praecox/)是蜡梅科蜡梅属植物,原产于中国的一种观花灌木,栽培历史悠久,历来受到人们的喜爱。蜡梅花期在冬末春初,异花传粉,主要的繁殖方式是种子繁殖,为二倍体植物/(2n=22/),...
- 陈玉星
- 关键词：蜡梅SSRSNP聚类分析
- 文献传递
- 蜡梅转录组EST-SSR标记开发与引物筛选被引量：48
- 2013年
- 从蜡梅转录组数据库组装的83 257个Unigene中分析得到11 868个1~6核苷酸重复的EST-SSR候选位点。在所有序列中,10 284个序列存在EST-SSR位点,SSR的发生频率为12.35%,转录组序列中平均每5 kb长度就有1个SSR位点分布,1 370个Unigene含有2个以上的SSR位点,634个位点以复合的重复形式出现。其中2核苷酸重复和3核苷酸数量最多,分别占总数的44.81%和26.20%。重复基元类型共206种,其中最多的类型为2核苷酸重复AGCT,占总数的39.85%,其次为3核苷酸重复AAGCTT,占总数的11.54%。针对所有EST-SSR位点共过滤出7 060对符合要求的引物,并随机挑选了100对引物,结合已发表的蜡梅SSR文献中的20对引物对2个蜡梅品系进行了检验,其中17对来自蜡梅转录组的EST-SSR成功扩增出条带。由此检验了通过蜡梅转录组数据库EST信息开发SSR标记的可行性。
- 李响杨楠赵凯歌陈玉星唐锐君陈龙清
- 关键词：蜡梅EST-SSR分子标记转录组测序
