张红卫 作品数:7 被引量:23 H指数:3 供职机构: 中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点开放实验室 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家重点实验室开放基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
棉花PEPC基因种子特异性ihpRNA表达载体的构建及鉴定 被引量:3 2010年 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)是控制植物体中蛋白质和脂肪酸含量比例的关键酶。本研究从棉花中克隆得到PEPC基因,长度为433bp,并将该基因的正反义片段分别和种子特异性启动子napin启动子(1123bp)、α球蛋白B基因启动子(1149bp)连接,插入到植物表达载体pCADS1341中。经酶切和PCR鉴定,成功的构建了PEPC基因的种子特异性ihpRNA表达载体pCADSNPSPA和pCADSBPSPA,为后期高含油量棉花材料的选育打下了基础。 彭苗苗 于霁雯 翟红红 黄双领 李兴丽 张红卫 喻树迅关键词:PEPC 利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因 被引量:6 2013年 miRNA(microRNA)是一类21~24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA),它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程。试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs(Backcrossinbred lines)的0 DPA(Days post anthesis)、3 DPA的胚珠和10 DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa测序。以已公布的棉花D5基因组序列和棉属其他序列为参考,经分析共发现561个miRNAs,其中包括254个已知的miRNAs(属于40个miRNA家族),75个候选的miRNAs和232个新的miRNAs,研究结果极大地丰富了棉属miRNAs。通过miRNA靶基因预测分析发现多数miRNAs负调控其对应的靶基因,少数正调控。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)注释结果表明miRNA的靶基因在植物激素代谢途径中显著富集。 南文智 吴嫚 于霁雯 范术丽 黄双领 李兴丽 张红卫 张金发 喻树迅关键词:高通量测序 根据基因芯片筛选棉花产量性状相关的基因 对17个BIL株系产量性状田间调查的数据进行显著性分析,将其分成具有显著差异的高产和低产两个组,然后将两组材料所对应的芯片信息进行组间比对。根据比对结果,在ratio>2和ratio<0.5水平上筛选差异表达基因。通过R... 张利媛 于霁雯 张金发 李兴丽 范术丽 宋美珍 张红卫 喻树迅关键词:棉花 基因芯片 基因 文献传递 棉花纤维发育相关基因表达谱的比较分析 被引量:6 2010年 本研究通过3年4环境的田间试验,在BIL(backcross inbred lines)群体中选取断裂比强度最大的材料NMGA-062(32.5cN/tex)和断裂比强度最小的材料NMGA-144(26.67cN/tex),利用Affymetrix棉花基因芯片,比较分析NMGA-062和NMGA-144纤维发育10d时的基因表达谱。在24029条转录本中,两个基因型中差异表达的转录本6504条,占筛选转录本总数的27.07%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3461条,占筛选转录本总数的14.41%,对其进行功能分类。对8个差异表达明显的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at,ACO1,ARF1,SAHH,TUA6,TUA7,β-tub1,β-tub10)进行实时荧光定量PCR的检测,发现表达模式均与芯片结果一致,说明芯片数据具有生物学意义上的可重复性,结果是可信的。本研究为以后克隆及功能验证纤维发育相关基因提供了重要参考。 李龙云 于霁雯 翟红红 黄双领 李兴丽 张红卫 张金发 喻树迅关键词:棉花 基因芯片 差异表达基因 实时荧光定量PCR 陆海连锁图谱构建及其重要农艺性状定位 以陆地棉中棉所36为母本,海岛棉海7124为父本构建了 F和 F群体。利用186个 F和 SSR、TRAP、SRAP 和 AFLP 四种分子标记构建了四倍体栽培棉种间遗传连锁图谱,对 F的产量相关性状以及株高、果枝数、果... 于霁雯 陆才瑞 喻树迅 翟红红 李兴丽 张红卫文献传递 陆海杂交回交近交系产量性状的QTL分析研究 以陆地棉SG747与海岛棉Giza75为杂交亲本,并以陆地棉SG747为轮回亲本,构建BCF回交近交系(backcross inbred lines,BIL)群体,选用2041对SSR引物进行亲本间多态性的检测,共筛选出... 于霁雯 张科 喻树迅 范术丽 宋美珍 李兴丽 翟红红 黄双领 张红卫 张金发关键词:QTL 文献传递 利用基因芯片技术筛选棉纤维伸长相关基因 被引量:13 2011年 从回交近交系(backcross inbred lines,BIL)群体中选取纤维长度差异较大的两个系NMGA-062(33.03 mm)和NMGA-140(25.87 mm),利用Affymetrix棉花基因芯片,分析其开花后10 d(DPA,days post anthesis)棉纤维伸长相关基因表达谱。在24 029条转录本中,两材料间差异表达的转录本有7 282条,占总数的30.31%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3 993条,占筛选转录本总数的16.62%,功能分类表明这些转录本主要包括功能预测基因(15.57%),翻译、核糖体结构相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换相关基因(9.29%)3大类。为了验证芯片数据的可信性,8个差异表达显著的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at,ACO1,ARF1,SAHH,TUA6,TUA7,β-tub1,β-tub10)被用于实时荧光定量PCR。两种检测手段表现出一致性。随后,利用实时荧光定量PCR对3个与棉纤维相关基因(ARF1,β-tub1,β-tub10)在纤维发育不同时期(5、10、15、20和25 DPA)的表达模式进行了研究,结果表明,3个基因在纤维伸长发育时期(10和15 DPA)大量表达,推测这3个基因可能与棉纤维伸长有重要关系。 李龙云 于霁雯 翟红红 黄双领 李兴丽 张红卫 张金发 喻树迅关键词:基因芯片 差异表达基因 实时荧光定量PCR