朱云芬
- 作品数:110 被引量:184H指数:8
- 供职机构:中国农业科学院家禽研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 鸡类KISS-1基因克隆及EST序列表达验证分析被引量:2
- 2014年
- 性成熟启动是一个复杂的生理过程,受"下丘脑-垂体-性腺"轴控制。决定性成熟启动的关键性事件是下丘脑促性腺激素释放激素(GnRH)脉冲式释放增加,KISS-1基因编码产物Kisspeptin通过其受体GPR54能够直接刺激GnRH释放,进而启动性成熟进程,KISS-1/GPR54系统被认为是性成熟启动的关键看门基因。禽类的KISS-1基因在GenBank中尚未被清晰注释。本文以文昌鸡为素材,采用比较基因组学方法分析了不同物种KISS-1及其上、下游基因在染色体上的分布,确定了鸡chr26:1522493-1532710区域为候选片段,通过PCR扩增和克隆测序获得了该候选片段完整序列(命名为类KISS-1序列);同时,采用BLAST程序搜索出9个同源性在50%~85%的EST序列,通过拼接得到3个延伸EST序列。表达验证分析表明,3个延伸EST序列在文昌鸡下丘脑组织cDNA文库中均有表达。
- 韩威苏一军朱云芬宋迟李国辉屠云洁张会永殷建梅
- 关键词:KISS-1基因EST序列
- 双抗夹心ELISA检测小鹅瘟病毒的研究被引量:4
- 2008年
- 采用双抗夹心ELISA方法快速检测样品中的小鹅瘟病毒。结果表明,该方法特异性较好,灵敏度可达0.7412μg/mL。该方法可以用于鹅细小病毒(GPV)的临床诊断及样品中有效抗原组分的检测,结果准确、快速、重复性好,且EL1SA效价与AGP效价具有相关性。
- 龚建森刘帧亚黄永良单艳菊张小燕施祖灏朱云芬葛庆联陆俊贤刘学贤
- 关键词:小鹅瘟ELISA
- Mx基因抗性位点在12个地方鸡种中的分布及遗传结构分析被引量:8
- 2009年
- 通过PCR-RFLP技术检测Mx基因S631N位点的抗性等位基因A和敏感性等位基因G在我国地方鸡种中的分布差异。结果表明:PCR-RFLP能准确检测出抗性等位基因A与敏感性等位基因G在12个地方鸡种内的突变,抗性等位基因A在所有群体内的基因频率平均为0.304,敏感性等位基因G的频率平均为0.696;12个地方鸡种群体Mx基因S631N位点的观察杂合度平均为0.657 2,Shannon信息指数平均为0.524 0。在该位点上,12个地方鸡种除仙居鸡显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)外,其余11个群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);经Ewens-Watterson中立性检验,该位点在各群体内(除白耳鸡群体外)都属于中立性选择。基于该位点等位基因频率构建的UPGMA聚类图将12个地方鸡种分为3大类,聚类结果反映了12个地方鸡种在Mx基因抗性方面存在的差异和优势。
- 李慧芳陈宽维韩威朱云芬张学余王强
- 关键词:鸡种MX基因聚类分析
- 遗传距离聚类法和模型聚类法在地方鸡种群体遗传结构分析中的比较被引量:2
- 2008年
- 利用16个微卫星标记,计算品种间DA遗传距离和基因流(Nm),并基于DA遗传距离运用NJ算法和基于Structure程序构建2类聚类图,比较分析10个地方鸡品种群体间的遗传结构和亲缘关系。结果表明:基于DA遗传距离运用NJ算法构建的聚类图将10个地方鸡品种总体上分为2大类:轻体型的鸡种(包括茶花鸡、藏鸡、仙居鸡、固始鸡和白耳鸡)和重体型的鸡种(包括狼山鸡、大骨鸡、北京油鸡、鹿苑鸡和萧山鸡);在轻体型的类别中,茶花鸡和藏鸡、仙居鸡和固始鸡聚为一类;在重体型的类别中,鹿苑鸡和萧山鸡聚为一类,狼山鸡、大骨鸡和北京油鸡则表现为独立分支,聚类结果与品种间基因流动相一致。Structure程序在预先未标识个体品种来源的条件下,准确推断出10个地方鸡种群体所属类别,构建的聚类图与遗传距离聚类结果基本一致。Structure程序还根据个体基因组分数,指出了10个地方鸡种群体中迁移个体和具有复杂遗传基础个体的分布,这是遗传距离聚类法所不能揭示的。
- 李慧芳陈宽维韩威张学余高玉时陈国宏朱云芬王强
- 关键词:微卫星地方鸡品种
- 基于RAD-seq简化基因组测序的河南斗鸡遗传进化研究被引量:6
- 2020年
- 研究旨在基因组水平上揭示河南斗鸡的遗传进化机制。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定河南斗鸡与其他18个地方鸡种、2个引入肉鸡品种的SNP标记,计算遗传统计量,分析河南斗鸡的遗传多样性和遗传结构,鉴定受选择基因。结果表明,在河南斗鸡中鉴定出SNP标记259,412个。与其他18个地方鸡种相比,河南斗鸡的观察杂合度Ho(0.1560)和核苷酸多样度Pi(0.1752)均为最低,近交系数Fis为0.1099,遗传多样性相对匮乏;河南斗鸡的平均遗传分化系数Fst最高(0.2187),平均基因流Nm最低(0.9017),在以引入品种为外群的系统发育树中形成一个独立的分支。通过Fst和θπ检验,在河南斗鸡中鉴定出24个受选择区域、129个受选择基因。GO和KEGG分析表明这些受选择基因主要富集在能量代谢、神经系统发育、运动行为、微管细胞骨架等生物学通路。
- 殷建玫朱云芬薛倩李国辉张会永苏一军韩威
- 关键词:遗传进化
- 禽蛋中胆固醇的酶催化分光光度测定法研究被引量:12
- 2009年
- 本实验建立一种禽蛋中胆固醇含量快速测定方法——酶催化分光光度法。禽蛋匀浆液由直接皂化法处理,经酶工作液催化后,用分光光度法于波长500nm处测定其含量。方法回收率均在90%以上,变异系数均低于4%,线性范围20~600mg/ml,具有良好的准确度与精密度,适合禽蛋中胆固醇含量的快速测定。
- 葛庆联葛庆丰刘迪吕晓娟朱云芬刘学贤陈宽维
- 关键词:胆固醇禽蛋
- 狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析
- 2021年
- 为了获得狼山鸡性腺轴组织基因组DNA甲基化水平和模式等表观遗传信息,试验采用全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术检测狼山鸡下丘脑和卵巢组织基因组DNA甲基化状态,分析两组织DNA甲基化水平及特异甲基化模式。结果表明,狼山鸡下丘脑和卵巢基因组整体甲基化水平分别为4.35%和3.48%,差异显著(P<0.05);下丘脑和卵巢中分别检测到6150000和10320000个甲基化胞嘧啶(mC)位点,其中mCG类型位点分别占69.99%和87.88%,下丘脑中非mCG位点占比约为卵巢中的2.5倍;与各染色体不同,两组织线粒体基因组中mCHH位点占比最高,其次是mCHG位点;卵巢基因组启动子区DNA甲基化水平极显著低于内含子和外显子区(P<0.01),极显著高于基因间区(P<0.01);下丘脑基因组启动子区DNA甲基化水平与内含子和外显子区相比差异不显著(P>0.05),却显著高于基因间区(P<0.05);下丘脑基因组各功能元件DNA甲基化水平均显著或极显著高于卵巢基因组(P<0.05;P<0.01)。综上,狼山鸡下丘脑和卵巢组织具有不同的DNA甲基化模式和特征,下丘脑中较高的非mCG位点比例可能在中枢神经系统发育中发挥重要作用,本研究结果为进一步分析鸡卵巢和下丘脑基因组DNA甲基化对其繁殖性能调控机制提供参考依据。
- 薛倩李国辉张会永殷建玫周成浩朱云芬邢伟杰苏一军邹剑敏韩威
- 关键词:狼山鸡DNA甲基化卵巢下丘脑
- Mx基因S631N多态位点与白耳鸡免疫性状的关联分析
- 本试验通过PCR-RFLP方法检测Mx基因S631N多态位点的等位基因A和G在白耳鸡群体中的分布,通过选配组建三种不同基因型群体(AA,AG,GG),免疫后分别于35、42、49、70、100日龄采用血凝和血凝抑制方法测...
- 韩威李慧芳朱云芬束婧婷张学余陈宽维
- 关键词:MX基因免疫性状
- 文献传递
- Ⅱ型促性腺激素释放激素受体基因组织表达与鸭繁殖性状杂种优势关系分析
- 2014年
- 试验旨在克隆鸭Ⅱ型促性腺激素释放激素受体(gonadotropin releasing hormone receptor-Ⅱ,GnRHR-Ⅱ)基因序列,研究其在鸭生殖轴组织中表达差异与繁殖性状的杂种优势关系。采用RT-PCR方法从鸭生殖轴组织中克隆出GnRHR-Ⅱ基因片段序列,利用Real-time PCR技术分析GnRHR-Ⅱ基因在不同产蛋期高邮鸭、金定鸭及其正反交组合生殖轴组织中的表达,并分析表达差异与繁殖性状杂种优势的关系。序列分析结果表明,克隆序列长度约500bp,属Ⅱ型GnRHR基因序列,与家鸡cGnRHR-Ⅱ序列的同源性达96%。从产蛋早期至高峰期,高邮鸭、金定鸭及其正反交组合垂体中GnRHR-Ⅱ基因的表达量均呈上调趋势,且金定鸭×高邮鸭杂交组合的表达量最高(P<0.01);下丘脑中GnRHR-Ⅱ基因表达量在高邮鸭、金定鸭中呈上调趋势,而在2个正反交组合中呈下调趋势。产蛋早期金定鸭和2个正反交组合卵巢中GnRHR-Ⅱ基因表达量极显著高于高邮鸭(P<0.01),至产蛋高峰期表达量明显下调。杂种优势率分析结果表明,2个正反交组合在42周龄产蛋数和42周龄种蛋受精率性状中都表现出正向杂种优势,在开产日龄和42周龄受精蛋孵化率性状中都表现出负向杂种优势。推测产蛋期前鸭卵巢中GnRHR-Ⅱ基因的暂时性高表达与开产日龄和42周龄产蛋数性状杂种优势相关,垂体组织中GnRHR-Ⅱ基因的持续高表达可能对产蛋高峰期的形成和维持具有重要作用。
- 韩威李慧芳朱云芬束婧婷徐文娟宋迟
- 关键词:杂种优势
- ADSL、GARS-AIRS-GART基因多态位点和聚合基因型对白耳鸡胸肌肌苷酸(IMP)含量的效应分析
- <正>引言肌苷酸(IMP)是影响肌肉鲜味的重要物质,已成为衡量肉质优良的重要指标(陈继兰等,2005)。基因聚合(gene pyramiding)就是将分散在不同品种或同一品种中的优良性状基因通过杂交、回交、复合杂交等手
- 张学余韩威李慧芳李国辉束婧婷朱云芬陈宽维
- 关键词:ADSL基因聚合
- 文献传递