毛黎明
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 供职机构：武汉理工大学理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学更多>>
- 基于自回避搜索遗传算法的蛋白质折叠研究被引量：1
- 2005年
- 利用生物信息学方法,对蛋白质折叠过程进行研究,建立蛋白质折叠自回避搜索的遗传算法模型,通过计算机模拟,对较短序列进行检测,以探究蛋白质折叠的过程。实证研究表明,此算法产生了效果较好的蛋白质折叠构象。但对于长序列,自回避路径折叠搜索计算时间将呈指数增长。为了更真实地模拟蛋白质折叠过程,进一步探讨了并行遗传算法模型,该模型充分体现序列折叠时的并行性与自组织性,使它适用于较长序列的折叠,折叠过程不会因为序列长度的增加而快速增大模拟的复杂度,且符合生命的演化规律。
- 王仲君王能超毛黎明
- 关键词：蛋白质折叠遗传算法
- 分布式并行处理与复杂网络在蛋白质折叠中的应用
- 本文在蛋白质折叠的三个方面做了一些初步的研究.第一是要找到表示蛋白质三维组态的模型.第二是根据已建立的模型设计出模拟蛋白质折叠过程与预测蛋白质三维空间结构的算法.第三是如何提高这个算法的效率.本文所采用的蛋白质三维组态模...
- 毛黎明
- 关键词：蛋白质折叠HP并行遗传算法复杂网络
- 文献传递
- DNA序列分析的高效算法研究及比较
- 2005年
- 对海量数据的处理,最有效的方法是并行计算.因此,对DNA序列比对进行并行化,以及对BLAST算法进行并行化改进,以提高对大数据量处理的能力.尽管在CLUSTER上的计算效率较超级计算机上的效率低,但CLUSTER较超级计算机费用低,有较大的适用性.而高性能计算机是处理海量数据的强有力的工具,生命科学中计算问题必须进行超级计算已是不争的事实,现代生命科学对超级计算已显示出强烈依赖和迫切需求.文中对BLAST算法进行改进,提出一种局部并行化的DNA序列比对算法,为了检验算法的科学性和适用性,将此算法与超级计算机的高效并行算法——改进的FFT算法相比较及分析.
- 王仲君曹兴芹毛黎明
- 关键词：并行计算FFT算法
