覃千山
- 作品数：5 被引量：15H指数：3
- 供职机构：中国农业科学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划四川省国际科技合作与交流计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 基于宏基因组的未培养互营烃降解菌的生物信息学研究
- 针对地下油藏独特的缺氧环境,通过厌氧微生物作用,将油藏残余油或重质原油降解并转化为甲烷("油变气")进行气态开采,是一项极具发展潜力的微生物采油新技术[1,2]。热力学分析表明石油烃降解产甲烷过程,需...
- 覃千山张辉胡国全承磊
- 关键词：宏基因组SP
- 不同pH缓冲液对由乙酸产甲烷菌群结构的影响被引量：8
- 2014年
- 【目的】研究不同p H缓冲液对乙酸产甲烷过程及对细菌和古菌群落结构的影响。【方法】分别添加磷酸盐(PB)、4-羟乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)、哌嗪-1,4-二乙磺酸(PIPES)和Na HCO3/CO2缓冲液到乙酸产甲烷菌系中,定期监测甲烷产生趋势,到稳定期后收集菌体,进行16S rRNA基因的末端限制性片段多态性分析(T-RFLP)。【结果】发现PB组的乙酸产甲烷菌系延滞期约为40d,显著高于其他组的20-24 d(P<0.05);Na HCO3/CO2组乙酸转化为甲烷的比例为(88.3±0.5)%,显著高于其他组的77%-81%(P<0.05);不同缓冲液组的最大甲烷比生长速率为0.46-0.57 d-1(P>0.05);Na HCO3/CO2组的细菌群落变化最明显,主要是未培养细菌(unclassified bacteria)、螺旋菌科细菌(Spirochaetaceae)和未培养WWE1类群的丰度较其他组分别增加到(15.5±9.4)%、(7.3±4.6)%和(17.6±6.3)%,而互养菌科(Synergistaceae)的细菌丰度降低到(8.9±8.1)%。AC+PB组中的古菌类群发生了明显变化,以竹节状甲烷鬃毛菌(Methanosaeta harundinacea)相关的产甲烷古菌占主导(97±2%),而在HEPES、PIPES和Na HCO3/CO2组和不加缓冲液组中同时存在两类乙酸营养型产甲烷古菌M.harundinacea和联合鬃毛甲烷菌(Methanosaeta concilii),以及属于甲烷杆菌目(Methanobacteriales)的氢营养型产甲烷古菌。【结论】在乙酸产甲烷菌系中加入PB增加了甲烷产生的延滞期,加入Na HCO3/CO2增加了甲烷产量,但是添加p H缓冲液不会影响到菌系的最大甲烷比生长速率。加入PB和Na HCO3/CO2都会显著改变微生物的菌群结构。这些研究为设计适宜的产甲烷菌系生长条件提供了参考。
- 麻婷婷承磊郑珍珍覃千山代莉蓉张辉
- 关键词：乙酸产甲烷群落结构
- 基于宏基因组的未培养互营烃降解菌‘Candidatus Smithella cisternae’的生物信息学研究
- 通过厌氧微生物作用，将油藏残余油或重质原油降解并转化为甲烷（“油变气”）进行气态开采，是一项极具发展潜力的微生物采油新技术，这个过程需要通过细菌和古菌的互营代谢作用完成。小组通过多年努力，富集获得了正十六烷烃降解产甲烷菌...
- 覃千山
- 关键词：未培养微生物高通量测序宏基因组代谢途径
- 文献传递
- 新疆泥火山微生物群落被引量：3
- 2015年
- 泥火山地质结构特殊,孕育着独特的微生物资源。该研究采用454高通量测序技术,分析了我国新疆独山子泥火山群和乌苏泥火山群的古菌和细菌群落组成。发现独山子和乌苏古菌群落主要由产甲烷古菌Methanosaeta(丰度分别为34.6%和49.4%),Methanolobus(27.8%和7.5%),Methanosarcina(4.9%和0.6%)和Halalkalicoccus(0.8%和11.7%)组成,表明在独山子和乌苏中存在产甲烷代谢途径,并主要通过乙酸和甲基营养类型产甲烷古菌来完成的;独山子和乌苏的细菌群落主要为Proteobacteria(丰度分别为40.1%和37.2%),Chloroflexi(15.7%和7.3%),Firmicutes(13.9%和22.1%),Actinobacteria(4.0%和7.0%)和Bacteroidetes(2.6%和5.2%),但两者在OTU水平差异显著:独山子中最优势的OTU 02(11.6%)属于unclassified Anaerolineaceae,OTU 05(8.0%)代表unclassified Bacteria;乌苏中最优势的OTU 01(11.3%)属于unclassifiedγ-Proteobacteria,OTU 03(7.1%)为Acidaminobacter,这表明两座泥火山都群蕴含着丰富的未培养微生物资源,可以为开发和利用极端环境微生物资源提供参考。
- 覃千山承磊张辉张辉
- 关键词：泥火山群落结构未培养微生物高通量测序
- 石油烃降解产甲烷菌系DNA提取方法比较研究被引量：2
- 2014年
- 基因组DNA提取方法是评价微生物种群多样性的关键因素,文章研究了不同提取方法对石油烃降解产甲烷菌群结构的影响。分别采用如下五种方法提取纯化DNA:方法 I:玻璃珠振荡破壁、Tris平衡酚(pH值8.0)、氯仿、异戊醇提取,Promega试剂盒纯化法;方法 II:玻璃珠振荡破壁,水饱和酚(pH值5.2)、氯仿、异戊醇提取,Promega试剂盒纯化法;方法 III:进口试剂盒1+核酸自动提取仪法,方法 IV:玻璃珠振荡破壁,核酸自动提取仪提取法;方法 V:国产试剂盒提取法。通过末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析细菌和古菌群落结构组成。采用不同方法获得的细菌和古菌的主要菌群结构类似,但是相对丰度存在差异。
- 麻婷婷承磊郑珍珍覃千山张辉
- 关键词：微生物群落
