郭丽娟
- 作品数：10 被引量：31H指数：3
- 供职机构：东北农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：黑龙江省科技攻关计划黑龙江省杰出青年科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 野猪、家猪及野家杂种猪CAPN1基因3′UTR区的SNPs检测及PCR-RFLP分析被引量：1
- 2007年
- μ-钙蛋白酶(μ-calpain,CAPN1)是动物体内肌原纤维蛋白降解的主要酶,为了揭示其基因变异与瘦肉率和嫩度的关系,文章以野猪、家猪及野家杂种猪为研究对象,通过测序和PCR-RFLP方法对CAPN1基因3′UTR进行了SNPs检测和多态性分析。结果表明,共发现7个SNPs,分别是C114T,G220C,C344T,T380C,G501A,T543C,T610C;对G220C/T380C两处突变建立了基于限制性内切酶HinfⅠ/AlwNⅠ的PCR-RFLP检测技术;群体遗传学分析表明,在这两个位点不同基因型在不同品种(品系)猪中的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),野猪和民猪之间的差异都不显著(P>0.05),并且HinfⅠ位点的B等位基因频率具有随着品种瘦肉率的增加而增多的趋势。该结果为寻找高瘦肉率的分子标记提供了基础。
- 杨秀芹关庆芝郭丽娟刘娣
- 野猪、家猪及野家杂种猪CAPN1基因多态性分析
- 通过克隆、测序，在野猪、民猪CAPN1基因中找到分别引起NaⅢ/EcoRⅡ酶切位点改变的两个SNPs，建立了PCR-RFLP检测技术，分析了不同基因型在野猪、民猪、大白、长白，杜洛克、野家杂种猪中的分布，探讨了基因型在种...
- 杨秀芹郭丽娟关庆芝刘娣
- 关键词：基因多态性群体遗传学养猪技术
- 文献传递
- 猪RPS3基因的克隆和表达分析被引量：2
- 2007年
- RPS3在体内具有多种功能,为了进一步揭示其结构与功能的关系,探索其编码区作为系统发育标记的可行性,本研究应用生物信息学、RT-PCR和3-′RACE方法首次克隆了猪RPS3基因(GenBank登录号:DQ660373)并进行了序列分析,同时利用半定量RT-PCR方法分析了RPS3基因的时空表达规律。序列分析表明RPS3开放读码框全长为732 bp,编码243个氨基酸残基的多肽链,含有核糖体蛋白S3标签,构建的系统发育树显示聚类结果与动物学上的分类一致。半定量RT-PCR分析表明RPS3在所检测的10种组织中均有较高水平的表达,心脏中的表达量最高,肺脏中的表达量最低,其它组织间差异不大;在仔猪中表达量高,随着日龄的增加表达量不断下降,在3月龄以后的猪中表达量趋于平稳。以上结果说明RPS3基因CDS适合构建种间的系统发育树,mRNA的表达水平与细胞的生长代谢速度有关。
- 杨秀芹郭丽娟关庆芝刘惠刘娣
- 关键词：克隆半定量RT-PCR
- 野猪、民猪、大白猪μ-钙激活酶基因的变异位点分析被引量：13
- 2007年
- 为了进一步研究CAPN1基因变异与肉嫩度的关系,寻找与猪嫩度性状相关的分子标记,对CAPN1基因组进行了克隆、测序,并利用PCR-SSCP方法对其编码区序列进行了分子扫描,寻找多态位点,分析不同基因型在野猪、民猪、大白猪中的种间分布规律。获得了猪CAPN1基因的15个内含子序列;根据GenBank上提供的CAPN1CDS及克隆的内含子序列设计了5对多态性引物进行PCR-SSCP分析;共找到8个SNPs,其中7个位于外显子上,1个位于内含子上,并且外显子上的突变有3个是错义突变,分别造成了蛋白质多肽链上第54位氨基酸的S/T、第192位氨基酸的G/E、第363位氨基酸的V/I替代;χ2独立性检验表明不同基因型在大白猪与野猪、民猪之间存在着极显著的差异(P<0.01),野猪和民猪之间除了S1引物3种基因型的分布存在显著差异外(0.010.05)。这些多态位点具有成为分子标记的潜在可能。
- 杨秀芹刘惠郭丽娟许尧刘娣
- 关键词：CAPN1基因PCR-SSCP
- 野猪、家猪及其杂种猪ACSL4基因部分内含子的克隆和多态性分析被引量：2
- 2007年
- 克隆猪ACSL4基因的内含子3和5,寻找其SNP位点。通过酚-氯仿法从野猪、家猪及其杂种猪的耳组织中提取基因组DNA。根据GenBank网站的猪ACSL4基因cDNA全序列设计两对引物进行PCR扩增,利用PCR-SSCP对获得的序列进行了多态性分析。对猪基因组进行PCR扩增,对获得的内含子3(232 bp)和内含子5(241 bp)序列进行克隆和测序,结果表明,基因片段分别是包含部分外显子3、4,完整的内含子3序列和部分外显子5、6,完整的内含子5序列,与人的该基因分别有72.87%和78.62%的同源性。多态性分析发现,该基因的两个内含子较为保守,未检测到多态位点。该研究为深入探讨该基因与肉质性状的关系以及丰富猪的种质资料库和分子育种提供了理论依据。
- 郭丽娟杨秀芹王秀奎姜薇刘娣
- 关键词：克隆SSCP
- 猪CAPN1基因部分外显子及3′UTR区的SNPs检测被引量：5
- 2008年
- 以野猪、民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3′UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系。研究发现11个SNPs,其中5个位于外显子,4个位于内含子,2个位于3′UTR区,外显子中的突变有一处是错义突变,导致了蛋白质多肽链第260位氨基酸发生了M/V的替代。群体遗传学分析表明,在所检测的各多态位点上,野猪、民猪、大白猪3个品种间不同基因型的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),而野猪和民猪之间各基因型的分布差异不显著(P>0.05),民猪和大白猪之间各基因型的分布存在着极显著的差异(P<0.01)。结合品种特性分析表明,P4、P6引物和3′UTR区HinfⅠ位点所检测的不同基因型和瘦肉率具有一定的相关性。
- 杨秀芹刘慧郭丽娟关庆芝许尧刘娣
- 关键词：CAPN1基因瘦肉率嫩度PCR-SSCPPCR-RFLP
- 野猪CAPN10基因两个剪接变异体的克隆、序列分析和表达被引量：2
- 2009年
- 为了进一步研究CAPN10在肌肉生长和肉质中的作用,本研究采用RT-PCR和RACE相结合的方法克隆野猪CAPN10 cDNA并进行序列分析,采用相对定量RT-PCR和竞争性RT-PCR方法研究该基因的表达情况。获得了野猪CAPN10的2个剪接变异体,二者前604个氨基酸完全相同,在多肽链相同位置处都存在着钙蛋白酶家族的特征性结构域和催化活性中心;相对定量RT-PCR分析表明,CAPN10普遍表达于所检测的野猪12种组织内,在6、9、12月龄的肌肉组织中大白猪的表达量显著高于同一发育时期的野家杂交猪(P<0.05);竞争性RT-PCR分析表明,2个变异体都表达于所检测的野猪9种组织内。结果表明CAPN10的表达量与肌肉的嫩度可能具有一定的相关性。
- 杨秀芹关庆芝于浩郭丽娟刘慧刘娣
- 关键词：野猪克隆
- 野猪、家猪及野家杂种猪calpain3基因的多态性分析被引量：6
- 2009年
- Calpain3(CAPN3)在肌肉组织中特异表达,其活性显著影响宰后肉的嫩化,研究以野猪、家猪及野家杂种猪为研究对象,对其上的一个点突变进行了基于限制性内切酶H incⅡ的PCR-RFLP分析。结果表明:2个等位基因在野猪、家猪中的分布存在着极显著的差异,在长白、大白、杜洛克这3个欧洲引进猪种中没有检测到B等位基因;民猪共检测了35头,只发现了3个AB杂合体,其余都是AA型;而野猪却以B为优势基因,B等位基因频率明显高于A等位基因,结合品种(品系)特性说明该突变可能与瘦肉率和嫩度有关。
- 关庆芝杨秀芹郭丽娟刘娣
- 关键词：野猪家猪
- 野猪、家猪ACSL4基因的克隆、表达及多态性研究
- 脂肪含量是影响肉质的重要指标，是目前猪育种工作的重点，其合成和分解过程中的限速酶的活性影响着脂肪的沉积。酰基辅酶A合成酶长链4(Acly-CoAsynthetaselongchainfamily4，ACSL4)在脂肪酸代...
- 郭丽娟
- 关键词：野猪家猪基因克隆遗传育种基因多态性
- 文献传递
- 野猪CAPN7基因的克隆、表达和变异分析被引量：2
- 2009年
- 钙蛋白酶是细胞质中主要的蛋白水解酶,在肌肉生长、蛋白转化及嫩化过程中发挥复杂的作用。该研究利用RT-PCR、生物信息学方法克隆野猪(Sus scrofa ussuricus)CAPN7cDNA并进行序列分析,利用相对定量RT-PCR方法研究其组织表达情况和利用PCR-SSCP方法对其进行变异分析。结果表明,野猪CAPN7基因编码区全长2442bp,预期编码813个氨基酸残基,多肽链中存在着calpain家族的催化结构域和催化活性中心;野猪CAPN7不同程度地表达于所检测的12种组织中,在6、9月龄野家杂交猪肌肉组织中的相对表达量高于同一时期的大白猪肌肉组织;所检测到的3种基因型在野猪、民猪和杜洛克中的分布存在着极显著差异。该研究为进一步揭示calpain7的功能提供了分子生物学基础。
- 杨秀芹郭丽娟马建章刘娣
- 关键词：野猪克隆钙蛋白酶
