霍秀爱
- 作品数:4 被引量:18H指数:2
- 供职机构:河北农业大学更多>>
- 发文基金:河北省自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 太空诱变西瓜后代突变体检测及相关片段克隆
- 2013年
- 为进一步研究太空环境对西瓜后代的影响,应用53对AFLP引物对200粒M2代单株进行分析,根据Gene Walking Kit的要求设计引物,利用TAIL-PCR技术对差异片段进行延伸,在GenBank上用BLASTn和BLASTx软件对其进行序列同源性比对。结果表明:引物E50/M60在135号和74号检测到差异片段,长度分别为253bp、81bp和98bp,对此进行序列比对,未检测到同源性大于40%的序列。对253bp进行延伸得到长度为1 379bp的片段,此片段与黄瓜光照诱导下的EST序列有93%的同源性。
- 代亮苏玉环李朋飞霍秀爱杨炳艳段会军
- 关键词:西瓜太空诱变AFLP克隆
- 低温胁迫下西瓜同源二倍体和三倍体甲基化及基因表达的差异分析被引量:7
- 2014年
- 为了揭示西瓜二倍体及三倍体在低温胁迫下的耐冷性分子机制,以西瓜二倍体自交系‘83166’(‘京欣1号’品种的母本)及其同源三倍体为材料,利用MSAP及c DNA-AFLP技术研究低温处理前后基因表达的差异,并对差异带进行克隆、测序和比对。28对MSAP引物扩增得到2 356个位点,其中二倍体经低温处理后总甲基化率下降8.5%,三倍体下降10.4%。将13条差异带与西瓜基因组数据库比对,有7条带确定是西瓜基因组序列。26对c DNA-AFLP引物组合扩增出1 267条带,其中二倍体上调表达占48.2%,下调表达占51.8%;三倍体上调表达占51.3%,下调表达占48.7%。21条差异带在NCBI中找到了同源序列基因,包括假定蛋白(38.1%)、能量与代谢(38.1%)、信号转导(9.5%)、物质运输(9.5%)以及DNA修饰(4.8%),另有9条无同源序列。低温胁迫后,三倍体去甲基化率与上调表达量均大于二倍体,而且三倍体诱导出更多的差异基因参与了能量代谢调控、信号转导、物质运输等过程,说明在抵御低温胁迫中三倍体比二倍体有更强的耐冷性。
- 杨炳艳霍秀爱刘云婷段会军
- 关键词:西瓜MSAPCDNA-AFLP基因表达
- 基于cDNA-AFLP技术分析玉米乙烯诱导基因差异表达被引量:2
- 2014年
- 为了探讨乙烯利调控玉米生长的分子机理,以郑单958为材料,拔节期叶面喷施225 mL/hm2浓度的乙烯利,同体积清水为对照。在不同时间取茎端分生组织样品,采用cDNA-AFLP(RT-PCR)进行基因差异表达分析。结果表明,利用70条引物共扩增1 635条片段,其中上调表达的有600条,占总条带的36.7%;下调表达的有564条,占总条带的34.5%;无差异表达的有471条,占总条带数的28.8%。选择重复扩增稳定的30条差异片断进行回收测序,经过BlastX比对分析这些差异表达基因片段,按功能可分为信号转导相关基因(6.7%)、抗性相关基因(16.7%)、能量与代谢相关基因(20.0%)、转录因子相关基因(10.0%)、未知功能蛋白(13.3%)和未知基因(33.3%)6大类。乙烯利通过调控谷胱甘肽S-转移酶、天冬氨酸蛋白激酶和生长素诱导蛋白等基因的表达来调控玉米的生长。
- 霍秀爱杨炳艳刘云婷段会军
- 关键词:乙烯利玉米CDNA-AFLP
- 基于SRAP的西瓜种质资源遗传多样性评价被引量:9
- 2013年
- 运用SRAP分子标记技术分析了80份西瓜种质资源的遗传多样性,28对不同的引物组合共扩增出308条谱带,其中多态性谱带68条。引物组合的多态性频率最低为9.1%,最高为45.5%,平均22.1%。基于全部材料的SRAP基因型数据评价品种间的遗传关系,80份西瓜种质的遗传相似系数变化范围在0.94~1.00之间,表明供试西瓜种质资源的遗传背景比较狭窄。利用NTSYS软件聚类分析,80份西瓜材料被划分为3个类群,类群间相似度较高。来源地不同的西瓜材料也被划分到一个类群,进一步说明供试材料遗传背景狭窄。西瓜育种要取得突破性进展,必须加强种质资源的引进与创新。
- 李朋飞霍秀爱程永强代亮杨炳艳段会军
- 关键词:西瓜SRAP