孙雨
- 作品数:10 被引量:5H指数:1
- 供职机构:中山大学生命科学学院生物化学系更多>>
- 发文基金:广东省自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- mRNA3'末端非编码区及其多态性在炎症与免疫中的调控作用
- 2012年
- 信使RNA 3'末端非编码区(3'UTR)含有多种顺式反应元件,该顺式元件参与基因表达的转录后调节。其中,存在于3'UTR的A/U富集元件(ARE)具有调控基因表达作用。ARE介导的基因表达的转录后调控广泛存在。人类细胞内ARE-containing基因主要编码一些短暂生物学过程,如免疫、炎症及凋亡等的蛋白质。另外,人类基因中广泛存在多个可选择性多聚腺苷酸化位点,产生不同3'UTR长度或不同蛋白质产物的转录本,而且人体很多3'UTR改变的事件涉及机体免疫及炎性反应。
- 田鹏孙雨邹华
- 关键词:信使RNA免疫炎症
- 嗜酸性鼻息肉组织基因组3'UTR的长度多态性
- 田鹏孙雨李玉新刘翔万谅李杰马赟安龙永贵邹华
- mRNA3’末端文库及其构建、测序方法和用途
- 本发明公开了mRNA3’末端文库及其构建、测序方法和用途。其中,构建mRNA3’末端文库的方法包括:(a)将待测样本的总RNA进行片段化处理;(b)以RNA片段作为模板进行第一反转录合成cDNA第一链;(c)将DNA-R...
- 徐安龙孙雨付永贵李宇新梁嘉慧
- 文献传递
- 全基因组mRNA3′末端基因文库的构建方法
- 本发明涉及一种适用于高通量测序的全基因组mRNA3′末端文库的制备方法,通过模板转换合成cDNA一链及PCR引入突变,获取全基因组mRNA3′非翻译区DNA序列。本发明全基因组mRNA3′末端文库的制备方法制得的文库数据...
- 徐安龙付永贵孙雨李宇新万谅饶兴蔷
- 慢性鼻窦炎伴鼻息肉与HLA-DPB1、DQB1基因相关性研究被引量:5
- 2011年
- 目的:探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者在HLA-DPB1、DQB1两个基因位点的易感因素及保护性因素,初步探讨HLA-DPB1、DQB1两个基因与慢性鼻窦炎伴鼻息肉的相关性,寻找易感基因类型。方法:通过对HLA-DPB1、DQB1两个基因位点进行PCR扩增,用ABI 3700自动测序仪对扩增产物进行测序,从而对46例广东籍慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者和50例广东藉健康对照组HLA-DPB1、DQB1两个基因位点进行分型及比较。结果:DPB1*040101等位基因仅出现在病例组;DPB1*0502-030101和DQB1*0202-020101两种等位基因频率在对照组高于病例组,差异有统计学意义;DQB1*050301在病例组中的频率高于在对照组,但差异无统计学意义。结论:DPB1*040101及DQB1*050301可能为慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病的易感因素。而DPB1*0502-030101和DQB1*0202-020101在慢性鼻窦炎伴鼻息肉的发病中起保护性作用。
- 邹华高伟田鹏付永贵孙雨
- 关键词:慢性鼻窦炎鼻息肉人类白细胞抗原
- 全基因组mRNA 3’末端基因文库的构建方法
- 本发明涉及一种适用于高通量测序的全基因组mRNA3'末端文库的制备方法,通过模板转换合成cDNA一链及PCR引入突变,获取全基因组mRNA3’非翻译区DNA序列。本发明全基因组mRNA3'末端文库的制备方法制得的文库数据...
- 徐安龙付永贵孙雨李宇新万谅饶兴蔷
- 文献传递
- 慢性鼻窦炎伴鼻息肉与HLA-DPB1、DQB1基因相关性研究
- 目的 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者在HLA-DPB1、DQB1两个基因位点的易感因素及保护性因素,初步探讨HLA-DPB1、DQB1两个基因与慢性鼻窦炎伴鼻息肉的相关性,寻找易感基因类型。方法 通过对HLA-DPB1、DQ...
- 高伟邹华田鹏付永贵孙雨
- 高通量测序技术在可选择性多聚腺苷酸化研究中的应用
- 可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)在基因表达调控中起着重要的作用。位于最后一个外显子的APA可以产生具有不同3’UTR长度的mRNA异构体,在细胞中可影响信使RNA(m...
- 万谅孙雨付永贵徐安龙
- 关键词:基因表达调控
- 高通量测序技术在可选择性多聚腺苷酸化研究中的应用
- 2014年
- 可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)在基因表达调控中起着重要的作用。位于最后一个外显子的APA可以产生具有不同3'UTR长度的mRNA异构体,在细胞中可影响信使RNA(messager RNA,mRNA)的稳定性、翻译效率、转运及亚细胞定位等。随着第二代高通量测序技术的发展,研究人员近年来发展了许多高通量测序文库制备方法,对全基因组APA进行测序和分析。综述了当前研究全基因组水平APA的技术,并且总结了APA与一系列关键生物现象的关系,包括免疫应答、神经反应、胚胎发育和肿瘤发生等。随着APA研究的深入,APA越发成为新的基因转录与翻译调控的研究热点。
- 万谅孙雨付永贵徐安龙
- 关键词:基因表达调控
- 肿瘤的3’UTR长度多态性研究
- 通过对乳腺癌、肾癌、肝癌、肺癌、鼻炎癌、肠癌、胃癌、卵巢癌、膀胱癌和宫颈癌等十种常见的实体瘤的肿瘤及癌旁组织进行深度测序,获得了8.9亿条3'末端mRNA序列,平均每个样本2.6千万条。这些序列共比对到21,071个基因...
- 孙雨
- 关键词:肿瘤