宋明
- 作品数：20 被引量：95H指数：8
- 供职机构：中国中医科学院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项中央高校基本科研业务费专项资金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学化学工程更多>>
- 蕨类药材石韦及其混伪品的psbA-trnH序列鉴定被引量：13
- 2014年
- 为考察psbA-trnH序列鉴定蕨类药材的可行性,该研究以蕨类药材石韦及其混伪品作为研究对象,对其106份样品提取基因组DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其叶绿体psbA-trnH序列,并采用Mega6.0软件进行多序列比对,计算种内及种间K2P遗传距离,采用最大似然法(ML)构建系统聚类树。结果表明:石韦药材3个基原植物的psbA-trnH序列种内最大遗传距离均小于其与混伪品的种间最小遗传距离;ML树显示石韦药材可与其混伪品明显分开;psbA-trnH序列可作为蕨类药材的DNA条形码,能准确、稳定鉴定蕨类药材石韦及其混伪品。
- 张雅琴石钺宋明林韵涵马孝熙孙伟向丽刘霞
- 关键词：DNA条形码混伪品蕨类
- 基于ITS2和psbA-trnH序列对细小种子类药材车前子的鉴定比较被引量：22
- 2014年
- 为考察ITS2序列和psbA-trnH序列对车前子药材及其常见混伪品的鉴定能力,该研究对车前子2个基原物种及7种混伪品共71份样本进行了研究。采用MEGA 5.1对获得的ITS2和psbA-trnH进行序列比对,计算种内和种间kimura2-parameter(K2P)遗传距离,并构建系统发育树。结果显示,车前和平车前的ITS2序列长度分别为199,200 bp;两者的ITS2序列种内最大K2P遗传距离均小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;基于ITS2序列构建的NJ树中,车前、平车前及其混伪品都表现出良好单系性,都能相互明显区分。表明ITS2序列能将车前子药材与混伪品进行很好的区分。车前和平车前的psbA-trnH序列长度均为340 bp,两者的psbA-trnH序列种内最大K2P遗传距离小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;基于psbA-trnH序列构建的NJ树结果显示,除大车前外,车前子药材与其余混伪品可以明显区分。因此,ITS2序列作为DNA条形码,车前子及其混伪品具有良好的鉴别能力,对保障车前子用药安全具有重要意义。
- 宋明张雅琴林韵涵凃媛马孝熙孙伟向丽焦文静刘霞
- 关键词：混伪品DNA条形码ITS2
- 远志药材及其混伪品的DNA条形码鉴定被引量：12
- 2014年
- 目的:对中药材远志及其混伪品进行分子鉴定,保障药材质量及用药安全。方法:对46份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其psbA-trnH序列并双向测序,应用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图校对拼接,去除低质量区和引物区,得到psbA-trnH序列,用MEGA 6.0对序列进行比对分析,基于K2P遗传距离构建系统聚类树。结果:通过相似性搜索法能准确鉴别远志及其混伪品,远志两个基原的种内最大K2P距离分别为0.004和0,均小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离(0.010和0.005),基于psbA-trnH序列的系统发育树可将远志药材及其混伪品明显区分开。结论:psbA-trnH序列能有效鉴别远志药材及其混伪品,为中药材的质量控制提供新方法。
- 马孝熙任伟超孙伟凃媛张雅琴宋明于俊林黎斌陈士林
- 关键词：远志DNA条形码
- 中药材半夏及其混伪品的DNA条形码鉴定研究被引量：14
- 2014年
- 目的:采用ITS2序列对中药材半夏及其混伪品进行DNA条形码鉴定研究,为规范中药材半夏的市场流通,保障临床用药安全及疗效提供参考依据。方法:对半夏及其混伪品共59份样品,通过DNA提取及聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列,并采用Mega6.0软件进行多序列比对,计算种内及种间K2P遗传距离,采用邻接(NJ)法构建NJ系统聚类树。采用相似性搜索法、最小距离法、NJ树法考察ITS2序列的鉴定能力。结果:半夏药材的ITS2序列长度为251 bp,应用相似性搜索法表明ITS2序列能够准确鉴定半夏药材及其混伪品;半夏种内最大K2P距离小于半夏与混伪品间的最小K2P距离;NJ树显示半夏药材可与其混伪品明显分开。结论:ITS2序列能准确、稳定鉴定中药材半夏药材及其混伪品。
- 张雅琴宋明孙伟向丽马孝熙樊佳佳王俊张晓存刘霞
- 关键词：半夏DNA条形码混伪品
- 蔓荆子药材及其混伪品DNA条形码鉴定研究被引量：4
- 2014年
- 本研究应用ITS2序列鉴别蔓荆子及其混伪品,收集药材和基原植物样本共46份,通过提取基因组DNA、PCR扩增和双向测序获得ITS2序列,经Codon Code Aligner V4.2拼接注释获得序列,应用MEGA5.0对序列进行分析比对,计算种内和种间遗传距离(Kimura 2-Parameter,K2P),构建系统发育NJ树进行鉴定。结果表明,蔓荆子药材基于ITS2序列的种内最大K2P遗传距离均小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离,NJ树显示蔓荆子药材与其混伪品可明显分开,表现出良好的单系性。因此,应用ITS2序列能够准确地鉴定蔓荆子药材及其混伪品。
- 张晓存徐迪孙伟宋明刘霞
- 关键词：蔓荆子混伪品DNA条形码ITS2
- 基于ITS2序列鉴定苗药金铁锁及其混伪品
- 目的：本研究利用ITS2序列对苗药金铁锁及其混伪品进行鉴定研究,从而确保药材质量,保障临床用药安全.方法：提取金铁锁药材及其混伪品基因组DNA,PCR扩增并双向测序获得ITS2序列.所有序列经过CodonCode Ali...
- 宋明张婉冰张雅琴孙伟向丽马孝熙王俊樊佳佳张晓存刘霞
- 关键词：金铁锁ITS2混伪品
- 基于ITS2序列鉴定苗药金铁锁及其混伪品被引量：4
- 2014年
- 目的:本研究利用ITS2序列对苗药金铁锁及其混伪品进行鉴定研究,从而确保药材质量,保障临床用药安全。方法:提取金铁锁药材及其混伪品基因组DNA,PCR扩增并双向测序获得ITS2序列。所有序列经过CodonCode Aligner V3.7.1拼接后,采用MEGA5.1软件进行序列比对,计算种内和种间Kimura2-Parameter(K2P)遗传距离,并构建系统发育树。采用相似性搜索法、最近距离法、邻接(NJ)树法对ITS2序列鉴定能力进行评估。结果:金铁锁药材的ITS2序列长度为229 bp,其ITS2序列种内最大K2P遗传距离小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;应用相似性搜索法表明ITS2序列能够准确鉴定金铁锁药材及其混伪品;基于ITS2序列构建NJ树,金铁锁及其混伪品均表现出良好单系性,均能明显区分。结论:ITS2序列能够稳定、准确地鉴定金铁锁药材及其混伪品,DNA条形码技术可为金铁锁药材及其混伪品的鉴定提供新的方法。
- 宋明张婉冰张雅琴孙伟向丽石晋丽马孝熙王俊樊佳佳张晓存刘霞
- 关键词：金铁锁ITS2混伪品
- 基于ITS2序列鉴定南北葶苈子药材及其混伪品被引量：12
- 2014年
- 目的:利用ITS2序列对多基原药材葶苈子及其混伪品进行分子鉴定,以保证药材质量及临床疗效。方法:提取46份葶苈子药材及其混伪品的DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列并双向测序,应用CodonCode Aligner v 4.25对测序峰图进行校对拼接,并去除低质量序列及引物区,得到ITS2序列。用MEGA 6.0软件计算物种种内和种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,分析变异位点并构建邻接(NJ)系统聚类树,综合应用相似性搜索法、最近距离法以及NJ系统发育树等进行鉴定分析。结果:葶苈子的基原植物播娘蒿和独行菜的种内最大K2P遗传距离分别为0.021和0.010,均小于其与混伪品之间的种间最小K2P遗传距离;NJ树结果显示播娘蒿和独行菜各自聚为一支,表现出良好的单系性,均可与混伪品明显区分开。结论:以上几种鉴定方法分析结果表明,ITS2序列能准确鉴别南北葶苈子药材与混伪品,为保障临床安全用药提供了新的技术手段。
- 凃媛赵博温放孙伟宋明贺海波胡志刚郭力城张秀桥
- 关键词：葶苈子混伪品
- 基于ITS2序列鉴定桃仁及其近缘种被引量：6
- 2013年
- 目的：对药材桃仁及其近缘种进行ITS2分子鉴定,以保证药材质量及用药安全。方法：利用DNA条形码技术,对桃仁及其近缘种的ITS2核基因片段进行扩增并双向测序,经CodonCodeAligner V4.1拼接后,将所有的ITS2序列用MEGA5.0软件进行相关数据分析,并构建NJ树。结果：桃仁两基原物种ITS2序列长度为212~213 bp,序列变异较小;两基原物种ITS2序列与近缘种的种间平均K2P遗传距离大于其种内平均K2P遗传距离;由NJ树可知,桃仁的两基原物种聚为一枝,并与其他近缘种明显分开。结论：ITS2序列作为DNA条形码可以有效地鉴定药材桃仁及其近缘种,为其他中药及其近缘种的鉴定提供一定的参考依据。
- 林韵涵刘霞胡志刚孙伟邬兰张雅琴宋明张晓存
- 关键词：桃仁近缘种ITS2DNA条形码分子鉴定
- 鉴定不同产地的道地药材麦冬的方法,以及用于该方法的试剂盒
- 本发明涉及鉴定不同产地的道地药材麦冬的方法，以及用于该方法的试剂盒。具体地，本发明涉及鉴定浙麦冬和川麦冬的方法，其包括以下步骤：（1）从不同道地产区的麦冬样品中提取DNA样品；（2）鉴定如SEQ ID NO.1所示的核苷...
- 陈士林刘霞林韵涵马晓冲张雅琴宋明王俊
- 文献传递
